TkA01G182920 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA01G182920

当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 46949803-46952075 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1812 bp · TkA01G182920|TK1151|cDNA

TACATTAATTCTTCATCCGATCAATTGATCGGAATACTGTTGTTGATCGAAAACAAAAAATGGATAACATCACCAAAGAGCAGACCCAACCAGAAGTAGGTTGGAAGAGGCCAAGAACGAAGATCGTGTGCACTTTGGGACCGGCTTCTCGGTCGATTCCGATGGTTGAGAAACTTCTAAGGGCAGGAATGAATGTCGCTCGCTTCAATTTTTCACACGGATCTCACGAGTACCACCAGGAAACCCTCGATAATCTTCGT...

CDS

下载 CDS FASTA

1530 bp · TkA01G182920|TK1151|CDS

ATGGATAACATCACCAAAGAGCAGACCCAACCAGAAGTAGGTTGGAAGAGGCCAAGAACGAAGATCGTGTGCACTTTGGGACCGGCTTCTCGGTCGATTCCGATGGTTGAGAAACTTCTAAGGGCAGGAATGAATGTCGCTCGCTTCAATTTTTCACACGGATCTCACGAGTACCACCAGGAAACCCTCGATAATCTTCGTACCGCCCAGAAAAACACCGGTATTGAATGTGCAGTGATGCTCGATACCAAAGGTCCAGA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

509 aa · TkA01G182920|TK1151|PROTEIN

MDNITKEQTQPEVGWKRPRTKIVCTLGPASRSIPMVEKLLRAGMNVARFNFSHGSHEYHQETLDNLRTAQKNTGIECAVMLDTKGPEIRTGFLKDGKPIQVTQGKEITISTDYSIKGDENMICMSYKKLAHDVKPGSTILCSDGCITFTVLSCDTEKGLVRCRCENTWTLGERKNVNLPGVIVDLPTLTEKDQEDILKWGVPNNINLIALSFVRKGSDLVEVRKVLGEHAKTIVLMSKVENQEGVSNFDDILENTDAFMV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA01G182920`
TK1151 ID	TkA01G182920
OH-1004 ID	LXL04_004218
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA01G182920

位置 Chr01:46949803-46952075 (+)

描述 Similar to Pyruvate kinase, cytosolic isozyme

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g26390`	糖酵解途径的关键调控酶，通过基本不可逆的磷酸转移作用催化糖酵解的最后一步，将 ADP 和磷酸烯醇丙酮酸（PEP）转化为 ATP 和丙酮酸。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_004218 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006096 glycolytic process 生物过程

GO:0006950 response to stress 生物过程

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0000287 magnesium ion binding 分子功能

GO:0004743 pyruvate kinase activity 分子功能

GO:0005524 ATP binding 分子功能

GO:0016301 kinase activity 分子功能

GO:0030955 potassium ion binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT4G26390

ddi:DDB_G0283247

gmx:547791

nta:107797877

sot:102601328

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.663

排名 1 · TkA01G182920 · TK1151

细胞核0.261

排名 2 · TkA01G182920 · TK1151

线粒体0.146

排名 3 · TkA01G182920 · TK1151

细胞膜0.102

排名 4 · TkA01G182920 · TK1151

内质网0.050

排名 5 · TkA01G182920 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00224PK19-343 aa

PF02887PK_C49-108 aa

PF03143GTP_EFTU_D395-110 aa

PF19294DACZ_N183-242 aa

PF03328HpcH_HpaI211-267 aa

PF19294DACZ_N312-335 aa

PF03328HpcH_HpaI316-335 aa

PF03143GTP_EFTU_D3341-353 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA01G182920	`PF00224`	PK	19	343	7.3e-150	499.3
TkA01G182920	`PF02887`	PK_C	49	108	1.5e-23	83.8
TkA01G182920	`PF03143`	GTP_EFTU_D3	95	110	0.051	14.6
TkA01G182920	`PF19294`	DACZ_N	183	242	0.022	15.1
TkA01G182920	`PF03328`	HpcH_HpaI	211	267	0.022	14.8
TkA01G182920	`PF19294`	DACZ_N	312	335	0.022	15.1
TkA01G182920	`PF03328`	HpcH_HpaI	316	335	0.022	14.8
TkA01G182920	`PF03143`	GTP_EFTU_D3	341	353	0.051	14.6
TkA01G182920	`PF02887`	PK_C	378	504	1.5e-23	83.8
TkA01G182920	`PF03143`	GTP_EFTU_D3	391	424	0.051	14.6
TkA01G182920	`PF03143`	GTP_EFTU_D3	442	492	0.051	14.6
TkA01G182920	`PF19294`	DACZ_N	467	506	0.022	15.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`O65595`	拟南芥	sp\|O65595\|KPYC_ARATH Probable pyruvate kinase, cytosolic isozyme	77.300%	Swiss-Prot	高置信

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