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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G067010
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 17123861-17126738 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2791 bp · TkA01G067010|TK1151|cDNA

TTGAAAGTTGACACTAAACTGGTGACGTAAGACGTTCTTACTTCTTTGACCTCTGCACACACGAATTCACCTACTCACCTAGTATTCTTCTTCTTAATCTTTCCACCTGCAAATCGATACTTTCTCAATCTACATAAATTCTTCTTCTTCTTCTCTCTCTAGATTGACATCTTTATCTTTCTCTCTTTCTCTTTCATGGTGGAAAACCGCATATAAGCGAACACAGAGGTTTCTGTAATCTGTACACATGTTTCGCTTTT...

CDS

下载 CDS FASTA

2343 bp · TkA01G067010|TK1151|CDS

ATGCGAACATGGGGATTCTCGTGTTTCGTGATTACCTTTTGGATCTTTCTGTTCTTACCTCAAACATGCATATCAAGTGTTCGACAAAATGGCAAAGTGAGTCCGGGATTCGAAGCCTCACAAATGCGGTACATAGACAACAGCGGTTTGTTCCTGGTATCAAACTCATCGAATTTCGGATTCGGTTTCAATCCCAATAGTGACGTCACTTCATTCACTTTAGTCGTCATTCACATGACCAGTTCAACGATCATCTGGTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

780 aa · TkA01G067010|TK1151|PROTEIN

MRTWGFSCFVITFWIFLFLPQTCISSVRQNGKVSPGFEASQMRYIDNSGLFLVSNSSNFGFGFNPNSDVTSFTLVVIHMTSSTIIWSANRGSPVGISDTFLFDDDGNASLQKNGKVVWSTNTAKNGVSAMELRDSGNLVLVNNDGGVVWQSFSHPTNTLTSNQSFIKGMKLVSNVNNNLSFSLEIENNDLILSAEFKNPQPYWSIGKDKRKIINKNGGDTNSATIEGNSWRMYDENGTFLSQFVFADDSDANDSATWVAV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G067010
TK1151 IDTkA01G067010
OH-1004 IDLXL04_005317
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)96.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 96.310
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G067010
位置Chr01:17123861-17126738 (+)
描述Similar to SD25: G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SD2-5
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g32300 G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶SD2-5。 暂无已核实直接文献
At5g35370 G型凝集素S-受体类丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶At5g35370。 暂无已核实直接文献
At1g34300 G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g34300。 暂无已核实直接文献
At2g19130 G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At2g19130。 暂无已核实直接文献
At5g24080 G型凝集素S-受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶At5g24080。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_005317 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0048544 recognition of pollen 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005516 calmodulin binding 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0030246 carbohydrate binding 分子功能
GO:0031625 ubiquitin protein ligase binding 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G34300
ath:AT2G19130
ath:AT4G32300
ath:AT5G24080
ath:AT5G35370
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.807
排名 1 · TkA01G067010 · TK1151
内质网0.087
排名 2 · TkA01G067010 · TK1151
细胞质0.082
排名 3 · TkA01G067010 · TK1151
细胞外0.051
排名 4 · TkA01G067010 · TK1151
细胞核0.048
排名 5 · TkA01G067010 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01453B_lectin83-177 aa
PF01453B_lectin243-268 aa
PF01683EB281-315 aa
PF08276PAN_2286-305 aa
PF08277PAN_3349-386 aa
PF08276PAN_2349-371 aa
PF00024PAN_1355-390 aa
PF01683EB360-381 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G067010PF01453B_lectin831774.5e-1659.9
TkA01G067010PF01453B_lectin2432684.5e-1659.9
TkA01G067010PF01683EB2813150.001419.4
TkA01G067010PF08276PAN_22863050.02515.4
TkA01G067010PF08277PAN_33493868.5e-0523.0
TkA01G067010PF08276PAN_23493710.02515.4
TkA01G067010PF00024PAN_13553900.000321.3
TkA01G067010PF01683EB3603810.001419.4
TkA01G067010PF07714PK_Tyr_Ser-Thr4677281.7e-45156.0
TkA01G067010PF00069Pkinase4697262.4e-51175.4
TkA01G067010PF03109ABC14704940.0002820.9
TkA01G067010PF01636APH5126110.0215.4
TkA01G067010PF03109ABC15316160.0002820.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8RWZ5拟南芥sp|Q8RWZ5|SD25_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SD2-554.400%Swiss-Prot高置信
O65238拟南芥sp|O65238|Y5537_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At5g3537033.900%Swiss-Prot中等置信
Q9XID3拟南芥sp|Q9XID3|Y1343_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g3430036.000%Swiss-Prot中等置信
O64477拟南芥sp|O64477|Y2913_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g1913034.600%Swiss-Prot中等置信
Q9FLV4拟南芥sp|Q9FLV4|Y5248_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At5g2408055.700%Swiss-Prot低置信

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