基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA01G588800 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr01:148136043-148139097 (+) |
| 描述 | Similar to FRL3: FRIGIDA-like protein 3 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_000766 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 5 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g48385 |
FRIGIDA 样蛋白 3。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: A0SWL0 |
参与开花时间的调控。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g31814 |
非活性FRIGIDA样蛋白2。 | |
At5g16320 |
对FRI介导的FLC转录上调是必需的,但与FRI不冗余,仅与FRL2部分冗余。 |
FRIGIDA-related genes are required for the winter-annual habit in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1073/pnas.0306778101
|
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009908 | flower development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.477; 覆盖度=107.35; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010228 | vegetative to reproductive phase transition of meristem | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=31.975; 覆盖度=61.702; E 值=3.24e-41; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030154 | cell differentiation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.477; 覆盖度=107.35; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.477; 覆盖度=107.35; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009536 | plastid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.477; 覆盖度=107.35; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G31814 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=31.975; 覆盖度=61.702; E 值=3.24e-41 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G22440 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=30.242; 覆盖度=95.938; E 值=1.18e-50 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G14900 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=28.785; 覆盖度=103.482; E 值=1.8e-52 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G48385 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.477; 覆盖度=107.35; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |