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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G175120
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 44893098-44895257 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2058 bp · TkA01G175120|TK1151|cDNA

CCTCCTACGTTTTCTGCCCTTGTGCATCAAGTAATGAGTACGGAAAAGCGCGGTCGGTCGTCTCTGCATTCCATGTCGGCTTTGGTTTTAATTCCATGACACCATCAGCGAACCTTCAAGAAAGACTTGCCATTGACGCTTATACTCGACTCACCACTATTAAACGGACGAAGCAATGGTTTCCATTAGGATCTTCAAAAACATGATGATGAGAGATACAACTCAGTTATGGTCTCTAATGGCGAGTGTTACGTTCGTGT...

CDS

下载 CDS FASTA

1413 bp · TkA01G175120|TK1151|CDS

ATGGTTTCCATTAGGATCTTCAAAAACATGATGATGAGAGATACAACTCAGTTATGGTCTCTAATGGCGAGTGTTACGTTCGTGTGGGCAATATTCAAGCAATGGTTTCCAGAAGAGCTTGGTACTCATATCGAAAACTATTTTCGAAAACTTGGAAGCTATTTCTACCCTTATATCACCATCGTTTTCCATGAATACCAACCATATGAGTTCCAGCGAAGCATAGCCTACACTGCTATCGAACAATACCTGGGCGCTAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

470 aa · TkA01G175120|TK1151|PROTEIN

MVSIRIFKNMMMRDTTQLWSLMASVTFVWAIFKQWFPEELGTHIENYFRKLGSYFYPYITIVFHEYQPYEFQRSIAYTAIEQYLGANSSNRAKRLKANVIRDGKSVDLSIDDYEDVTDGFQGIKIWWSSRKKIPQQQALFARDDNEKRQRKLYTNGNKTSWSHIVFEHPSTFDTLAMDPEKKKDILNDLMTFVKSKDYYKKIGKSWKRGYLLYGPPGTGKSSMIAAMANFLNYDIYDLELTSVNDNTDLKKLLIGTSSKS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G175120
TK1151 IDTkA01G175120
OH-1004 IDLXL04_004278
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)93.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G175120
位置Chr01:44893098-44895257 (+)
描述Similar to At3g28580: AAA-ATPase At3g28580
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g28580 AAA-ATP酶 At3g28580。 暂无已核实直接文献
At5g40010 在种子成熟过程中调节形态和解剖结构所必需。 暂无已核实直接文献
At3g28510 AAA-ATP酶 At3g28510。 暂无已核实直接文献
At3g28610 AAA-ATP酶 At3g28610。 暂无已核实直接文献
At3g28540 AAA-ATP酶 At3g28540。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_004278 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000304 response to singlet oxygen 生物过程
GO:0006950 response to stress 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0010154 fruit development 生物过程
GO:0010431 seed maturation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G28510
ath:AT3G28540
ath:AT3G28580
ath:AT3G28610
ath:AT5G40010
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.276
排名 1 · TkA01G175120 · TK1151
内质网0.263
排名 2 · TkA01G175120 · TK1151
细胞核0.174
排名 3 · TkA01G175120 · TK1151
线粒体0.137
排名 4 · TkA01G175120 · TK1151
细胞膜0.128
排名 5 · TkA01G175120 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF22737NNH627-51 aa
PF14363AAA_assoc36-129 aa
PF13401AAA_2273-101 aa
PF13476AAA_23143-151 aa
PF00910RNA_helicase145-198 aa
PF20720nSTAND3192-277 aa
PF13191AAA_16202-234 aa
PF13604AAA_30203-233 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G175120PF22737NNH627510.1912.5
TkA01G175120PF14363AAA_assoc361291.2e-2280.8
TkA01G175120PF13401AAA_22731010.007317.3
TkA01G175120PF13476AAA_231431510.007517.7
TkA01G175120PF00910RNA_helicase1451980.00318.7
TkA01G175120PF20720nSTAND31922770.0007320.0
TkA01G175120PF13191AAA_162022340.0004821.4
TkA01G175120PF13604AAA_302032330.2212.0
TkA01G175120PF12775AAA_72072500.01715.4
TkA01G175120PF13555AAA_292082310.01216.1
TkA01G175120PF05673DUF8152092660.003317.3
TkA01G175120PF00004AAA2103554.2e-1970.0
TkA01G175120PF05496RuvB_N2102670.001119.5
TkA01G175120PF13086AAA_112102580.001818.8
TkA01G175120PF13401AAA_222102490.007317.3
TkA01G175120PF20030bpMoxR2102450.01315.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LJJ7拟南芥sp|Q9LJJ7|AATP9_ARATH AAA-ATPase At3g2858055.200%Swiss-Prot高置信
Q9FLD5拟南芥sp|Q9FLD5|ASD_ARATH AAA-ATPase ASD, mitochondrial54.700%Swiss-Prot高置信
Q9LH84拟南芥sp|Q9LH84|AATP5_ARATH AAA-ATPase At3g2851050.800%Swiss-Prot高置信
Q9LJJ5拟南芥sp|Q9LJJ5|AATPB_ARATH AAA-ATPase At3g2861050.400%Swiss-Prot高置信
Q9LH82拟南芥sp|Q9LH82|AATP7_ARATH AAA-ATPase At3g2854049.500%Swiss-Prot中等置信

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