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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G578270
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 145404290-145407825 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3444 bp · TkA01G578270|TK1151|cDNA

TTCTTCAAGATCTCAACACCCTGCTTTCTTTTTTAAATTTAAATTACAGAATTATTAATCTTTTCCCCATGTTATCCGCTTAACTGCTACTGCTTACTTATAATTTTATCACCACTTCACTTCCACTCATCTTTCTCCATCTAGATCCAAACACCAAAATGATCGAAATTTAACCCAATTTCAAAAAAACAGGCCCACCACCAACGCCGCCATGTCGAAACCCCATTTTCGGTTCTTCTTCTTTTTGTTGTTTTGCTTTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1413 bp · TkA01G578270|TK1151|CDS

ATGATGAGCACGCTCGCTGTTCTTGATCTGTCCAACAATTCCTTGACGGGAGGAATCCCAGAAAGCTTCGGGAATTCTCCGGCGTTAGAATCTCTGAATGTATCTTACAACAGACTTCAAGGCCCAGTGCCGGTGAACGGAATGCTAAGAACAATTAACCCCAGTGATCTCGTTGGAAACAGCGATCTATGTGGTAACATGCTCCCACCATGCACAGGGGATATGACTAACGATTCACATCACAAAGGCTTGCACACGAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

470 aa · TkA01G578270|TK1151|PROTEIN

MMSTLAVLDLSNNSLTGGIPESFGNSPALESLNVSYNRLQGPVPVNGMLRTINPSDLVGNSDLCGNMLPPCTGDMTNDSHHKGLHTKHVITGWVIGMSVVLAVFLTAFAGRALYSKWYTNGSCFEERFEMGKGEWPWRLMAFQKLSFSSYDILNCVKESNVIGMGATGVVYKAEIQRTNTIVAVKKLWSSKNDIELGSSAGDFVGEVNVLGKLRHRNIVRLLGFLHNDKNAMIVYEYMSNGSLGEALHGQARLLVDWVSR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G578270
TK1151 IDTkA01G578270
OH-1004 IDLXL04_000894
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 90.638 / OH-1004 41.888
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G578270
位置Chr01:145404290-145407825 (-)
描述Similar to MIK1: MDIS1-interacting receptor like kinase 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g28650 参与调控维管组织发育过程中原形成层的维持和极性。
A receptor heteromer mediates the male perception of female attractants in plants.2016 · DOI: 10.1038/nature16975
At1g08590 参与调控维管组织发育过程中原形成层的维持和极性。 暂无已核实直接文献
At5g61480 与CLE41p、CLE44p肽构成配体-受体对，参与维管组织发育中的信号转导，调控原形成层的维持及极性。 暂无已核实直接文献
At3g24240 与 RGI2、RGI3、RGI4 和 RGI5 一起，作为 RGF 肽（如 RGF1、GLV5/CLEL1/RGF2、GLV7/CLEL3/RGF3、GLV3/RGF4、GLV10/CLEL7/RGF5 和 RGF10/CLELN）的受体，这些肽激素通过调控转录因子 PLETHORA（PLT，例如 PLT1 和 PLT2）的表达水平和模式来维持胚后根干细胞的生态位。
RGF1 INSENSITIVE 1 to 5, a group of LRR receptor-like kinases, are essential for the perception of root meristem growth factor 1 in Arabidopsis thaliana.2016 · DOI: 10.1038/cr.2016.63
At1g34110 与 RGI1、RGI2、RGI3 和 RGI4 一起，作为 RGF1 的受体，RGF1 是一种通过调节转录因子 PLETHORA (PLT) 的表达水平和模式来维持胚后根干细胞区的肽激素。
RGF1 INSENSITIVE 1 to 5, a group of LRR receptor-like kinases, are essential for the perception of root meristem growth factor 1 in Arabidopsis thaliana.2016 · DOI: 10.1038/cr.2016.63

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000894 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0009755 hormone-mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009934 regulation of meristem structural organization 生物过程
GO:0010067 procambium histogenesis 生物过程
GO:0010075 regulation of meristem growth 生物过程
GO:0010087 phloem or xylem histogenesis 生物过程
GO:0010089 xylem development 生物过程
GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程
GO:0010223 secondary shoot formation 生物过程
GO:0030154 cell differentiation 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G08590
ath:AT3G49670
ath:AT4G28650
ath:AT5G61480
ath:AT5G65700
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.871
排名 1 · TkA01G578270 · TK1151
细胞质0.082
排名 2 · TkA01G578270 · TK1151
内质网0.073
排名 3 · TkA01G578270 · TK1151
细胞核0.055
排名 4 · TkA01G578270 · TK1151
高尔基体0.021
排名 5 · TkA01G578270 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13855LRR_82-39 aa
PF00560LRR_15-25 aa
PF12799LRR_45-39 aa
PF00560LRR_129-44 aa
PF00069Pkinase158-428 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr158-428 aa
PF03109ABC1162-185 aa
PF06734UL97261-322 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G578270PF13855LRR_82398.5e-0729.4
TkA01G578270PF00560LRR_15251.8e-0627.6
TkA01G578270PF12799LRR_45396.6e-0523.8
TkA01G578270PF00560LRR_129441.8e-0627.6
TkA01G578270PF00069Pkinase1584285.4e-50170.9
TkA01G578270PF07714PK_Tyr_Ser-Thr1584282.1e-44152.5
TkA01G578270PF03109ABC11621850.04913.5
TkA01G578270PF06734UL972613220.1511.9
TkA01G578270PF03109ABC12723150.04913.5
TkA01G578270PF01636APH2773090.3411.3
TkA01G578270PF12330Haspin_kinase2843180.1411.9
TkA01G578270PF00560LRR_14414501.8e-0627.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9M0G7拟南芥sp|Q9M0G7|MIK1_ARATH MDIS1-interacting receptor like kinase 169.500%Swiss-Prot高置信
Q9FRS6拟南芥sp|Q9FRS6|PXL1_ARATH Leucine-rich repeat receptor-like protein kinase PXL157.100%Swiss-Prot高置信
Q9FII5拟南芥sp|Q9FII5|TDR_ARATH Leucine-rich repeat receptor-like protein kinase TDR45.800%Swiss-Prot中等置信
Q9LHP4拟南芥sp|Q9LHP4|RGI1_ARATH LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase RGI139.900%Swiss-Prot中等置信
C0LGF5拟南芥sp|C0LGF5|RGI5_ARATH LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase RGI541.300%Swiss-Prot中等置信

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