本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA01G377630
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 94222735-94225536 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

834 bp · TkA01G377630|TK1151|cDNA

ATGGTGGCTATAAAGCGTGTCGTTGACTACGCCGTCAAGGTCCGAATCAAAGCCGACAAGACTGGAGTCGAGACAACAAATGTGAAGATGTCGATGAACCCTTTCTGCGAAATAGCTCTCGAAGAAGCTCTTAAGATCAAGGAGTCAAAGATTGCTTCGGAGGTGATTGCTGTGAGCATCGGTCCAGCTCAGTGCGCTGACACTCTCCGGACCGGCCTAGCAATGGGTGCAGACCGTGCGATTCACGTCGATGCACCAGC...

834 bp · TkA01G377630|TK1151|CDS

ATGGTGGCTATAAAGCGTGTCGTTGACTACGCCGTCAAGGTCCGAATCAAAGCCGACAAGACTGGAGTCGAGACAACAAATGTGAAGATGTCGATGAACCCTTTCTGCGAAATAGCTCTCGAAGAAGCTCTTAAGATCAAGGAGTCAAAGATTGCTTCGGAGGTGATTGCTGTGAGCATCGGTCCAGCTCAGTGCGCTGACACTCTCCGGACCGGCCTAGCAATGGGTGCAGACCGTGCGATTCACGTCGATGCACCAGC...

277 aa · TkA01G377630|TK1151|PROTEIN

MVAIKRVVDYAVKVRIKADKTGVETTNVKMSMNPFCEIALEEALKIKESKIASEVIAVSIGPAQCADTLRTGLAMGADRAIHVDAPATLYPLSIAKILKALVDVEKPGLLILGKQAIDDDCNQTGQMVAGLLNWPQGTFASKVILDKEMNVATVDREVDGGLETLCLDLPAVITTDLRLNQPRYATLPNIMKAKSKPIKKISLEELKVEMRSDMEVIQVTEPPKRKAGVVLSSVDELVDKLKNEAHAGGCGCANPQRQAN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G377630
TK1151 IDTkA01G377630
OH-1004 IDLXL04_003278
关系 / 置信度序列支持,注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)99.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 88.809 / OH-1004 17.324
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G377630
位置Chr01:94222735-94225536 (-)
描述Similar to ETFB: Electron transfer flavoprotein subunit beta, mitochondrial
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g43430 异二聚体电子转移黄素蛋白,可接受来自多种线粒体脱氢酶的电子。

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0182800 异二聚体电子转移黄素蛋白,可接受来自多种线粒体脱氢酶的电子。 暂无已核实直接文献
UniProt: A2XQV4 异二聚体电子转移黄素蛋白,可接受来自多种线粒体脱氢酶的电子。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_003278 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0006552 L-leucine catabolic process 生物过程
GO:0009063 amino acid catabolic process 生物过程
GO:0015996 chlorophyll catabolic process 生物过程
GO:0022904 respiratory electron transport chain 生物过程
GO:0033539 fatty acid beta-oxidation using acyl-CoA dehydrogenase 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005759 mitochondrial matrix 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0045251 electron transfer flavoprotein complex 细胞组分
GO:0000166 nucleotide binding 分子功能
GO:0009055 electron transfer activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G43430
ddi:DDB_G0277991
dosa:Os04g0182800
rno:292845
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞质0.460
排名 1 · TkA01G377630 · TK1151
线粒体0.225
排名 2 · TkA01G377630 · TK1151
细胞核0.151
排名 3 · TkA01G377630 · TK1151
质体0.135
排名 4 · TkA01G377630 · TK1151
过氧化物酶体0.096
排名 5 · TkA01G377630 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01012ETF23-205 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G377630PF01012ETF232053.1e-39135.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LSW8拟南芥sp|Q9LSW8|ETFB_ARATH Electron transfer flavoprotein subunit beta, mitochondrial78.900%Swiss-Prot高置信
Q7F9U3水稻sp|Q7F9U3|ETFB_ORYSJ Electron transfer flavoprotein subunit beta, mitochondrial75.300%Swiss-Prot高置信
A2XQV4水稻sp|A2XQV4|ETFB_ORYSI Electron transfer flavoprotein subunit beta, mitochondrial74.500%Swiss-Prot高置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看