TkA01G444900 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA01G444900

当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 111349118-111351569 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1497 bp · TkA01G444900|TK1151|cDNA

ATGGCAGTCATCTTCTCCAAGATAGGCATCATCGGAGGTGGCATAAGTGGGTTAGCCGCCGCCAAACAGCTTTCCAAACACAATCCAATGGTATTTGAGGCCACCGATTCCATTGGTGGTGTTTGGAAGCACTGCACCTTCAGAACAACAAAACTTCAAACACCTCGTTGTGACTATCAATTCTCCGATTACCCTTGGGCACAAACAGATGATAATTCCAGTTTCCCATCATATGCCGAAATACTTGATTATCTCGACTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1497 bp · TkA01G444900|TK1151|CDS

ATGGCAGTCATCTTCTCCAAGATAGGCATCATCGGAGGTGGCATAAGTGGGTTAGCCGCCGCCAAACAGCTTTCCAAACACAATCCAATGGTATTTGAGGCCACCGATTCCATTGGTGGTGTTTGGAAGCACTGCACCTTCAGAACAACAAAACTTCAAACACCTCGTTGTGACTATCAATTCTCCGATTACCCTTGGGCACAAACAGATGATAATTCCAGTTTCCCATCATATGCCGAAATACTTGATTATCTCGACTC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

498 aa · TkA01G444900|TK1151|PROTEIN

MAVIFSKIGIIGGGISGLAAAKQLSKHNPMVFEATDSIGGVWKHCTFRTTKLQTPRCDYQFSDYPWAQTDDNSSFPSYAEILDYLDSYANHFDLFKFINFDSKVTEINLSSGKPMWEVAVHNTKCKLQWYAFEFIVVCTGKYGDIPIIPKFPMKKGPEVFKGKVMHSQDYSKLNTQESVELLKGKKVVVVGYKKSAIDLAVECAEANEGEEGKACTMVVRTLHWTVPHYSIWGLPFYLFYSTRFSQFFHQRPNQGIFRDL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA01G444900`
TK1151 ID	TkA01G444900
OH-1004 ID	LXL04_002284
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	96.500
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA01G444900

位置 Chr01:111349118-111351569 (+)

描述 Similar to FMO1: Probable flavin-containing monooxygenase 1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g19250`	建立系统性获得性耐药性所需的。	The Arabidopsis flavin-dependent monooxygenase FMO1 is an essential component of biologically induced systemic acquired resistance.2006 · DOI: 10.1104/pp.106.081257 A role for a flavin-containing mono-oxygenase in resistance against microbial pathogens in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2006.02813.x
`At5g45180`	推测含黄素的单加氧酶 2。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_002284 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006629 lipid metabolic process 生物过程

GO:0006805 xenobiotic metabolic process 生物过程

GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程

GO:0009627 systemic acquired resistance 生物过程

GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程

GO:0050832 defense response to fungus 生物过程

GO:0051707 response to other organism 生物过程

GO:0062034 L-pipecolic acid biosynthetic process 生物过程

GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程

GO:0090181 regulation of cholesterol metabolic process 生物过程

GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分

GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G19250

ath:AT5G45180

cpoc:100135521

hsa:2330

ocu:100009064

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.315

排名 1 · TkA01G444900 · TK1151

细胞质0.302

排名 2 · TkA01G444900 · TK1151

线粒体0.175

排名 3 · TkA01G444900 · TK1151

细胞膜0.111

排名 4 · TkA01G444900 · TK1151

细胞核0.103

排名 5 · TkA01G444900 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01946Thi46-42 aa

PF00743FMO-like7-472 aa

PF07992Pyr_redox_27-204 aa

PF01266DAO8-67 aa

PF13738Pyr_redox_310-230 aa

PF13450NAD_binding_810-59 aa

PF13454NAD_binding_910-51 aa

PF01593Amino_oxidase15-40 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA01G444900	`PF01946`	Thi4	6	42	0.032	14.2
TkA01G444900	`PF00743`	FMO-like	7	472	1.2e-42	146.8
TkA01G444900	`PF07992`	Pyr_redox_2	7	204	5.9e-07	29.9
TkA01G444900	`PF01266`	DAO	8	67	2.3e-07	31.4
TkA01G444900	`PF13738`	Pyr_redox_3	10	230	3.9e-14	53.3
TkA01G444900	`PF13450`	NAD_binding_8	10	59	1.7e-07	32.1
TkA01G444900	`PF13454`	NAD_binding_9	10	51	0.013	16.2
TkA01G444900	`PF01593`	Amino_oxidase	15	40	0.00097	19.2
TkA01G444900	`PF13434`	Lys_Orn_oxgnase	74	357	1.4e-10	41.5
TkA01G444900	`PF01593`	Amino_oxidase	98	124	0.00097	19.2
TkA01G444900	`PF01266`	DAO	101	167	2.3e-07	31.4
TkA01G444900	`PF13738`	Pyr_redox_3	337	360	3.9e-14	53.3
TkA01G444900	`PF07992`	Pyr_redox_2	337	363	5.9e-07	29.9
TkA01G444900	`PF13454`	NAD_binding_9	339	356	0.013	16.2
TkA01G444900	`PF01946`	Thi4	342	359	0.032	14.2
TkA01G444900	`PF01266`	DAO	343	372	2.3e-07	31.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9LMA1`	拟南芥	sp\|Q9LMA1\|FMO1_ARATH Probable flavin-containing monooxygenase 1	64.400%	Swiss-Prot	高置信
`Q9FKE7`	拟南芥	sp\|Q9FKE7\|FMO2_ARATH Putative flavin-containing monooxygenase 2	56.200%	Swiss-Prot	高置信

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