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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G550470
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 138371444-138372581 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

495 bp · TkA01G550470|TK1151|cDNA

ATGGATCATGAGGTCCTACGCTTGTTACCGGAATGTAACCACGTGTTCCACCGTGGTTGCATAGATGAGTGGTTGGCTTTACGCGTTACCTGCCCTGTTTGTCGCGCAAGTTTGGTTCCAAAACCCAATAAACTCAGTCTACAGACTGATATGTATAGTGGCCCAAACGGGCCTACTAAAAGTCATGATTCGGTCGAATTGACTCATCTGACACATGATTTTTTTCTGATAGAAAATTGTCTCGTTCTTATTCAATGGGA...

CDS

下载 CDS FASTA

495 bp · TkA01G550470|TK1151|CDS

ATGGATCATGAGGTCCTACGCTTGTTACCGGAATGTAACCACGTGTTCCACCGTGGTTGCATAGATGAGTGGTTGGCTTTACGCGTTACCTGCCCTGTTTGTCGCGCAAGTTTGGTTCCAAAACCCAATAAACTCAGTCTACAGACTGATATGTATAGTGGCCCAAACGGGCCTACTAAAAGTCATGATTCGGTCGAATTGACTCATCTGACACATGATTTTTTTCTGATAGAAAATTGTCTCGTTCTTATTCAATGGGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

164 aa · TkA01G550470|TK1151|PROTEIN

MDHEVLRLLPECNHVFHRGCIDEWLALRVTCPVCRASLVPKPNKLSLQTDMYSGPNGPTKSHDSVELTHLTHDFFLIENCLVLIQWDICLRNDILKMSIDTRYGYQRMLKRMLRQFELFSPLSWAVGLGQWFATSHDNLEDKTVEASTRLMPMTASTDRFRVRN

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G550470
TK1151 IDTkA01G550470
OH-1004 IDLXL04_001260
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)96.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 31.098 / OH-1004 13.600
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G550470
位置Chr01:138371444-138372581 (-)
描述Similar to FAX2: Protein FATTY ACID EXPORT 2, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g35330 RING-H2 指蛋白 ATL34。 暂无已核实直接文献
At1g22500 E3泛素蛋白连接酶，能够在体外催化泛素结合酶E2 UBC8、UBC10、UBC11、UBC28和UBC29的多泛素化。 暂无已核实直接文献
At4g40070 RING-H2指蛋白ATL32。 暂无已核实直接文献
At5g06490 推测的RING-H2指蛋白 ATL71。 暂无已核实直接文献
At2g35910 RING-H2 锌指蛋白 ATL70。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_001260 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006783 heme biosynthetic process 生物过程
GO:0006839 mitochondrial transport 生物过程
GO:0015908 fatty acid transport 生物过程
GO:0070453 regulation of heme biosynthetic process 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005743 mitochondrial inner membrane 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0009706 chloroplast inner membrane 细胞组分
GO:0009941 chloroplast envelope 细胞组分
GO:0031966 mitochondrial membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G26240
ath:AT3G43520
hsa:51522
pon:100190858
rno:171432
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.467
排名 1 · TkA01G550470 · TK1151
细胞质0.409
排名 2 · TkA01G550470 · TK1151
线粒体0.115
排名 3 · TkA01G550470 · TK1151
细胞膜0.091
排名 4 · TkA01G550470 · TK1151
内质网0.068
排名 5 · TkA01G550470 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13639zf-RING_24-35 aa
PF17123zf-RING_114-21 aa
PF13920zf-C3HC4_37-37 aa
PF12678zf-rbx19-35 aa
PF12861zf-ANAPC119-38 aa
PF14634zf-RING_59-35 aa
PF13445zf-RING_UBOX9-32 aa
PF17120zf-RING_169-32 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G550470PF13639zf-RING_24351.2e-0939.0
TkA01G550470PF17123zf-RING_114210.0003121.1
TkA01G550470PF13920zf-C3HC4_37370.02715.0
TkA01G550470PF12678zf-rbx19354.4e-0937.2
TkA01G550470PF12861zf-ANAPC119384.6e-0524.1
TkA01G550470PF14634zf-RING_59350.0006820.3
TkA01G550470PF13445zf-RING_UBOX9320.00119.8
TkA01G550470PF17120zf-RING_169320.006416.8
TkA01G550470PF00097zf-C3HC410341.2e-0525.7
TkA01G550470PF11793FANCL_C10260.2612.3
TkA01G550470PF13923zf-C3HC4_211341.8e-0628.4
TkA01G550470PF11789zf-Nse11340.01415.9
TkA01G550470PF23413zf_RING_Vps8_fungal11220.07313.1
TkA01G550470PF23555zf-RING_Vps4111230.1112.8
TkA01G550470PF08746zf-RING-like11340.212.5
TkA01G550470PF17122zf-C3H2C312340.2312.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9C7I1拟南芥sp|Q9C7I1|ATL34_ARATH RING-H2 finger protein ATL3460.800%Swiss-Prot低置信
Q9SK92拟南芥sp|Q9SK92|ATL15_ARATH E3 ubiquitin-protein ligase ATL1562.800%Swiss-Prot低置信
Q8W571拟南芥sp|Q8W571|ATL32_ARATH RING-H2 finger protein ATL3262.800%Swiss-Prot低置信
Q9FG21拟南芥sp|Q9FG21|ATL71_ARATH Putative RING-H2 finger protein ATL7156.400%Swiss-Prot低置信
Q8RX29拟南芥sp|Q8RX29|ATL70_ARATH RING-H2 finger protein ATL7063.200%Swiss-Prot低置信

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