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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G535520
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 134392147-134394482 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1522 bp · TkA01G535520|TK1151|cDNA

GTACAGGGAGTCGAACTGTTTAATTGTAAAACATCCTTATCCTCTTCCTCACTACCAGAGAAAATGTATGTGGTGGGAGTACCAGCCTGCTAACGATGATGCCAATTTTGTGCAGCCAAAGGCTATGGGGTCTGGCCTTCATCTCCAAAACACCCACAATTTCACCAGGTTTTCCCCAATCGTTTCGTTGTCCGGTAACTTAAAAACTTCACCATGGTGTTGCTTTACCACTCGATTATACTTCAACGGGACTCATACAC...

CDS

下载 CDS FASTA

714 bp · TkA01G535520|TK1151|CDS

ATGATCGGCAGCCGATCCCTCACCCTGACTACTGCTTTAGCATTCCTTGGTTTGGGATGCATAGGACTTGTTTGGGCATCCATGGAAGCTGGAAATATTAGGTCAATCTTGCTACTAGCTTCTGCCATTACTTGTGGTTACATATATCAGTGTCCGCCATTCCGGTTGAGTTACCGTGGTCTAGGAGAACCGTTATGCTTTGCAGCATTCGGTCCTTTTGCCACCACAGCTTTTTACTTATTACAAAGTAGTAGAAGTAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

237 aa · TkA01G535520|TK1151|PROTEIN

MIGSRSLTLTTALAFLGLGCIGLVWASMEAGNIRSILLLASAITCGYIYQCPPFRLSYRGLGEPLCFAAFGPFATTAFYLLQSSRSTTKLKMLPITNTILSASVLVGITTSLILFCSHFHQIDDDKAVGKLSPLVRIGTETGSNVVKVAVISLYSLLVLSGICRSLPFTSIFLCAVTVPMGKVVVSFIEDNHRDKTKIFMGKYFCVRLHALFGVALSVGMVAARILTRNNVPQPVFT

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G535520
TK1151 IDTkA01G535520
OH-1004 IDLXL04_001436
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)98.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 57.524
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G535520
位置Chr01:134392147-134394482 (-)
描述Similar to ABC4: 2-carboxy-1,4-naphthoquinone phytyltransferase, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g60600 参与叶绿醌（维生素K1）的合成。
Inactivation and deficiency of core proteins of photosystems I and II caused by genetical phylloquinone and plastoquinone deficiency but retained lamellar structure in a T-DNA mutant of Arabidopsis.2005 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2004.02326.x

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_001436 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006744 ubiquinone biosynthetic process 生物过程
GO:0009234 menaquinone biosynthetic process 生物过程
GO:0009772 photosynthetic electron transport in photosystem II 生物过程
GO:0010236 plastoquinone biosynthetic process 生物过程
GO:0042371 vitamin K biosynthetic process 生物过程
GO:0042372 phylloquinone biosynthetic process 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0031969 chloroplast membrane 细胞组分
GO:0004659 prenyltransferase activity 分子功能
GO:0046428 1,4-dihydroxy-2-naphthoate polyprenyltransferase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G60600
syn:slr1518
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.668
排名 1 · TkA01G535520 · TK1151
细胞质0.111
排名 2 · TkA01G535520 · TK1151
细胞核0.106
排名 3 · TkA01G535520 · TK1151
线粒体0.104
排名 4 · TkA01G535520 · TK1151
细胞膜0.075
排名 5 · TkA01G535520 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01040UbiA5-199 aa
PF20394DUF66889-48 aa
PF12046CCB110-49 aa
PF12046CCB165-93 aa
PF20394DUF668869-222 aa
PF12046CCB1157-177 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G535520PF01040UbiA51998.8e-1555.4
TkA01G535520PF20394DUF66889480.6310.3
TkA01G535520PF12046CCB110490.799.8
TkA01G535520PF12046CCB165930.799.8
TkA01G535520PF20394DUF6688692220.6310.3
TkA01G535520PF12046CCB11571770.799.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q0WUA3拟南芥sp|Q0WUA3|MENA_ARATH 2-carboxy-1,4-naphthoquinone phytyltransferase, chloroplastic62.500%Swiss-Prot高置信

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