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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G588800
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 148136043-148139097 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2101 bp · TkA01G588800|TK1151|cDNA

AAAGCGCGTGCCTTAACTCGAATTGAACTTGGCAATAGGAAAAACACAAAGCAGAATTTGTGTCAGAACCCTTCCTACTTTCCCCTTATATCTCTATATGGATTGGATGCTTCCCCGCGAAACCCTCTCTACCTTCCACATACCCAAAATGGCTTGATCGGACTCTACAATTCGCAGCCGTCGATCGCCGTCTCCACCCGCCATCACCACCTACTGCTTACACGGCTAATCCGCCATGGAAGGTACCGATTCCGTTGCTA...

CDS

下载 CDS FASTA

1554 bp · TkA01G588800|TK1151|CDS

ATGGAAGGTACCGATTCCGTTGCTACACTCTTGGAGTCCACAAACTCCAAAATCCAACAACTTCAGAAAGCATTTGCTGAGCTAGAAAGTCACCGAGCTGTAACTCTCAACCTGAAATGGAAACAAATTGAAGAACATTTCCATGGCCTAGAGAAGTCCTTGAAGAGGCGCTTCACTGAACTAGAAGATCAAGAAAAGGAATTTGAAAACAAAACAATTCAAGCACAACAAGTTCTGGAAAAGCGTAGAGCTGCCGTTAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

517 aa · TkA01G588800|TK1151|PROTEIN

MEGTDSVATLLESTNSKIQQLQKAFAELESHRAVTLNLKWKQIEEHFHGLEKSLKRRFTELEDQEKEFENKTIQAQQVLEKRRAAVTAKEEASLIRLQEKRDVAVTAIANTISKHKTSHESEEHATAPMVDQKQPDMKTLFDNGDVKLLTNPQLAKLCEEMDAGGLHKFISDNRKNLASIKEEIPIALKASSNPGGFVLDSLSGFYIPEGSNLDGKKDANLLGLRRTCIMLMECLSILLLNLDANTVSKVISEDVKNRAK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G588800
TK1151 IDTkA01G588800
OH-1004 IDLXL04_000766
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G588800
位置Chr01:148136043-148139097 (+)
描述Similar to FRL3: FRIGIDA-like protein 3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g48385 FRIGIDA 样蛋白 3。 暂无已核实直接文献
UniProt: A0SWL0 参与开花时间的调控。 暂无已核实直接文献
At1g31814 非活性FRIGIDA样蛋白2。
FRIGIDA-related genes are required for the winter-annual habit in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1073/pnas.0306778101
FRIGIDA LIKE 2 is a functional allele in Landsberg erecta and compensates for a nonsense allele of FRIGIDA LIKE 1.2006 · DOI: 10.1104/pp.106.085571
At5g16320 对FRI介导的FLC转录上调是必需的，但与FRI不冗余，仅与FRL2部分冗余。
FRIGIDA-related genes are required for the winter-annual habit in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1073/pnas.0306778101
FRIGIDA LIKE 2 is a functional allele in Landsberg erecta and compensates for a nonsense allele of FRIGIDA LIKE 1.2006 · DOI: 10.1104/pp.106.085571
The FRIGIDA complex activates transcription of FLC, a strong flowering repressor in Arabidopsis, by recruiting chromatin modification factors.2011 · DOI: 10.1105/tpc.110.075911

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000766 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009908 flower development 生物过程
GO:0010228 vegetative to reproductive phase transition of meristem 生物过程
GO:0030154 cell differentiation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G31814
ath:AT3G22440
ath:AT4G14900
ath:AT5G48385
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.872
排名 1 · TkA01G588800 · TK1151
细胞质0.168
排名 2 · TkA01G588800 · TK1151
细胞膜0.066
排名 3 · TkA01G588800 · TK1151
内质网0.037
排名 4 · TkA01G588800 · TK1151
质体0.018
排名 5 · TkA01G588800 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF24481CT398_CC1-33 aa
PF27291AF_14576-62 aa
PF17419MauJ13-87 aa
PF20421DHR-2_Lobe_C14-63 aa
PF07899Frigida20-70 aa
PF27291AF_145735-80 aa
PF18822CdvA36-75 aa
PF13921Myb_DNA-bind_637-69 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G588800PF24481CT398_CC1330.0215.4
TkA01G588800PF27291AF_14576620.810.7
TkA01G588800PF17419MauJ13870.2113.0
TkA01G588800PF20421DHR-2_Lobe_C14630.03214.9
TkA01G588800PF07899Frigida20706.4e-106354.6
TkA01G588800PF27291AF_145735800.810.7
TkA01G588800PF18822CdvA36750.2312.1
TkA01G588800PF13921Myb_DNA-bind_637690.3711.7
TkA01G588800PF24481CT398_CC411190.0215.4
TkA01G588800PF13921Myb_DNA-bind_6871090.3711.7
TkA01G588800PF07899Frigida891206.4e-106354.6
TkA01G588800PF07899Frigida1514426.4e-106354.6
TkA01G588800PF27291AF_14572292630.810.7
TkA01G588800PF20421DHR-2_Lobe_C3273430.03214.9
TkA01G588800PF18822CdvA3924470.2312.1
TkA01G588800PF24481CT398_CC4224330.0215.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q67ZB3拟南芥sp|Q67ZB3|FRL3_ARATH FRIGIDA-like protein 350.000%Swiss-Prot高置信
A0SWL0拟南芥sp|A0SWL0|FRL2A_ARATH FRIGIDA-like protein 231.700%Swiss-Prot中等置信
Q9C6S2拟南芥sp|Q9C6S2|FRL2I_ARATH Inactive FRIGIDA-like protein 231.700%Swiss-Prot中等置信
Q9FFF1拟南芥sp|Q9FFF1|FRL1A_ARATH FRIGIDA-like protein 130.700%Swiss-Prot中等置信

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