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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G067160
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 17179995-17182839 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2431 bp · TkA01G067160|TK1151|cDNA

TACATAGTTACGCCTCCATTTATATATAAACCCACCACCTGACCCCCCCTTCCGACAATAACATATGCGTACGTCAACCATTCCCATTTTCCCTCTCCTTTTTGCCCTAAATTCACTAGGGTTTTCTCCATCTCTCATGATCCCTCATCAATTCTGTTGCATTCATCGTTTACACATCTATTGATTGTCTTATTATCTTTGATAGCTGTTGTTTTCTCCCTTTTTACTCTCATTAGAGAGTTTTTGCTGCTCGGATTTGC...

CDS

下载 CDS FASTA

1620 bp · TkA01G067160|TK1151|CDS

ATGCAGAAACTCGTCGCTTACAGTGGGGAAAACGTTGATTTTTCTCATGGGAAGTCAATGTACAAAAACCCAATGGAATCTGTTATATTCTCACCTCTCATCTACTCCATACCTTCCAAAAGATCCAGAATCCACGCCCCATTTCCATTCACTCACCAAATCTTCAAAAAACAAAAAACCACAATCGAAATCCTTCCAGACGAATGCCTATTTGAGATCTTCAAACGTCTGTACGGAACCCAAGAAAGAAGCTCATGTGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

539 aa · TkA01G067160|TK1151|PROTEIN

MQKLVAYSGENVDFSHGKSMYKNPMESVIFSPLIYSIPSKRSRIHAPFPFTHQIFKKQKTTIEILPDECLFEIFKRLYGTQERSSCASVSKHWLNLLSTIHSHEFTNSPTQTSNKSRFLQGKKATDVRLSAIAIGTNSQLGSLSINGNKVNGVTNFGLKAIANGCPSLKNLSLSNLSSISDEGIIEISKNCRNLEKIDFSQIPISNKSLISIAKNCPKLKSISVTNCPQVTDEGITTLLSSLTYSLMKLKLESLNISDMS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G067160
TK1151 IDTkA01G067160
OH-1004 IDLXL04_005314
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 88.497 / OH-1004 99.375
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G067160
位置Chr01:17179995-17182839 (-)
描述Similar to EBF1: EIN3-binding F-box protein 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g25490 SCF(EBF1)型E3泛素连接酶复合物的组分，可能介导靶蛋白（可能包括EIN3和EIL1）的泛素化及随后的蛋白酶体降解。
EIN3-dependent regulation of plant ethylene hormone signaling by two arabidopsis F box proteins: EBF1 and EBF2.2003 · DOI: 10.1016/s0092-8674(03)00968-1
At5g25350 SCF(EBF1)型E3泛素连接酶复合物的组分，可能介导靶蛋白（可能包括EIN3和EIL1）的泛素化及随后的蛋白酶体降解。
EIN3-dependent regulation of plant ethylene hormone signaling by two arabidopsis F box proteins: EBF1 and EBF2.2003 · DOI: 10.1016/s0092-8674(03)00968-1
At5g67250 SCF(ASK-cullin-F-box) E3 泛素连接酶复合物的组成部分，可能介导靶蛋白的泛素化和随后的蛋白酶体降解。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_005314 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006289 nucleotide-excision repair 生物过程
GO:0006511 ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程
GO:0009723 response to ethylene 生物过程
GO:0009873 ethylene-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010105 negative regulation of ethylene-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010225 response to UV-C 生物过程
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
GO:0031146 SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0019005 SCF ubiquitin ligase complex 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G25490
ath:AT4G15475
ath:AT5G25350
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.860
排名 1 · TkA01G067160 · TK1151
细胞质0.111
排名 2 · TkA01G067160 · TK1151
质体0.035
排名 3 · TkA01G067160 · TK1151
细胞膜0.031
排名 4 · TkA01G067160 · TK1151
线粒体0.018
排名 5 · TkA01G067160 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12937F-box-like63-98 aa
PF00646F-box63-100 aa
PF27089PRAME_C123-150 aa
PF25372LRR_FBXL15133-241 aa
PF27087LRR_TMOD-LMOD133-193 aa
PF00560LRR_1140-153 aa
PF12799LRR_4142-180 aa
PF23622LRR_At1g61320_AtMIF1148-244 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G067160PF12937F-box-like63982.9e-0627.7
TkA01G067160PF00646F-box631000.001119.5
TkA01G067160PF27089PRAME_C1231504.66.9
TkA01G067160PF25372LRR_FBXL151332415.8e-30104.9
TkA01G067160PF27087LRR_TMOD-LMOD1331930.004717.3
TkA01G067160PF00560LRR_11401533.88.8
TkA01G067160PF12799LRR_41421809.1e-0936.0
TkA01G067160PF23622LRR_At1g61320_AtMIF11482440.311.2
TkA01G067160PF11171DUF29581501830.0004621.2
TkA01G067160PF13516LRR_61511621.8e-0937.6
TkA01G067160PF29594LRR_SKP21553313.2e-1660.1
TkA01G067160PF24048LRR_NXF1-51572040.8210.0
TkA01G067160PF28505DUF1699_N1611730.002118.4
TkA01G067160PF24758LRR_At5g563701632280.0006220.2
TkA01G067160PF13516LRR_61651871.8e-0937.6
TkA01G067160PF12799LRR_41662049.1e-0936.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SKK0拟南芥sp|Q9SKK0|EBF1_ARATH EIN3-binding F-box protein 140.900%Swiss-Prot中等置信
Q708Y0拟南芥sp|Q708Y0|EBF2_ARATH EIN3-binding F-box protein 236.600%Swiss-Prot中等置信
Q9FE83拟南芥sp|Q9FE83|SKIP2_ARATH F-box protein SKIP222.300%Swiss-Prot低置信

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