TkA01G215940 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA01G215940

当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 55051202-55054502 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2659 bp · TkA01G215940|TK1151|cDNA

CACAAGGTTCTCGCCTTGTCGACCTCGGCGAATGGCGATACCGCCCTCTTTGCCCGTTGGAGATTCGTAACGGCTATATTTCAAGTTTTAATCTCCAACAAAATGACACCACCCTTTCCATTTTCGTTTTCAACTTTCCATCAACAGTCCTCTTCTCTCTCTCATCTTTAACGCCATCATTTTCTCTGTATTCTTCCTCGACTCTTGATTTTGGCTTTCAAAGTTCTTGATTTTATTCACACTTGTCTCCCATGGCTCCT...

CDS

下载 CDS FASTA

1917 bp · TkA01G215940|TK1151|CDS

ATGGCTCCTACCCCTTCTTCCAAATCAAATCACACCCATCTAAGGACGCCCCAATCAAAGCATCGCCTGAATTTTAACTCCACAAAACCCTCCCCAAACCCTAATTCTGCCGTCAAAGAACCCCATCAACTAGCAGATCATCCAGTTGAAGTTGTCGGCCGGATTAGGGACTATCCTGACCAGAAAGATAAACCCATCTCCGTTTTGCAGGTCAATTCTGACGGTCGTTCAGTCAGGGTCAGAACTGAAATCGGATACCG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

638 aa · TkA01G215940|TK1151|PROTEIN

MAPTPSSKSNHTHLRTPQSKHRLNFNSTKPSPNPNSAVKEPHQLADHPVEVVGRIRDYPDQKDKPISVLQVNSDGRSVRVRTEIGYRDFTLDGVSEDQDLDGFYRNFVQPRINGVKLGDKCTIMMYGPTGSGKSHTMFGSAKQQGIVYKSLSDILGNENDEIDEQKVGVGTFVQVTVLEIYNEEIYDLLSTNSKAGFNIGWSKGNASKVKLEVMGKKAKNATFISGTEAGKISKEIQKVEKRRIIKSTFCNERSSRSHCM...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA01G215940`
TK1151 ID	TkA01G215940
OH-1004 ID	LXL04_001277
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	34.900
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 42.947 / OH-1004 22.697 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA01G215940

位置 Chr01:55051202-55054502 (-)

描述 Similar to KIN14F: Kinesin-like protein KIN-14F

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g14330`	可能加上末端定向运动蛋白，可能有助于成膜体中高尔基体衍生囊泡的运输。	A novel plant kinesin-related protein specifically associates with the phragmoplast organelles.2001 · DOI: 10.1105/tpc.010225

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os02g0810200`	动力蛋白样蛋白KIN-10A。	暂无已核实直接文献
`UniProt: Q0E2L3`	类驱动蛋白 KIN-14D。	暂无已核实直接文献
`Os12g0616000`	驱动蛋白样蛋白 KIN-14R。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_001277 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0007017 microtubule-based process 生物过程

GO:0007018 microtubule-based movement 生物过程

GO:0007097 nuclear migration 生物过程

GO:0031534 minus-end directed microtubule sliding 生物过程

GO:0051647 nucleus localization 生物过程

GO:0005874 microtubule 细胞组分

GO:0015629 actin cytoskeleton 细胞组分

GO:0015630 microtubule cytoskeleton 细胞组分

GO:0003777 microtubule motor activity 分子功能

GO:0003779 actin binding 分子功能

GO:0005524 ATP binding 分子功能

GO:0008017 microtubule binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

dosa:Os03g0301800

dosa:Os12g0547500

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.539

排名 1 · TkA01G215940 · TK1151

细胞质0.472

排名 2 · TkA01G215940 · TK1151

细胞膜0.108

排名 3 · TkA01G215940 · TK1151

内质网0.038

排名 4 · TkA01G215940 · TK1151

溶酶体／液泡0.028

排名 5 · TkA01G215940 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04738Lant_dehydr_N30-80 aa

PF00225Kinesin72-372 aa

PF16796Microtub_bd119-189 aa

PF04859DUF641398-450 aa

PF04738Lant_dehydr_N411-528 aa

PF02601Exonuc_VII_L414-514 aa

PF00225Kinesin449-484 aa

PF04859DUF641460-514 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA01G215940	`PF04738`	Lant_dehydr_N	30	80	2.7	6.8
TkA01G215940	`PF00225`	Kinesin	72	372	1.3e-61	209.2
TkA01G215940	`PF16796`	Microtub_bd	119	189	6.2e-08	33.4
TkA01G215940	`PF04859`	DUF641	398	450	3.2	8.8
TkA01G215940	`PF04738`	Lant_dehydr_N	411	528	2.7	6.8
TkA01G215940	`PF02601`	Exonuc_VII_L	414	514	0.78	9.9
TkA01G215940	`PF00225`	Kinesin	449	484	1.3e-61	209.2
TkA01G215940	`PF04859`	DUF641	460	514	3.2	8.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q8VWI7`	拟南芥	sp\|Q8VWI7\|KN10A_ARATH Kinesin-like protein KIN-10A	68.800%	Swiss-Prot	高置信
`Q6K990`	水稻	sp\|Q6K990\|KN10A_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-10A	57.900%	Swiss-Prot	高置信
`Q0E2L3`	水稻	sp\|Q0E2L3\|KN14D_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-14D	30.700%	Swiss-Prot	中等置信
`Q2QM62`	水稻	sp\|Q2QM62\|KN14R_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-14R	30.500%	Swiss-Prot	中等置信

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