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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G585380
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 147224416-147226071 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

886 bp · TkA01G585380|TK1151|cDNA

TAAAACCCTAGTCCTCTTACTCGCAGCCGTGAGAAGAAAATGGTGTCGCTGAAGCTACAGAAGAGGCTTGCCGCGAGCGTCCTCAAGTGCGGTAGAGGAAAGGTTTGGCTCGATCCCAATGAAGGGAATGAGATATCCATGGCCAACTCTCGTCAGAACATCAGAAAGTTGGTGAAGGATGGATTCATCATCAGGAAGCCAACGAAGATCCACTCTAGGTCAAGAGCTCGTCGCATGAAGGAGGCAAAGAGAAAGGGTCG...

CDS

下载 CDS FASTA

630 bp · TkA01G585380|TK1151|CDS

ATGGTGTCGCTGAAGCTACAGAAGAGGCTTGCCGCGAGCGTCCTCAAGTGCGGTAGAGGAAAGGTTTGGCTCGATCCCAATGAAGGGAATGAGATATCCATGGCCAACTCTCGTCAGAACATCAGAAAGTTGGTGAAGGATGGATTCATCATCAGGAAGCCAACGAAGATCCACTCTAGGTCAAGAGCTCGTCGCATGAAGGAGGCAAAGAGAAAGGGTCGTCACTCTGGATATGGTAAGCGAAAGGGTACCCGAGAGGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

209 aa · TkA01G585380|TK1151|PROTEIN

MVSLKLQKRLAASVLKCGRGKVWLDPNEGNEISMANSRQNIRKLVKDGFIIRKPTKIHSRSRARRMKEAKRKGRHSGYGKRKGTREARLPTKILWMRRMRVLRRLLRKYRESKKIDKHMYHDMYMKVKGNVFKNKRVLMESIHKSKAEKAREKTLSDQFEAKRAKNKASRERKLARREERLAQGPQERAPVAAVPAAAPPAQASKKSKK

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G585380
TK1151 IDTkA01G585380
OH-1004 IDLXL04_037129
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)99.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G585380
位置Chr01:147224416-147226071 (+)
描述Similar to RPL19B: 60S ribosomal protein L19-2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g02230 大核糖体亚基蛋白 eL19y。 暂无已核实直接文献
At1g02780 大核糖体亚基蛋白 eL19x。 暂无已核实直接文献
At3g16780 大核糖体亚基蛋白 eL19z。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_037129 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002181 cytoplasmic translation 生物过程
GO:0006412 translation 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005730 nucleolus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0022625 cytosolic large ribosomal subunit 细胞组分
GO:0022626 cytosolic ribosome 细胞组分
GO:0003723 RNA binding 分子功能
GO:0003729 mRNA binding 分子功能
GO:0003735 structural constituent of ribosome 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G02780
ath:AT3G16780
ath:AT4G02230
dme:Dmel_CG2746
rno:81767
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.897
排名 1 · TkA01G585380 · TK1151
细胞核0.226
排名 2 · TkA01G585380 · TK1151
内质网0.108
排名 3 · TkA01G585380 · TK1151
线粒体0.017
排名 4 · TkA01G585380 · TK1151
细胞膜0.014
排名 5 · TkA01G585380 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01280Ribosomal_L19e4-54 aa
PF12840HTH_2029-50 aa
PF25476Ribosomal_L19e_C56-146 aa
PF29832SOV1_middle93-168 aa
PF12840HTH_2098-108 aa
PF22901dsrm_Ferlin104-153 aa
PF04382SAB122-156 aa
PF20543CowN123-171 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G585380PF01280Ribosomal_L19e4542.9e-2795.0
TkA01G585380PF12840HTH_2029500.08413.6
TkA01G585380PF25476Ribosomal_L19e_C561464.1e-35120.6
TkA01G585380PF29832SOV1_middle931680.007517.0
TkA01G585380PF12840HTH_20981080.08413.6
TkA01G585380PF22901dsrm_Ferlin1041530.9310.7
TkA01G585380PF04382SAB1221560.09613.5
TkA01G585380PF20543CowN1231710.1213.6
TkA01G585380PF16228DUF48871412090.03215.1
TkA01G585380PF22901dsrm_Ferlin1451820.9310.7
TkA01G585380PF25476Ribosomal_L19e_C1691734.1e-35120.6
TkA01G585380PF04382SAB1711850.09613.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P49693拟南芥sp|P49693|RL193_ARATH Large ribosomal subunit protein eL19y85.900%Swiss-Prot高置信
Q9SRX2拟南芥sp|Q9SRX2|RL191_ARATH Large ribosomal subunit protein eL19x90.700%Swiss-Prot高置信
Q9LUQ6拟南芥sp|Q9LUQ6|RL192_ARATH Large ribosomal subunit protein eL19z91.400%Swiss-Prot高置信

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