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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G413330
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 103168074-103172403 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3986 bp · TkA01G413330|TK1151|cDNA

AATTCCTTCTTTCTCTCTCTGTCTTGAATACAAACAGACTGCCGTCATCATCATCGTCGTTTTTCCCTACACTAAAACAGAAAAACTCAAATTTACCATCTTTCTCTAACTATAACCTTCCCCACTTATTAATAAATAATTTCTAAAAAGGTTTTTTTGTTTTTATTTTCAGTTTTTACTCATACTTATACATACATACATACAGATACACATGGAGAGAGAAAAAGAGGGTTTCTTTATCATCATCTTCCTGAGAGTCC...

CDS

下载 CDS FASTA

3126 bp · TkA01G413330|TK1151|CDS

ATGAGGGCAGGATTGAGTACTATCCAGCAAACCCTAACGCCGGAGGCGGCCACCGTCTTGAATCACTCAATAGCAGAAGCTGGTCGTCGGAACCACGGTCAAACGACGCCGCTTCATGTGGCTTCCACGCTTCTTGCGTCACCGACGGGATTTCTCCGGCAAGCTTGCATCCGGTCACATCCCAATTCGTCTCACCCTCTCCAGTGCCGAGCTCTTGAACTTTGCTTCAGCGTGGCGCTCGAACGGCTCCCCACCGCCAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1041 aa · TkA01G413330|TK1151|PROTEIN

MRAGLSTIQQTLTPEAATVLNHSIAEAGRRNHGQTTPLHVASTLLASPTGFLRQACIRSHPNSSHPLQCRALELCFSVALERLPTATSSPAVTEPPISNALMAALKRAQAHQRRGCPEQQQQPLLAVKVELEQLIISILDDPSVSRVMREASFSSPAVKATIEQSISNNVSGGSNLSPSNLGIGFRPSPSTATTPVSIPVNRNLYLNPRLQQGNLHKNAESTLSTSSSPRNLYLNPRLQQVNQQKNDETAVASSSPRNLY...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G413330
TK1151 IDTkA01G413330
OH-1004 IDLXL04_002891
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.808 / OH-1004 85.655
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G413330
位置Chr01:103168074-103172403 (+)
描述Similar to SMAX1: Protein SUPPRESSOR OF MAX2 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g57710 可能是转录共抑制复合物的组分，在MAX2下游负向调控卡里金（karrikins）和独脚金内酯应答。
SUPPRESSOR OF MORE AXILLARY GROWTH2 1 controls seed germination and seedling development in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1104/pp.113.221259
SMAX1-LIKE/D53 Family Members Enable Distinct MAX2-Dependent Responses to Strigolactones and Karrikins in Arabidopsis.2015 · DOI: 10.1105/tpc.15.00562
Functional redundancy in the control of seedling growth by the karrikin signaling pathway.2016 · DOI: 10.1007/s00425-015-2458-2
At4g30350 转录辅阻遏物复合物的可能成分，专门作用于 karrikin 途径。
Functional redundancy in the control of seedling growth by the karrikin signaling pathway.2016 · DOI: 10.1007/s00425-015-2458-2
At5g57130 可能在转录共抑制复合物中发挥功能。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os08g0250900 可能在MAX2下游发挥作用，负向调控卡里金（karrikins）和独脚金内酯应答。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_002891 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0007623 circadian rhythm 生物过程
GO:0009845 seed germination 生物过程
GO:0080167 response to karrikin 生物过程
GO:0090351 seedling development 生物过程
GO:1902347 response to strigolactone 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0016887 ATP hydrolysis activity 分子功能
GO:0044183 protein folding chaperone 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G30350
ath:AT5G57710
dosa:Os08g0250900
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.894
排名 1 · TkA01G413330 · TK1151
细胞质0.126
排名 2 · TkA01G413330 · TK1151
细胞膜0.050
排名 3 · TkA01G413330 · TK1151
内质网0.037
排名 4 · TkA01G413330 · TK1151
质体0.029
排名 5 · TkA01G413330 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02861Clp_N12-113 aa
PF02861Clp_N129-171 aa
PF02861Clp_N228-244 aa
PF23569NBD_SMAX1279-454 aa
PF00004AAA342-425 aa
PF24273TRASH_HVO_1752_C499-525 aa
PF09538FYDLN_acid503-537 aa
PF02861Clp_N514-536 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G413330PF02861Clp_N121138.3e-0833.2
TkA01G413330PF02861Clp_N1291718.3e-0833.2
TkA01G413330PF02861Clp_N2282448.3e-0833.2
TkA01G413330PF23569NBD_SMAX12794549.9e-33114.4
TkA01G413330PF00004AAA3424250.2712.4
TkA01G413330PF24273TRASH_HVO_1752_C4995250.2312.3
TkA01G413330PF09538FYDLN_acid5035377.28.1
TkA01G413330PF02861Clp_N5145368.3e-0833.2
TkA01G413330PF00004AAA7127840.2712.4
TkA01G413330PF07724AAA_27138243.3e-0937.7
TkA01G413330PF23569NBD_SMAX17588019.9e-33114.4
TkA01G413330PF09538FYDLN_acid8709037.28.1
TkA01G413330PF26587AAA_lid_SMAX194010224e-2278.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FHH2拟南芥sp|Q9FHH2|SMAX1_ARATH Protein SUPPRESSOR OF MAX2 148.900%Swiss-Prot中等置信
Q9M0C5拟南芥sp|Q9M0C5|SMXL2_ARATH Protein SMAX1-LIKE 244.500%Swiss-Prot中等置信
Q9LU73拟南芥sp|Q9LU73|SMXL5_ARATH Protein SMAX1-LIKE 531.400%Swiss-Prot中等置信
Q6Z517水稻sp|Q6Z517|SMAX1_ORYSJ Protein SMAX1-like37.800%Swiss-Prot中等置信

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