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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G460870
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 115468076-115470544 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1349 bp · TkA01G460870|TK1151|cDNA

CAAAACTTGAGGACTTCAGCCTTAAAAAAAAACCAATTCGCTCTTCGAGGAGCAGGACTCAGGAAGACAGGAACGATCATTCTCCTTCGTCGATTGTTTCTAGGGTTCTCCATTGCAGTAGTATCAATGGAATCGACAACAGCAAACGATCCGATGATCGACACTAACAACGACGAAGAATCTACGCTGCTGACTATCCTCGACGCCTCCAGCTATCAGCTCCATGATCTCGACTCAATCGAGTTACCGCCGACCCTCAT...

CDS

下载 CDS FASTA

1128 bp · TkA01G460870|TK1151|CDS

CAAAACTTGAGGACTTCAGCCTTAAAAAAAAACCAATTCGCTCTTCGAGGAGCAGGACTCAGGAAGACAGGAACGATCATTCTCCTTCGTCGATTGTTTCTAGGGTTCTCCATTGCAGTAGTATCAATGGAATCGACAACAGCAAACGATCCGATGATCGACACTAACAACGACGAAGAATCTACGCTGCTGACTATCCTCGACGCCTCCAGCTATCAGCTCCATGATCTCGACTCAATCGAGTTACCGCCGACCCTCAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

375 aa · TkA01G460870|TK1151|PROTEIN

QNLRTSALKKNQFALRGAGLRKTGTIILLRRLFLGFSIAVVSMESTTANDPMIDTNNDEESTLLTILDASSYQLHDLDSIELPPTLIEIDLTANRLTKLDSRISHLSSLKKLSLRQNLFNDSGVEPISQWNTISGLEELVLRDNQLKKIPDVSIFKTLLVFDVSFNEITSMSGLSNASSTLKELYVSKNEVTKIEEIEHFHQLQILELGSNRLRVIENLQNLTKLQELWLGRNRIKSINLCGLKCIKKLSLQSNRLTSMK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G460870
TK1151 IDTkA01G460870
OH-1004 IDLXL04_002501
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 91.733 / OH-1004 98.006
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G460870
位置Chr01:115468076-115470544 (-)
描述Similar to At5g19680: Protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit PPP1R7 homolog
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g19680 蛋白质磷酸酶 1 (PP1) 抑制剂。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_002501 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007059 chromosome segregation 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0034504 protein localization to nucleus 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005694 chromosome 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0070062 extracellular exosome 细胞组分
GO:0004864 protein phosphatase inhibitor activity 分子功能
GO:0019888 protein phosphatase regulator activity 分子功能
GO:0030234 enzyme regulator activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G19680
ddi:DDB_G0284039
hsa:5510
mmu:66385
pon:100171414
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.552
排名 1 · TkA01G460870 · TK1151
细胞质0.536
排名 2 · TkA01G460870 · TK1151
线粒体0.051
排名 3 · TkA01G460870 · TK1151
细胞膜0.037
排名 4 · TkA01G460870 · TK1151
内质网0.030
排名 5 · TkA01G460870 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF29460LRR_NXF255-117 aa
PF24048LRR_NXF1-562-115 aa
PF12799LRR_464-82 aa
PF00560LRR_164-76 aa
PF25013LRR_Zer-164-115 aa
PF12799LRR_484-119 aa
PF13516LRR_684-97 aa
PF24048LRR_NXF1-584-147 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G460870PF29460LRR_NXF2551173.6e-0524.3
TkA01G460870PF24048LRR_NXF1-5621151.3e-0732.1
TkA01G460870PF12799LRR_464821.4e-36124.4
TkA01G460870PF00560LRR_164762.3e-1142.2
TkA01G460870PF25013LRR_Zer-1641153.88.4
TkA01G460870PF12799LRR_4841191.4e-36124.4
TkA01G460870PF13516LRR_684971e-0938.4
TkA01G460870PF24048LRR_NXF1-5841471.3e-0732.1
TkA01G460870PF13855LRR_8851198.7e-2380.6
TkA01G460870PF00560LRR_1861042.3e-1142.2
TkA01G460870PF23211LRR_LRWD1861490.02315.1
TkA01G460870PF14580LRR_9891772.6e-1350.6
TkA01G460870PF23598LRR_14901170.0001821.1
TkA01G460870PF23952LRR_EndoS1031666.5e-0523.9
TkA01G460870PF13516LRR_61051281e-0938.4
TkA01G460870PF25013LRR_Zer-11051843.88.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q84WJ9拟南芥sp|Q84WJ9|PP1R7_ARATH Protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit PPP1R7 homolog77.700%Swiss-Prot高置信

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