TkA01G542640 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA01G542640

当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 136156813-136158578 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

990 bp · TkA01G542640|TK1151|cDNA

ATGAAAGAACGGTGTAAGGATAATTCAGGGGCGATATCGTCCAAAAGCAAACGTAAAACAAACGTCGTTAAACAAAAATCATGTATGGATATTTTCGAAGGTCATAAAAGCTACTATTTGATGCTTAACCTGCAACTAGGTATCAGGTACACAGTTGGAAAGATTACACCAGTTCCTACGTGTGAAGTCAGATCTTCTGATTTTGGGGCACGTGCCAGAATAAAGGTGTATTTTCCCAGGAAAGGCTCGCAATTTACGCC...

CDS

下载 CDS FASTA

990 bp · TkA01G542640|TK1151|CDS

ATGAAAGAACGGTGTAAGGATAATTCAGGGGCGATATCGTCCAAAAGCAAACGTAAAACAAACGTCGTTAAACAAAAATCATGTATGGATATTTTCGAAGGTCATAAAAGCTACTATTTGATGCTTAACCTGCAACTAGGTATCAGGTACACAGTTGGAAAGATTACACCAGTTCCTACGTGTGAAGTCAGATCTTCTGATTTTGGGGCACGTGCCAGAATAAAGGTGTATTTTCCCAGGAAAGGCTCGCAATTTACGCC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

329 aa · TkA01G542640|TK1151|PROTEIN

MKERCKDNSGAISSKSKRKTNVVKQKSCMDIFEGHKSYYLMLNLQLGIRYTVGKITPVPTCEVRSSDFGARARIKVYFPRKGSQFTPPHYSVDFRWKDYCPMVFRNLREMFKLDAAEYMMSICGDDGLRELSSPGKSGSLFYLSHDDRFVIKTLRKSELKVLLKMLHSYYEHVKKYDNTLITKFFGLHEITLRGGKKVQFVVMGNMFKTELRIHRRYDLKGSYQGRFTNKDYMDEGTTLKDLDLEYEFHMDKSLREALFE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA01G542640`
TK1151 ID	TkA01G542640
OH-1004 ID	LXL04_001364
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	87.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 98.784 / OH-1004 21.382 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA01G542640

位置 Chr01:136156813-136158578 (-)

描述 Similar to PIP5K8: Phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase 8

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g10900`	磷脂酰肌醇4-磷酸5-激酶7。	暂无已核实直接文献
`At1g60890`	磷脂酰肌醇4-磷酸5-激酶8。	暂无已核实直接文献
`At3g09920`	在糖介导的根发育中发挥作用。	PIP5K9, an Arabidopsis phosphatidylinositol monophosphate kinase, interacts with a cytosolic invertase to negatively regulate sugar-mediated root growth.2007 · DOI: 10.1105/tpc.106.045658
`At2g26420`	与 DRP1A 和 DRP2B 相关，在极性 ARAC3/ROP6 和 ARAC4/ROP2 的精确定位以及随后在根毛形成细胞中平面极性形成过程中的根毛定位中必需，可能通过介导 D6PK 从基底到平面极性的正确转换进入极性富脂质区域。	Arabidopsis D6PK is a lipid domain-dependent mediator of root epidermal planar polarity.2015 · DOI: 10.1038/nplants.2015.162

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os03g0701800`	参与开花。	OsPIPK 1, a rice phosphatidylinositol monophosphate kinase, regulates rice heading by modifying the expression of floral induction genes.2004 · DOI: 10.1023/b:plan.0000028796.14336.24

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_001364 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0046854 phosphatidylinositol phosphate biosynthetic process 生物过程

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0005524 ATP binding 分子功能

GO:0016308 1-phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G10900

ath:AT1G60890

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.522

排名 1 · TkA01G542640 · TK1151

细胞膜0.392

排名 2 · TkA01G542640 · TK1151

细胞核0.226

排名 3 · TkA01G542640 · TK1151

内质网0.067

排名 4 · TkA01G542640 · TK1151

高尔基体0.067

排名 5 · TkA01G542640 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01504PIP5K122-294 aa

PF10306FLILHELTA160-191 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA01G542640	`PF01504`	PIP5K	122	294	1.9e-70	238.1
TkA01G542640	`PF10306`	FLILHELTA	160	191	0.25	12.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9SUI2`	拟南芥	sp\|Q9SUI2\|PI5K7_ARATH Phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase 7	75.200%	Swiss-Prot	高置信
`Q8RY89`	拟南芥	sp\|Q8RY89\|PI5K8_ARATH Phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase 8	75.100%	Swiss-Prot	高置信
`Q8L850`	拟南芥	sp\|Q8L850\|PI5K9_ARATH Phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase 9	67.500%	Swiss-Prot	高置信
`O48709`	拟南芥	sp\|O48709\|PI5K3_ARATH Phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase 3	58.800%	Swiss-Prot	高置信
`Q6EX42`	水稻	sp\|Q6EX42\|PI5K1_ORYSJ Phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase 1	75.500%	Swiss-Prot	高置信

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