TkA01G110030 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA01G110030

当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 27953121-27959192 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1808 bp · TkA01G110030|TK1151|cDNA

TTTGGCACTTGTCTTAAGCAAAACTTCCTCAACTTCTTTAAAATTATATAACCTTATCATTTCTTCTCTTGTGCACTTCAGACATAGGAATGGCACCATGGATTCTTCTCATGTTCCGCTCATTACTAATTTTGCTAGCAACTCCCTCATCTTTTGCAAAGTTTCCATCTAGGTACTTTCCTTCTTCAATTATCCACCCCGAAACACCATCTCTTTCTAGCAATACCAACTTGCTTTACAAAACAAGATACTTCACCCAA...

CDS

下载 CDS FASTA

822 bp · TkA01G110030|TK1151|CDS

ATGGCACCATGGATTCTTCTCATGTTCCGCTCATTACTAATTTTGCTAGCAACTCCCTCATCTTTTGCAAAGTTTCCATCTAGGTACTTTCCTTCTTCAATTATCCACCCCGAAACACCATCTCTTTCTAGCAATACCAACTTGCTTTACAAAACAAGATACTTCACCCAAATTCTTGATCACTTCAATTACAATCCACAAAGTTACCAAACCTTCCAACAACGTTATCTGATCAATGACACATTCTGGGGCGGCCGCAA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

273 aa · TkA01G110030|TK1151|PROTEIN

MAPWILLMFRSLLILLATPSSFAKFPSRYFPSSIIHPETPSLSSNTNLLYKTRYFTQILDHFNYNPQSYQTFQQRYLINDTFWGGRKSKSPIFVYTGNEGNIEWFAQNTGFMYDIAPKFKALLIFLEHRYYGKSIPYGGNRKKAYKNSKNLGYLSSTQALADYATLILDLKNNLTTMDSPVIVFGGSYGGMLAAWFRLKYPHVAIGALASSAPILQFENITSQYSFNNIITQDFKSESENCYKVIKGSWKQIEDTATSKG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA01G110030`
TK1151 ID	TkA01G110030
OH-1004 ID	LXL04_004800
关系 / 置信度	序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 53.953 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID	`TkA01G110030`
位置	Chr01:27953121-27959192 (-)
描述	Similar to PRCP: Lysosomal Pro-X carboxypeptidase
拟南芥 / 水稻参考基因与文献	下载当前基因文献拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。
功能注释来源	查看注释来源功能注释来源：OH1004 · `LXL04_004800` · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
GO 注释（OH1004 来源）	GO:0002003 angiotensin maturation 生物过程 GO:0002155 regulation of thyroid hormone receptor signaling pathway 生物过程 GO:0003085 negative regulation of systemic arterial blood pressure 生物过程 GO:0006508 proteolysis 生物过程 GO:0030163 protein catabolic process 生物过程 GO:0042593 glucose homeostasis 生物过程 GO:0043535 regulation of blood vessel endothelial cell migration 生物过程 GO:0097009 energy homeostasis 生物过程 GO:1905146 lysosomal protein catabolic process 生物过程 GO:2000377 regulation of reactive oxygen species metabolic process 生物过程 GO:0005576 extracellular region 细胞组分 GO:0005764 lysosome 细胞组分
KEGG 基因交叉引用	bta:534927 hsa:5547 mmu:72461 pon:100172335 rno:83799 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

溶酶体／液泡0.372

排名 1 · TkA01G110030 · TK1151

细胞外0.310

排名 2 · TkA01G110030 · TK1151

细胞质0.094

排名 3 · TkA01G110030 · TK1151

内质网0.077

排名 4 · TkA01G110030 · TK1151

高尔基体0.071

排名 5 · TkA01G110030 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00561Abhydrolase_148-100 aa

PF05577Peptidase_S2857-272 aa

PF11144DUF292057-94 aa

PF00326Peptidase_S958-77 aa

PF00561Abhydrolase_1105-203 aa

PF21440aSelB_III111-122 aa

PF12146Hydrolase_4156-219 aa

PF00326Peptidase_S9156-220 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA01G110030	`PF00561`	Abhydrolase_1	48	100	0.00043	20.8
TkA01G110030	`PF05577`	Peptidase_S28	57	272	1.6e-58	199.3
TkA01G110030	`PF11144`	DUF2920	57	94	0.069	13.0
TkA01G110030	`PF00326`	Peptidase_S9	58	77	0.0023	18.2
TkA01G110030	`PF00561`	Abhydrolase_1	105	203	0.00043	20.8
TkA01G110030	`PF21440`	aSelB_III	111	122	0.25	12.1
TkA01G110030	`PF12146`	Hydrolase_4	156	219	9.7e-05	22.5
TkA01G110030	`PF00326`	Peptidase_S9	156	220	0.0023	18.2
TkA01G110030	`PF12697`	Abhydrolase_6	158	211	0.024	16.0
TkA01G110030	`PF11144`	DUF2920	162	212	0.069	13.0
TkA01G110030	`PF21440`	aSelB_III	202	247	0.25	12.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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