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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G147280
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 37247506-37252179 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2949 bp · TkA01G147280|TK1151|cDNA

GAAGGAAAGAGTGTGTGGGTTACATTGTACGGTCTCAGCTTTGTCCCCCCACCCCACCCCCAACTAATACTGTAATCTTTCTCTCTAAAAAGCTAGAAAGACACTGCCCCTTTGGCTTTTTTCCCCTTTGGTTTTTGTGCTGCCTTTGCATTTGTCCATGTCTTGCTCCCTTCTTCAAACCCACCCAAATCCCAGCTCTCAAAACTAGATAATGGGGTGGCAATCATACCATCAATTCTCGTAGAATTTCTTCCCTTCTG...

CDS

下载 CDS FASTA

2265 bp · TkA01G147280|TK1151|CDS

ATGGAAATTGATCTGAACCATGCAGCGAATGGGATTGAGGTTATGGAGAAGCTTTATAGCGTTGATTCGAGTGGAAATGGAGGGGATTCGTCTTTATCAGCTTCGTCAAACTCCTCGAATTCGTCTCTAAAACAATCAAATCCCAATTTTGAATCATCGGTTTATATGGAGCTTTGGCATGCCTGTGCTGGGCCTCTCACAACTCTCCCAAATAAAGGAAATGTGGTTGTTTATTTCCCACAAGGTCACTTAGAACAAAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

754 aa · TkA01G147280|TK1151|PROTEIN

MEIDLNHAANGIEVMEKLYSVDSSGNGGDSSLSASSNSSNSSLKQSNPNFESSVYMELWHACAGPLTTLPNKGNVVVYFPQGHLEQTASHSSIHFSPMEVPSFGLQPQIFCKVIDVKLLANKENDEIYTKLTLLPLPELTDKNLQEGEEEGGGGTLTKSTPQMFCKTLTASDTSTHGGFSVPRRAAEDCFPPLDYKQQRPSQELVAKDLHGVEWKFRHIYRGQPRRHLLTTGWSIFVSQKNLVSGDAVLFLRGEGGELWL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G147280
TK1151 IDTkA01G147280
OH-1004 IDLXL04_004461
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G147280
位置Chr01:37247506-37252179 (+)
描述Similar to ARF4: Auxin response factor 4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g60450 生长素反应因子 (ARF) 是与生长素反应启动子元件 (AuxRE) 中发现的 DNA 序列 5'-TGTCTC-3' 特异性结合的转录因子。 暂无已核实直接文献
At5g62000 生长素反应因子 是与生长素反应启动子元件 中发现的 DNA 序列 5'-TGTCTC-3' 特异性结合的转录因子。
AUXIN RESPONSE FACTOR 2 (ARF2): a pleiotropic developmental regulator.2005 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2005.02426.x
AUXIN RESPONSE FACTOR1 and AUXIN RESPONSE FACTOR2 regulate senescence and floral organ abscission in Arabidopsis thaliana.2005 · DOI: 10.1242/dev.02012
The AUXIN RESPONSE FACTOR 2 gene of Arabidopsis links auxin signalling, cell division, and the size of seeds and other organs.2006 · DOI: 10.1242/dev.02194

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0927600 生长素反应因子 (ARF) 是与生长素反应启动子元件 (AuxRE) 中发现的 DNA 序列 5'-TGTCTC-3' 特异性结合的转录因子。 暂无已核实直接文献
Os05g0563400 生长素反应因子 (ARF) 是与生长素反应启动子元件 (AuxRE) 中发现的 DNA 序列 5'-TGTCTC-3' 特异性结合的转录因子。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_004461 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009733 response to auxin 生物过程
GO:0009734 auxin-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009850 auxin metabolic process 生物过程
GO:0010050 vegetative phase change 生物过程
GO:0010158 abaxial cell fate specification 生物过程
GO:0010582 floral meristem determinacy 生物过程
GO:1902584 positive regulation of response to water deprivation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0003677 DNA binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G33860
ath:AT5G60450
dosa:Os01g0670800
dosa:Os01g0753500
dosa:Os05g0563400
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.971
排名 1 · TkA01G147280 · TK1151
细胞质0.082
排名 2 · TkA01G147280 · TK1151
细胞膜0.026
排名 3 · TkA01G147280 · TK1151
内质网0.014
排名 4 · TkA01G147280 · TK1151
质体0.013
排名 5 · TkA01G147280 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07655Secretin_N_221-81 aa
PF25313BRWD_AD69-122 aa
PF02362B3164-265 aa
PF25313BRWD_AD292-393 aa
PF06507ARF_AD313-394 aa
PF07655Secretin_N_2596-646 aa
PF02309AUX_IAA636-675 aa
PF00564PB1650-700 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G147280PF07655Secretin_N_221810.0714.4
TkA01G147280PF25313BRWD_AD691225.7e-1143.4
TkA01G147280PF02362B31642651.9e-2383.0
TkA01G147280PF25313BRWD_AD2923935.7e-1143.4
TkA01G147280PF06507ARF_AD3133941e-31109.4
TkA01G147280PF07655Secretin_N_25966460.0714.4
TkA01G147280PF02309AUX_IAA6366751.4e-1042.1
TkA01G147280PF00564PB16507000.04114.6
TkA01G147280PF02362B36807101.9e-2383.0
TkA01G147280PF02309AUX_IAA6857221.4e-1042.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9ZTX9拟南芥sp|Q9ZTX9|ARFD_ARATH Auxin response factor 455.700%Swiss-Prot高置信
Q94JM3拟南芥sp|Q94JM3|ARFB_ARATH Auxin response factor 237.400%Swiss-Prot中等置信
Q5JK20水稻sp|Q5JK20|ARFD_ORYSJ Auxin response factor 437.500%Swiss-Prot中等置信
Q8S985水稻sp|Q8S985|ARFO_ORYSJ Auxin response factor 1547.900%Swiss-Prot中等置信

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