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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G547290
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 137468560-137469087 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

528 bp · TkA01G547290|TK1151|cDNA

ATGGAACGAACAGATTTGCAGAGCAATAATAAACAAAGCACCACTGCTCCCACCTCCAACACTAGTTCTTCTCACCACCACCACCACCATCACCTCTCCCACCACCTCCACCACCAACCCATGGTGGTCCCATTTGATGCTCGATCTGGAACCCCATTCATGGGCTCCATATCCATCCAACCCGGTCCATCTACCACTCCTACTACTACTAGTGGAGCTTCTTCTTCTCTTTCTTCTCCTTCTAACCAACACCCAACAAC...

CDS

下载 CDS FASTA

528 bp · TkA01G547290|TK1151|CDS

ATGGAACGAACAGATTTGCAGAGCAATAATAAACAAAGCACCACTGCTCCCACCTCCAACACTAGTTCTTCTCACCACCACCACCACCATCACCTCTCCCACCACCTCCACCACCAACCCATGGTGGTCCCATTTGATGCTCGATCTGGAACCCCATTCATGGGCTCCATATCCATCCAACCCGGTCCATCTACCACTCCTACTACTACTAGTGGAGCTTCTTCTTCTCTTTCTTCTCCTTCTAACCAACACCCAACAAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

175 aa · TkA01G547290|TK1151|PROTEIN

MERTDLQSNNKQSTTAPTSNTSSSHHHHHHHLSHHLHHQPMVVPFDARSGTPFMGSISIQPGPSTTPTTTSGASSSLSSPSNQHPTTSSATQLSPPHPHLVDASLAIATRSEALADLPKENPQPVAAVPPKRSTKDRHTKVDGRGRRIRMPATCAARVFQLTRELGHKSDGGRNN

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G547290
TK1151 IDTkA01G547290
OH-1004 IDLXL04_026783
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)71.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 37.143 / OH-1004 24.265
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G547290
位置Chr01:137468560-137469087 (-)
描述Similar to TCP9: Transcription factor TCP9
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g58100 可以特异性结合 PP438/PNM1 启动子区域的位点 II 元件。
An Arabidopsis dual-localized pentatricopeptide repeat protein interacts with nuclear proteins involved in gene expression regulation.2011 · DOI: 10.1105/tpc.110.081638
At3g47620 转录因子，参与植物发育的调控。
Transcription factor AtTCP14 regulates embryonic growth potential during seed germination in Arabidopsis thaliana.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03308.x
TCP14 and TCP15 affect internode length and leaf shape in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2011.04674.x
Arabidopsis thaliana DOF6 negatively affects germination in non-after-ripened seeds and interacts with TCP14.2012 · DOI: 10.1093/jxb/err388
The Arabidopsis O-linked N-acetylglucosamine transferase SPINDLY interacts with class I TCPs to facilitate cytokinin responses in leaves and flowers.2012 · DOI: 10.1105/tpc.111.093518
The Arabidopsis immune adaptor SRFR1 interacts with TCP transcription factors that redundantly contribute to effector-triggered immunity.2014 · DOI: 10.1111/tpj.12527
The ubiquitin receptors DA1, DAR1, and DAR2 redundantly regulate endoreduplication by modulating the stability of TCP14/15 in Arabidopsis.2015 · DOI: 10.1105/tpc.114.132274
Pseudomonas syringae Type III Effector HopBB1 Promotes Host Transcriptional Repressor Degradation to Regulate Phytohormone Responses and Virulence.2017 · DOI: 10.1016/j.chom.2017.01.003
ORANGE Represses Chloroplast Biogenesis in Etiolated Arabidopsis Cotyledons via Interaction with TCP14.2019 · DOI: 10.1105/tpc.18.00290
At2g45680 转录因子 TCP9。 暂无已核实直接文献
At1g72010 转录因子 TCP22。 暂无已核实直接文献
At5g51910 转录因子 TCP19。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026783 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0007623 circadian rhythm 生物过程
GO:0008361 regulation of cell size 生物过程
GO:0009624 response to nematode 生物过程
GO:0009735 response to cytokinin 生物过程
GO:0010229 inflorescence development 生物过程
GO:0031347 regulation of defense response 生物过程
GO:0031540 regulation of anthocyanin biosynthetic process 生物过程
GO:0042023 DNA endoreduplication 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0048364 root development 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G69690
ath:AT2G45680
ath:AT5G51910
dosa:Os08g0544800
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.921
排名 1 · TkA01G547290 · TK1151
细胞质0.195
排名 2 · TkA01G547290 · TK1151
细胞膜0.022
排名 3 · TkA01G547290 · TK1151
线粒体0.020
排名 4 · TkA01G547290 · TK1151
内质网0.009
排名 5 · TkA01G547290 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03634TCP8-38 aa
PF03634TCP133-171 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G547290PF03634TCP8381.5e-1558.8
TkA01G547290PF03634TCP1331711.5e-1558.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9C518拟南芥sp|Q9C518|TCP8_ARATH Transcription factor TCP868.500%Swiss-Prot低置信
Q93Z00拟南芥sp|Q93Z00|TCP14_ARATH Transcription factor TCP1467.700%Swiss-Prot低置信
O64647拟南芥sp|O64647|TCP9_ARATH Transcription factor TCP980.000%Swiss-Prot低置信
Q9C7G4拟南芥sp|Q9C7G4|TCP22_ARATH Transcription factor TCP2292.700%Swiss-Prot低置信
Q9LT89拟南芥sp|Q9LT89|TCP19_ARATH Transcription factor TCP1984.300%Swiss-Prot低置信

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