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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G482360
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 120773594-120776383 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2709 bp · TkA01G482360|TK1151|cDNA

AAACAACTACTTCTTCTGTGTAGCGGCTGCGAAGGATTTCATCCCTCTTTCTCTATCGTCTCTCCGAGAACCTTATCACCAATCTCTCTCTCTTTATCTAAATCCTTATCCCCAATTTCACACACTATCATAAACCCTAGTTATCCAATTCATTATACTTGCATCGAGTTCACGTAGTACGAGTATTGGTGTAGTTCAGAATCCATGGACTCGAAGGAAGATACGTCTCTCTCAGGTTTTTCTTCTGTTTCTTCCGATAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1872 bp · TkA01G482360|TK1151|CDS

ATGAAGTTAAATCTGGTACTCCTGAAGAAGGAGAGAAAGAGGTGGTTTGTTGCCAATGGTGTGAAGCTTACTCCAGAAGGAGATGCGGTTGTGGAAGAAATAAAAGTTGATACACCTGTACCAGGTGTTGCTGTAGTTTCTAATATAGAAGATGTTGAGGAAGACGATGAGGATGAAGAAGTGCTTCTAGTTGGTGGCCCCGATGACACTAATTCTGTTGTTGAAGAACCTGAATTAGAATCTTTTGGTGCAGATGATGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

623 aa · TkA01G482360|TK1151|PROTEIN

MKLNLVLLKKERKRWFVANGVKLTPEGDAVVEEIKVDTPVPGVAVVSNIEDVEEDDEDEEVLLVGGPDDTNSVVEEPELESFGADDVKITSDLESVGANDVKITSESDSVVEAVDVDLPVAGVPGVAVVTKTEEDGGVVADESGFSEKLDRVIEEVVDKEVVEVTDGKFSPLVEGSVVDDDDTEKNEKNPEAEIEKEVDYEVKQNGPVVKTALDDVADMSTTNLASDTTQAPESLDKDTPDEPQVTEVLDKDLPDDADGK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G482360
TK1151 IDTkA01G482360
OH-1004 IDLXL04_037059
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)95.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 95.827 / OH-1004 43.759
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G482360
位置Chr01:120773594-120776383 (+)
描述Similar to TOC159: Translocase of chloroplast 159, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g02510 GTPase 参与蛋白质前体导入叶绿体。
The major protein import receptor of plastids is essential for chloroplast biogenesis.2000 · DOI: 10.1038/35003214
Dimerization of Toc-GTPases at the chloroplast protein import machinery.2003 · DOI: 10.1074/jbc.m305946200
The roles of toc34 and toc75 in targeting the toc159 preprotein receptor to chloroplasts.2003 · DOI: 10.1074/jbc.m307873200
Functional specialization amongst the Arabidopsis Toc159 family of chloroplast protein import receptors.2004 · DOI: 10.1105/tpc.104.023309
AtToc90, a new GTP-binding component of the Arabidopsis chloroplast protein import machinery.2004 · DOI: 10.1023/b:plan.0000036374.92546.51
Deletion of core components of the plastid protein import machinery causes differential arrest of embryo development in Arabidopsis thaliana.2006 · DOI: 10.1055/s-2005-873044
At2g16640 GTPase 参与蛋白质前体导入叶绿体。
Functional specialization amongst the Arabidopsis Toc159 family of chloroplast protein import receptors.2004 · DOI: 10.1105/tpc.104.023309
Deletion of core components of the plastid protein import machinery causes differential arrest of embryo development in Arabidopsis thaliana.2006 · DOI: 10.1055/s-2005-873044
At3g16620 GTPase 参与蛋白质前体导入叶绿体。
Functional specialization amongst the Arabidopsis Toc159 family of chloroplast protein import receptors.2004 · DOI: 10.1105/tpc.104.023309

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_037059 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0045036 protein targeting to chloroplast 生物过程
GO:0045037 protein import into chloroplast stroma 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0009707 chloroplast outer membrane 细胞组分
GO:0009941 chloroplast envelope 细胞组分
GO:0061927 TOC-TIC supercomplex I 细胞组分
GO:0003924 GTPase activity 分子功能
GO:0004888 transmembrane signaling receptor activity 分子功能
GO:0004930 G protein-coupled receptor activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G16640
ath:AT3G16620
ath:AT4G02510
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.370
排名 1 · TkA01G482360 · TK1151
细胞核0.260
排名 2 · TkA01G482360 · TK1151
内质网0.233
排名 3 · TkA01G482360 · TK1151
细胞膜0.143
排名 4 · TkA01G482360 · TK1151
高尔基体0.141
排名 5 · TkA01G482360 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02421FeoB_N109-159 aa
PF13191AAA_16402-414 aa
PF00735Septin551-586 aa
PF04548AIG1554-609 aa
PF02421FeoB_N554-609 aa
PF13191AAA_16554-573 aa
PF01926MMR_HSR1555-610 aa
PF03193RsgA_GTPase555-583 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G482360PF02421FeoB_N1091590.04813.9
TkA01G482360PF13191AAA_164024140.06114.6
TkA01G482360PF00735Septin5515860.004816.9
TkA01G482360PF04548AIG15546096.5e-0936.1
TkA01G482360PF02421FeoB_N5546090.04813.9
TkA01G482360PF13191AAA_165545730.06114.6
TkA01G482360PF01926MMR_HSR15556101.8e-0731.9
TkA01G482360PF03193RsgA_GTPase5555830.04914.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O81283拟南芥sp|O81283|TC159_ARATH Translocase of chloroplast 159, chloroplastic56.500%Swiss-Prot低置信
Q9SLF3拟南芥sp|Q9SLF3|TC132_ARATH Translocase of chloroplast 132, chloroplastic46.900%Swiss-Prot低置信
Q9LUS2拟南芥sp|Q9LUS2|TC120_ARATH Translocase of chloroplast 120, chloroplastic49.200%Swiss-Prot低置信

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