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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G437720
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 109363224-109363862 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

522 bp · TkA01G437720|TK1151|cDNA

ATGGAAAACCAGCAGAGTTTTCGTGTTTCTGCTATGGAGAAGCAGAAGAGCTTTCGAATCGCCATGGGAAGACAGATGAGCTTCGGTGTTGATAGAAGGAAACCTAAAGATTCACCAGGAAAACGTGGGGATTCCATGCTTCATCTAGCTTCTAGAGGCGGTAATCTAGCAAAAGTTATAGAAATCTTTCAAAGCGTCGGCCTCGATGGATTATCGAAACAAAATCAAGAATGGGAAACTCCGCTTTATGTTGCTGCAGA...

CDS

下载 CDS FASTA

522 bp · TkA01G437720|TK1151|CDS

ATGGAAAACCAGCAGAGTTTTCGTGTTTCTGCTATGGAGAAGCAGAAGAGCTTTCGAATCGCCATGGGAAGACAGATGAGCTTCGGTGTTGATAGAAGGAAACCTAAAGATTCACCAGGAAAACGTGGGGATTCCATGCTTCATCTAGCTTCTAGAGGCGGTAATCTAGCAAAAGTTATAGAAATCTTTCAAAGCGTCGGCCTCGATGGATTATCGAAACAAAATCAAGAATGGGAAACTCCGCTTTATGTTGCTGCAGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

173 aa · TkA01G437720|TK1151|PROTEIN

MENQQSFRVSAMEKQKSFRIAMGRQMSFGVDRRKPKDSPGKRGDSMLHLASRGGNLAKVIEIFQSVGLDGLSKQNQEWETPLYVAAENGHSHVVAQFLKHLDLQTASIAANNGYDPFHIAAKQGHLGNFEFVPKFGDDPVLVLMDIRVDPCLWAVGPSGSVKPVRVDPSENLA

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G437720
TK1151 IDTkA01G437720
OH-1004 IDLXL04_002590
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)98.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 41.618 / OH-1004 64.865
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G437720
位置Chr01:109363224-109363862 (-)
描述Similar to At5g02620: Ankyrin repeat-containing protein At5g02620
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g02620 含锚蛋白重复序列的蛋白At5g02620。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_002590 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002027 regulation of heart rate 生物过程
GO:0006874 intracellular calcium ion homeostasis 生物过程
GO:0006897 endocytosis 生物过程
GO:0008104 intracellular protein localization 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0010628 positive regulation of gene expression 生物过程
GO:0010881 regulation of cardiac muscle contraction by regulation of the release of sequestered calcium ion 生物过程
GO:0010882 regulation of cardiac muscle contraction by calcium ion signaling 生物过程
GO:0015031 protein transport 生物过程
GO:0031647 regulation of protein stability 生物过程
GO:0034394 protein localization to cell surface 生物过程
GO:0036309 protein localization to M-band 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G12360
ath:AT5G02620
dosa:Os01g0837000
hsa:287
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.423
排名 1 · TkA01G437720 · TK1151
细胞核0.381
排名 2 · TkA01G437720 · TK1151
细胞膜0.160
排名 3 · TkA01G437720 · TK1151
内质网0.084
排名 4 · TkA01G437720 · TK1151
线粒体0.083
排名 5 · TkA01G437720 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12796Ank_241-57 aa
PF13857Ank_541-57 aa
PF13637Ank_441-56 aa
PF00023Ank43-57 aa
PF13606Ank_343-62 aa
PF12796Ank_247-130 aa
PF24521Ank_KRIT147-120 aa
PF13637Ank_471-94 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G437720PF12796Ank_241575e-1040.5
TkA01G437720PF13857Ank_541573.6e-0834.3
TkA01G437720PF13637Ank_441565.1e-0730.5
TkA01G437720PF00023Ank43573.6e-0833.9
TkA01G437720PF13606Ank_343624.5e-0833.4
TkA01G437720PF12796Ank_2471305e-1040.5
TkA01G437720PF24521Ank_KRIT1471200.06613.6
TkA01G437720PF13637Ank_471945.1e-0730.5
TkA01G437720PF13857Ank_574953.6e-0834.3
TkA01G437720PF00023Ank79993.6e-0833.9
TkA01G437720PF13606Ank_3791004.5e-0833.4
TkA01G437720PF13857Ank_51111313.6e-0834.3
TkA01G437720PF13637Ank_41111265.1e-0730.5
TkA01G437720PF00023Ank1121263.6e-0833.9
TkA01G437720PF13606Ank_31121264.5e-0833.4
TkA01G437720PF24521Ank_KRIT11151310.06613.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q6AWW5拟南芥sp|Q6AWW5|Y5262_ARATH Ankyrin repeat-containing protein At5g0262043.200%Swiss-Prot中等置信

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