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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G204610
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 52089291-52101331 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1869 bp · TkA01G204610|TK1151|cDNA

ATCGTGGATCCCCAATTTGATTTGAAATCAGCGATCCGCCCAAAGCCCCTTCAAACGGCTACATATCTCCCTCCTTGTCCATCCCTCTCTTTGCTGGTATCTCCATAATTTCTCGGTAGTTGTCGGTGGAACCCAAATTCTCTCTCACTATCTCTAATCACCACCCTGAGCACGGTTTCTGAAAGATGAAGCGTTATATGCAACCATTAAACCCTAGTTCGATAAAGCATAGTAAATCTTCTACCCGAAAACAGAAACAT...

CDS

下载 CDS FASTA

1626 bp · TkA01G204610|TK1151|CDS

ATGAGGCCACCAAGCAAAAATGAAGAAGAGGGGGAAATCATAGTACAGAAGACATCTGGAGATTCATTGTCCATTCTCGGGCAACCATTTACTTTTGATTCTATAGCTGATGCAACCTCAACTCAGGTGGATATATTCCAGATGGTAGGAGCTCCCCTTGTTGAGAATTGTATTGCTGGATTTAACAGTTCTGTGTTTGCATACGGGCAGACTGGGAGTGGAAAGACATACACGATATGGGGTCCTTCCAATGCATTGTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

541 aa · TkA01G204610|TK1151|PROTEIN

MRPPSKNEEEGEIIVQKTSGDSLSILGQPFTFDSIADATSTQVDIFQMVGAPLVENCIAGFNSSVFAYGQTGSGKTYTIWGPSNALLEDDSSSDQQGLTPRVFERLFLRINEEQNKHTDKQLMYQCRCSFLEIYNEQITDLLDPTQRNLQIREDTKTGVYVENLREESVCSIKDVTQLLKKGLSNRRIGATSINMESSRSHSVFTCVVESRCKSVDGLSSLKTSRINLVDLAGSERQKSTGAAGERLKEAGNINRSLSQL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G204610
TK1151 IDTkA01G204610
OH-1004 IDLXL04_004086
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)99.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 95.379 / OH-1004 46.154
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G204610
位置Chr01:52089291-52101331 (+)
描述Similar to KIN12A: Kinesin-like protein KIN-12A
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g23670 Plus 端定向的驱动蛋白样运动酶，在胞质分裂过程中成膜体微管的组织中发挥关键作用。
Two Arabidopsis phragmoplast-associated kinesins play a critical role in cytokinesis during male gametogenesis.2007 · DOI: 10.1105/tpc.107.050716
At4g14150 Plus 端定向的驱动蛋白样运动酶，在胞质分裂过程中成膜体微管的组织中发挥关键作用。
Identification of a phragmoplast-associated kinesin-related protein in higher plants.2000 · DOI: 10.1016/s0960-9822(00)00564-9
Two Arabidopsis phragmoplast-associated kinesins play a critical role in cytokinesis during male gametogenesis.2007 · DOI: 10.1105/tpc.107.050716

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0350300 Plus 端定向的驱动蛋白样运动酶，在胞质分裂过程中成膜体微管的组织中发挥关键作用。 暂无已核实直接文献
Os02g0489800 类驱动蛋白KIN-12B。 暂无已核实直接文献
Os07g0638000 类动力蛋白 KIN-12E。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_004086 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007018 microtubule-based movement 生物过程
GO:0007112 male meiosis cytokinesis 生物过程
GO:0055046 microgametogenesis 生物过程
GO:0080175 phragmoplast microtubule organization 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005871 kinesin complex 细胞组分
GO:0005874 microtubule 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009524 phragmoplast 细胞组分
GO:0003777 microtubule motor activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0008017 microtubule binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G23670
ath:AT4G14150
dosa:Os04g0350300
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.654
排名 1 · TkA01G204610 · TK1151
细胞核0.359
排名 2 · TkA01G204610 · TK1151
细胞膜0.072
排名 3 · TkA01G204610 · TK1151
线粒体0.067
排名 4 · TkA01G204610 · TK1151
高尔基体0.048
排名 5 · TkA01G204610 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF16796Microtub_bd24-142 aa
PF00225Kinesin28-329 aa
PF27935CCDC61_coil127-165 aa
PF31146MIT_ATG38132-181 aa
PF27935CCDC61_coil227-257 aa
PF31146MIT_ATG38252-269 aa
PF23735KIF9324-374 aa
PF31146MIT_ATG38329-370 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G204610PF16796Microtub_bd241429.2e-2071.8
TkA01G204610PF00225Kinesin283291.8e-108363.1
TkA01G204610PF27935CCDC61_coil1271650.2112.9
TkA01G204610PF31146MIT_ATG381321810.113.6
TkA01G204610PF27935CCDC61_coil2272570.2112.9
TkA01G204610PF31146MIT_ATG382522690.113.6
TkA01G204610PF23735KIF93243741.69.6
TkA01G204610PF31146MIT_ATG383293700.113.6
TkA01G204610PF27935CCDC61_coil3373660.2112.9
TkA01G204610PF23735KIF93784261.69.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8L7Y8拟南芥sp|Q8L7Y8|KN12B_ARATH Kinesin-like protein KIN-12B64.700%Swiss-Prot高置信
Q9LDN0拟南芥sp|Q9LDN0|KN12A_ARATH Kinesin-like protein KIN-12A72.200%Swiss-Prot高置信
Q7XKR9水稻sp|Q7XKR9|KN12A_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-12A61.500%Swiss-Prot高置信
Q6K765水稻sp|Q6K765|KN12B_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-12B62.100%Swiss-Prot高置信
B9FUF9水稻sp|B9FUF9|KN12E_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-12E54.100%Swiss-Prot中等置信

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