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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G437690
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 109343317-109355000 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

8022 bp · TkA01G437690|TK1151|cDNA

ATGGACTTTGTTTTCCGCCACACATCTGATCATGCCCATCACCCGCCACCGGAACCGTCAACAAGCTCACCGACCTCACCTGCCCAGCCTCCACCACAACAACCATTTTCCCAAGAGGAGCCCGAGTACTTGGCTCGCTACCTTGTTGTTAAACACTCATGGCGTGGTCGGTACAAGAGGATACTTTGTATATCAAATTACACCCTAACAACTCTAGACCCTACGACATTATCAGTGACCAACTCTTACGACGTGAGCAA...

CDS

下载 CDS FASTA

8022 bp · TkA01G437690|TK1151|CDS

ATGGACTTTGTTTTCCGCCACACATCTGATCATGCCCATCACCCGCCACCGGAACCGTCAACAAGCTCACCGACCTCACCTGCCCAGCCTCCACCACAACAACCATTTTCCCAAGAGGAGCCCGAGTACTTGGCTCGCTACCTTGTTGTTAAACACTCATGGCGTGGTCGGTACAAGAGGATACTTTGTATATCAAATTACACCCTAACAACTCTAGACCCTACGACATTATCAGTGACCAACTCTTACGACGTGAGCAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

2673 aa · TkA01G437690|TK1151|PROTEIN

MDFVFRHTSDHAHHPPPEPSTSSPTSPAQPPPQQPFSQEEPEYLARYLVVKHSWRGRYKRILCISNYTLTTLDPTTLSVTNSYDVSKDYEGASPVIGKDENTMEFTVSVRTDGRGKFKATKFSSRYRASILTELHRIRWNRLGTLGEFPVLHLRRKTAEWVPLTMKVTYVGVELTELKSGDLRWCLDFRDMASPAIILLSDAYGRKNSEPGGFVLCALYGRKCKAFQAAPGTSNSTIVGNLKKTAKSTVGVLLSVESSQS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G437690
TK1151 IDTkA01G437690
OH-1004 IDLXL04_002591
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G437690
位置Chr01:109343317-109355000 (-)
描述Similar to GRV2: DnaJ homolog subfamily C GRV2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g26890 内体形成、液泡蛋白分选和胚胎生长轴测定所需。
The gravitropism defective 2 mutants of Arabidopsis are deficient in a protein implicated in endocytosis in Caenorhabditis elegans.2004 · DOI: 10.1104/pp.104.050583
Arabidopsis KAM2/GRV2 is required for proper endosome formation and functions in vacuolar sorting and determination of the embryo growth axis.2007 · DOI: 10.1105/tpc.106.046631
Arabidopsis vacuolar sorting mutants (green fluorescent seed) can be identified efficiently by secretion of vacuole-targeted green fluorescent protein in their seeds.2007 · DOI: 10.1105/tpc.106.045997
The GRV2/RME-8 protein of Arabidopsis functions in the late endocytic pathway and is required for vacuolar membrane flow.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03314.x

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_002591 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000578 embryonic axis specification 生物过程
GO:0006260 DNA replication 生物过程
GO:0006457 protein folding 生物过程
GO:0006623 protein targeting to vacuole 生物过程
GO:0006897 endocytosis 生物过程
GO:0006898 receptor-mediated endocytosis 生物过程
GO:0007032 endosome organization 生物过程
GO:0007033 vacuole organization 生物过程
GO:0009408 response to heat 生物过程
GO:0009638 phototropism 生物过程
GO:0009660 amyloplast organization 生物过程
GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G26890
hsa:23317
pon:100174139
reh:H16_A3088
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.522
排名 1 · TkA01G437690 · TK1151
细胞核0.230
排名 2 · TkA01G437690 · TK1151
高尔基体0.186
排名 3 · TkA01G437690 · TK1151
细胞膜0.140
排名 4 · TkA01G437690 · TK1151
内质网0.108
排名 5 · TkA01G437690 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF19432RME-8_N46-138 aa
PF29707RME-8_2nd49-84 aa
PF29707RME-8_2nd160-251 aa
PF29707RME-8_2nd336-391 aa
PF29708RME-8_4th435-483 aa
PF29708RME-8_4th524-577 aa
PF25598ARM_PUB529-578 aa
PF25598ARM_PUB617-702 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G437690PF19432RME-8_N461382.9e-2073.3
TkA01G437690PF29707RME-8_2nd49840.0009220.1
TkA01G437690PF29707RME-8_2nd1602510.0009220.1
TkA01G437690PF29707RME-8_2nd3363910.0009220.1
TkA01G437690PF29708RME-8_4th4354830.06713.7
TkA01G437690PF29708RME-8_4th5245770.06713.7
TkA01G437690PF25598ARM_PUB5295780.005416.9
TkA01G437690PF25598ARM_PUB6177020.005416.9
TkA01G437690PF14237GYF_2117212207.9e-1451.9
TkA01G437690PF25598ARM_PUB123613180.005416.9
TkA01G437690PF00226DnaJ153615761.1e-1042.2
TkA01G437690PF25598ARM_PUB170617780.005416.9
TkA01G437690PF15625CC2D2AN-C2193019760.1912.1
TkA01G437690PF25598ARM_PUB207221110.005416.9
TkA01G437690PF25598ARM_PUB235324330.005416.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4IVL6拟南芥sp|F4IVL6|GRV2_ARATH DnaJ homolog subfamily C GRV273.500%Swiss-Prot高置信

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