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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA01G371130
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 92533405-92536287 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

2038 bp · TkA01G371130|TK1151|cDNA

TTATGATTATGATTTGCTTTACCGTTTTTGCATAAAATTTATAATGGTATACGTAAAGGCTAACGACCTCTTTCCTTCTTATTTACCAAACACATAAACCTGTTTTCTTCAAAAACCCTATTTACGTGCGTCTCCCCCTCTTGCTTTTCACCCTGGAGACGTTCTCACATTCAGAGCAGCTAGAATACTTTCCAAGTTATGTCACTTCAACCTTCTTCCAGAACAACAATGGTGAAGATCATGTAGTGGATCAAAAGACA...

1311 bp · TkA01G371130|TK1151|CDS

ATGAGGAGTACAAAATTCCCTATACGTTACCTAATCGTCATATTGACCTTCTTTTGCACCTGTGTATGTTACATTGAACGTGTAGGCTTTTCAATTGCATACACAATTGCTGCAGATGATGCAGGCGTCAGTCAATCAAGCAAAGGCACCATTCTGTCAACATTCTATTACGGGTACGCTTTTTCTCAGGTCCCTGGTGGTTGGGCAGCACAAAAGATCGGGGGCAGACGTATTCTCCTTTTTTCATTTGTGATTTGGTC...

436 aa · TkA01G371130|TK1151|PROTEIN

MRSTKFPIRYLIVILTFFCTCVCYIERVGFSIAYTIAADDAGVSQSSKGTILSTFYYGYAFSQVPGGWAAQKIGGRRILLFSFVIWSLTCALCPLDPKRVMALVIARLLVGVAQGFIFPSIHTVLAQWVPPHERSRSLSLTTSGMYLGAALGMLFLPSLVKFKGPQSVFLAESALGGLWSLLWLQFASDPPRVDHPKATAAGFGEYLLPIRDSQTLKPDKTSQIPWRRIFLSLPVWAILVNNFTFHYALYVLMNWLPTYF...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G371130
TK1151 IDTkA01G371130
OH-1004 IDLXL04_003344
关系 / 置信度序列支持,注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 93.578 / OH-1004 24.446
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G371130
位置Chr01:92533405-92536287 (+)
描述Similar to ANTR5: Probable anion transporter 5
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g44370 无机磷酸盐和可能的阴离子转运蛋白。 暂无已核实直接文献
At4g00370 无机磷酸盐和可能的阴离子转运蛋白。

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os12g0180100 可能的阴离子转运蛋白。 暂无已核实直接文献
Os11g0186800 可能的阴离子转运蛋白。 暂无已核实直接文献
Os09g0570400 可能的阴离子转运蛋白。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_003344 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0006357 regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程
GO:0006811 monoatomic ion transport 生物过程
GO:0009624 response to nematode 生物过程
GO:0000118 histone deacetylase complex 细胞组分
GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分
GO:0000785 chromatin 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0048188 Set1C/COMPASS complex 细胞组分
GO:0003712 transcription coregulator activity 分子功能
GO:0005315 phosphate transmembrane transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G11950
ath:AT5G44370
dosa:Os11g0186800
dosa:Os12g0180100
osa:4349969
osa:4351670
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

溶酶体/液泡0.272
排名 1 · TkA01G371130 · TK1151
高尔基体0.195
排名 2 · TkA01G371130 · TK1151
内质网0.183
排名 3 · TkA01G371130 · TK1151
细胞质0.179
排名 4 · TkA01G371130 · TK1151
细胞膜0.130
排名 5 · TkA01G371130 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07690MFS_117-383 aa
PF00083Sugar_tr44-182 aa
PF00083Sugar_tr364-388 aa
PF07690MFS_1406-428 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G371130PF07690MFS_1173831.3e-52179.6
TkA01G371130PF00083Sugar_tr441824e-0730.0
TkA01G371130PF00083Sugar_tr3643884e-0730.0
TkA01G371130PF07690MFS_14064281.3e-52179.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FKV1拟南芥sp|Q9FKV1|ANTR5_ARATH Probable anion transporter 575.900%Swiss-Prot高置信
Q8GX78拟南芥sp|Q8GX78|ANTR2_ARATH Ascorbate transporter, chloroplastic37.600%Swiss-Prot中等置信
Q2QWW7水稻sp|Q2QWW7|PHT47_ORYSJ Probable anion transporter 770.200%Swiss-Prot高置信
Q53P54水稻sp|Q53P54|PHT46_ORYSJ Probable anion transporter 671.500%Swiss-Prot高置信
Q652N5水稻sp|Q652N5|PHT44_ORYSJ Probable anion transporter 4, chloroplastic38.800%Swiss-Prot中等置信

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