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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G070520
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 18029048-18032748 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1021 bp · TkA01G070520|TK1151|cDNA

ATCGACTGCAATAACAAACTTAGAAGCCAACACTACTAGCTATGAGCTCTAACCGTGGTTCAGGAAGTCGAAATCTTCGAAGAAACGCTTTGGAGTTTGGAAGGACTTTTGTGGTGATGCCTAAAGGAATTCACAAAGCTACTATAGTATGGTTACATGGCATTGGGGAGAAGGGTTCAAGCTGGACTCAAATCTTGGAAACTCTGCCACTTCCCAATATCAAATGGATCTGCCCGAGTGCGCCAATTCGTCAAGTAGCT...

CDS

下载 CDS FASTA

753 bp · TkA01G070520|TK1151|CDS

ATGAGCTCTAACCGTGGTTCAGGAAGTCGAAATCTTCGAAGAAACGCTTTGGAGTTTGGAAGGACTTTTGTGGTGATGCCTAAAGGAATTCACAAAGCTACTATAGTATGGTTACATGGCATTGGGGAGAAGGGTTCAAGCTGGACTCAAATCTTGGAAACTCTGCCACTTCCCAATATCAAATGGATCTGCCCGAGTGCGCCAATTCGTCAAGTAGCTCTATTTGGTGGATATCCCTGCACTGCTTGGTTTAATATGGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

250 aa · TkA01G070520|TK1151|PROTEIN

MSSNRGSGSRNLRRNALEFGRTFVVMPKGIHKATIVWLHGIGEKGSSWTQILETLPLPNIKWICPSAPIRQVALFGGYPCTAWFNMESMSEDACDDLEGLDASATHVANLLISEPDDVKVGVAGFSMGAAVALYSATCRALGQYGNGNRYPINLSAAVALSGWLPCSRNLRNRVGASQEAARRASSLPILLCHGKVDDVVEYKLGEKSAQTMYSSGFQSVAFRAYNGLGHYTSLEEINDVASWLIACLGA

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G070520
TK1151 IDTkA01G070520
OH-1004 IDLXL04_015570
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)70.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 98.800 / OH-1004 95.926
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G070520
位置Chr01:18029048-18032748 (-)
描述Similar to DDB_G0282005: Acyl-protein thioesterase 1 homolog 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g22300 羧酸酯酶。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0669500 在体外具有羧酸酯酶活性。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_015570 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002084 protein depalmitoylation 生物过程
GO:0006631 fatty acid metabolic process 生物过程
GO:0046464 acylglycerol catabolic process 生物过程
GO:1905344 prostaglandin catabolic process 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005795 Golgi stack 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0070062 extracellular exosome 细胞组分
GO:0004622 phosphatidylcholine lysophospholipase A1 activity 分子功能
GO:0008474 palmitoyl-(protein) hydrolase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
cnb:CNBF2260
ddi:DDB_G0282005
hsa:11313
mmu:26394
rno:83510
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.481
排名 1 · TkA01G070520 · TK1151
细胞质0.443
排名 2 · TkA01G070520 · TK1151
质体0.162
排名 3 · TkA01G070520 · TK1151
细胞膜0.051
排名 4 · TkA01G070520 · TK1151
内质网0.039
排名 5 · TkA01G070520 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02230Abhydrolase_222-246 aa
PF12146Hydrolase_431-58 aa
PF00561Abhydrolase_134-56 aa
PF12697Abhydrolase_635-172 aa
PF03959FSH179-212 aa
PF01738DLH107-230 aa
PF01764Lipase_3107-137 aa
PF12146Hydrolase_4111-136 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G070520PF02230Abhydrolase_2222468.9e-35121.2
TkA01G070520PF12146Hydrolase_431586.2e-0626.4
TkA01G070520PF00561Abhydrolase_134560.1712.2
TkA01G070520PF12697Abhydrolase_6351729.7e-0523.8
TkA01G070520PF03959FSH1792123e-0834.3
TkA01G070520PF01738DLH1072300.001319.1
TkA01G070520PF01764Lipase_31071370.06213.9
TkA01G070520PF12146Hydrolase_41111366.2e-0626.4
TkA01G070520PF03583LIP1151370.004817.0
TkA01G070520PF00326Peptidase_S91161370.0006120.1
TkA01G070520PF20434BD-FAE1161400.311.3
TkA01G070520PF00561Abhydrolase_11181340.1712.2
TkA01G070520PF00756Esterase1192100.1412.6
TkA01G070520PF00561Abhydrolase_11432360.1712.2
TkA01G070520PF12146Hydrolase_41772356.2e-0626.4
TkA01G070520PF00326Peptidase_S91782490.0006120.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8GYK2拟南芥sp|Q8GYK2|SOBRL_ARATH Probable carboxylesterase SOBER1-like28.800%Swiss-Prot低置信
Q0J969水稻sp|Q0J969|CAEH1_ORYSJ Probable carboxylesterase Os04g066950030.900%Swiss-Prot中等置信

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