TkA01G080940 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA01G080940

当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 20662971-20669119 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

4320 bp · TkA01G080940|TK1151|cDNA

CAAATCCTGGACTAAACCTTCAGATGGCCAACTATACGGACCAAACCTGTATTTTACTCTATAATATAGCAGAGTTTTGCCCATTTGAAATTATCAAACCGCCATTTATGGATGTTTATGTAGATAGTTGTGTTCCAACTGCACCCCCAACTATACCCATGGAAGATGGTCAAGATACCCAACTTACAGAAACAATGGAAGAGAACCAGAAACTACTATTTGCCATCAACGGAGAGCGCTTTGAGCTCTCTTCCATAGAC...

CDS

下载 CDS FASTA

4197 bp · TkA01G080940|TK1151|CDS

ATGGCCAACTATACGGACCAAACCTGTATTTTACTCTATAATATAGCAGAGTTTTGCCCATTTGAAATTATCAAACCGCCATTTATGGATGTTTATGTAGATAGTTGTGTTCCAACTGCACCCCCAACTATACCCATGGAAGATGGTCAAGATACCCAACTTACAGAAACAATGGAAGAGAACCAGAAACTACTATTTGCCATCAACGGAGAGCGCTTTGAGCTCTCTTCCATAGACCCTTCAATTACTCTGCTTCAGTT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

1398 aa · TkA01G080940|TK1151|PROTEIN

MANYTDQTCILLYNIAEFCPFEIIKPPFMDVYVDSCVPTAPPTIPMEDGQDTQLTETMEENQKLLFAINGERFELSSIDPSITLLQFLRSHTRFKSVKLGCDEGGCGACNVLISKFDSNLQQVDDYTVSSCLIPLCSTNGCSITTTEGLGNSKDGFHSIHQRFAGFHGSQCGFCTPGMCVSLFSALVNADKKTEHQEPPVGFSNLTVSEAEKSISGNLCRCTGYRPIADVCKSFACDVDMEDLGLNSFWKKGDDAYSKSQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA01G080940`
TK1151 ID	TkA01G080940
OH-1004 ID	LXL04_005110
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	91.900
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 96.638 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA01G080940

位置 Chr01:20662971-20669119 (+)

描述 Similar to AAO2: Indole-3-acetaldehyde oxidase

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g20960`	在高等植物中，醛氧化酶（AO）似乎是由AO亚基组成的同源和异源二聚体，可能具有不同的生理功能。	暂无已核实直接文献
`At2g27150`	在高等植物中，醛氧化酶似乎是 AO 亚基的同二聚体和异二聚体组装体，可能具有不同的生理功能。	Abscisic aldehyde oxidase in leaves of Arabidopsis thaliana.2000 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2000.00812.x The Arabidopsis aldehyde oxidase 3 (AAO3) gene product catalyzes the final step in abscisic acid biosynthesis in leaves.2000 · DOI: 10.1073/pnas.220426197 Comparative studies on the Arabidopsis aldehyde oxidase (AAO) gene family revealed a major role of AAO3 in ABA biosynthesis in seeds.2004 · DOI: 10.1093/pcp/pch198 Both abscisic acid (ABA)-dependent and ABA-independent pathways govern the induction of NCED3, AAO3 and ABA1 in response to salt stress.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-3040.2006.01576.x
`At3g43600`	在高等植物中，醛氧化酶（AO）似乎是由AO亚基组成的同源和异源二聚体，可能具有不同的生理功能。	暂无已核实直接文献
`At1g04580`	醛氧化酶具有广泛的底物特异性。	An aldehyde oxidase in developing seeds of Arabidopsis converts benzaldehyde to benzoic Acid.2009 · DOI: 10.1104/pp.109.135848 Aldehyde Oxidase 4 Plays a Critical Role in Delaying Silique Senescence by Catalyzing Aldehyde Detoxification.2017 · DOI: 10.1104/pp.16.01939

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_005110 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009414 response to water deprivation 生物过程

GO:0009688 abscisic acid biosynthetic process 生物过程

GO:0009851 auxin biosynthetic process 生物过程

GO:0019760 glucosinolate metabolic process 生物过程

GO:0042542 response to hydrogen peroxide 生物过程

GO:0110096 cellular response to aldehyde 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0009536 plastid 细胞组分

GO:0004031 aldehyde oxidase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G04580

ath:AT2G27150

ath:AT3G43600

ath:AT5G20960

zma:542229

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.728

排名 1 · TkA01G080940 · TK1151

细胞核0.266

排名 2 · TkA01G080940 · TK1151

线粒体0.091

排名 3 · TkA01G080940 · TK1151

过氧化物酶体0.063

排名 4 · TkA01G080940 · TK1151

内质网0.051

排名 5 · TkA01G080940 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00111Fer267-134 aa

PF01799Fer2_2145-231 aa

PF00111Fer2168-175 aa

PF00941FAD_binding_5294-470 aa

PF03450CO_deh_flav_C422-435 aa

PF03450CO_deh_flav_C494-594 aa

PF01315Ald_Xan_dh_C652-755 aa

PF02738MoCoBD_1786-1015 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA01G080940	`PF00111`	Fer2	67	134	1e-05	26.1
TkA01G080940	`PF01799`	Fer2_2	145	231	2.3e-21	76.4
TkA01G080940	`PF00111`	Fer2	168	175	1e-05	26.1
TkA01G080940	`PF00941`	FAD_binding_5	294	470	6.9e-38	130.9
TkA01G080940	`PF03450`	CO_deh_flav_C	422	435	7.2e-19	68.5
TkA01G080940	`PF03450`	CO_deh_flav_C	494	594	7.2e-19	68.5
TkA01G080940	`PF01315`	Ald_Xan_dh_C	652	755	7.8e-24	84.8
TkA01G080940	`PF02738`	MoCoBD_1	786	1015	1.3e-79	267.5
TkA01G080940	`PF20256`	MoCoBD_2	1045	1307	2e-70	238.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q7G193`	拟南芥	sp\|Q7G193\|ALDO1_ARATH Indole-3-acetaldehyde oxidase	59.200%	Swiss-Prot	高置信
`Q7G9P4`	拟南芥	sp\|Q7G9P4\|ALDO3_ARATH Abscisic-aldehyde oxidase	58.900%	Swiss-Prot	高置信
`Q7G192`	拟南芥	sp\|Q7G192\|ALDO2_ARATH Indole-3-acetaldehyde oxidase	59.900%	Swiss-Prot	高置信
`Q7G191`	拟南芥	sp\|Q7G191\|ALDO4_ARATH Aldehyde oxidase 4	59.100%	Swiss-Prot	高置信

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