基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_002284
当前版本: OH-1004
染色体: Chr01
坐标: 45256079-45258523
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1536 bp · LXL04_002284|LXL04_002284|OH1004|cDNA
ATGGCAGTCATCTTCTCCAAGATAGGCATCATCGGAGGTGGCATAAGTGGGTTAGCCGCCGCCAAACAGCTTTCCAAACACAATCCAATGGTATTTGAGGCCACCGATTCCATTGGTGGTGTTTGGAAGCACTGCACCTTCAGAACAACAAAACTTCAAACACCTCGTTGTGACTATCAATTCTCCGATTACCCTTGGGCACAAACAGATGATAATTCCAGTTTCCCATCATATGCCGAAATACTTGATTATCTCGACTC...
CDS
下载 CDS FASTA1536 bp · LXL04_002284|LXL04_002284|OH1004|CDS
ATGGCAGTCATCTTCTCCAAGATAGGCATCATCGGAGGTGGCATAAGTGGGTTAGCCGCCGCCAAACAGCTTTCCAAACACAATCCAATGGTATTTGAGGCCACCGATTCCATTGGTGGTGTTTGGAAGCACTGCACCTTCAGAACAACAAAACTTCAAACACCTCGTTGTGACTATCAATTCTCCGATTACCCTTGGGCACAAACAGATGATAATTCCAGTTTCCCATCATATGCCGAAATACTTGATTATCTCGACTC...
511 aa · LXL04_002284|LXL04_002284|OH1004|PROTEIN
MAVIFSKIGIIGGGISGLAAAKQLSKHNPMVFEATDSIGGVWKHCTFRTTKLQTPRCDYQFSDYPWAQTDDNSSFPSYAEILDYLDSYANHFDLLKFINFDSKVTEIKFVGDHETVAYQSLSSGKPMWEVAVHNTKSDTIQWYAFEFIVVCTGKYGDIPIIPKFPMKKGPEVFKGKVMHSQDYSKLNTQESVELLKGKKVVVVGYKKSAIDLAVECAEANEGEEGKACTMVVRTLHWTVPHYSIWGLPFYLFYSTRFSQF...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_002284 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_002284 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr01:45256079-45258523 (-) | |||||||||
| 描述 | Similar to FMO1: Probable flavin-containing monooxygenase 1 | |||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | |||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006629 lipid metabolic process 生物过程 GO:0006805 xenobiotic metabolic process 生物过程 GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程 GO:0009627 systemic acquired resistance 生物过程 GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程 GO:0050832 defense response to fungus 生物过程 GO:0051707 response to other organism 生物过程 GO:0062034 L-pipecolic acid biosynthetic process 生物过程 GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程 GO:0090181 regulation of cholesterol metabolic process 生物过程 GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分 GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分 | |||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G19250 ath:AT5G45180 cpoc:100135521 hsa:2330 ocu:100009064 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
内质网0.403
细胞质0.272
线粒体0.153
细胞膜0.105
细胞核0.092
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00743.26FMO-like7-485 aaPF01266.31DAO8-67 aaPF13738.13Pyr_redox_310-117 aaPF13450.13NAD_binding_810-59 aaPF13434.13Lys_Orn_oxgnase74-370 aaPF13738.13Pyr_redox_3143-243 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_002284 | PF00743.26 | FMO-like | 7 | 485 | 2.8e-42 | 145.6 |
| LXL04_002284 | PF01266.31 | DAO | 8 | 67 | 1.7e-06 | 28.5 |
| LXL04_002284 | PF13738.13 | Pyr_redox_3 | 10 | 117 | 7.4e-13 | 49.1 |
| LXL04_002284 | PF13450.13 | NAD_binding_8 | 10 | 59 | 1.8e-07 | 32.0 |
| LXL04_002284 | PF13434.13 | Lys_Orn_oxgnase | 74 | 370 | 3.9e-09 | 36.8 |
| LXL04_002284 | PF13738.13 | Pyr_redox_3 | 143 | 243 | 7.4e-13 | 49.1 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。