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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G036490
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 9446659-9450855 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2244 bp · TkA01G036490|TK1151|cDNA

TACAACACGTTACCAAACGAGGACTCCTTTTCAATCTGATTCATTCATCCAGCTAATTCCCCTTTCTTCAGCCACAAAAATCGCCTCCCTGAAAAACGCCGGATCTGTTTGGTTCTCCAGCTAAACCATTTCCTCTACCACCGCCTCTCTCCTTCGCTCGATCTCTCATCCATCCAGACCGCTCTCACCATGACAACATCCATATCCACCGCTGCCACAAGAACCGCCCAACACTTCATGACCATCGACTACCCACCCCA...

CDS

下载 CDS FASTA

1092 bp · TkA01G036490|TK1151|CDS

ATGCACGTAGATCCAGGAATCTCGAAATTAATGAAGCGGAAGGAGCGCAAGAAGAAGGTCAAACCATCGGCGAAGAAGATAAAAAACGTAGCGAGAAGCTTCCGTACGTTCATGCCCGTGCTCGGCGAGGTCAAGCAACAAAGCCGTAGCTTAGCTGAACGAGCAAGAAGAGAGAAGATTAATGCTAGGATGAAACTCCTTCAAGAGCTGGTCCCTGGTTGTAACAAGATTTCAGGTACTGCCATGGTGCTTGATTTGGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

363 aa · TkA01G036490|TK1151|PROTEIN

MHVDPGISKLMKRKERKKKVKPSAKKIKNVARSFRTFMPVLGEVKQQSRSLAERARREKINARMKLLQELVPGCNKISGTAMVLDLVSCFKILSSLSLLQELKQQRQKKDDDMRKDIEAPKSFKKPEKTVTQESTKTVNSEVILPVKEEADINGPKSFKKWGGPFFNSICVMASYISSKWLGETPLIHAARQSHTSTAKYLFEHGANPTLASELGATALHHVAGTGMDFDLSCETHVMSTTLEFARGKVNITVGGATPLY...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G036490
TK1151 IDTkA01G036490
OH-1004 IDLXL04_014175
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)61.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 50.138 / OH-1004 49.899
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G036490
位置Chr01:9446659-9450855 (+)
描述Similar to Ank3: Ankyrin-3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g42300 转录因子bHLH48。 暂无已核实直接文献
At1g59640 参与花瓣大小的调控，通过干扰有丝分裂后细胞扩展来限制最终的花瓣细胞大小。 暂无已核实直接文献
At1g10120 参与细胞伸长的转录激活剂。
Multiple bHLH proteins form heterodimers to mediate CRY2-dependent regulation of flowering-time in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1371/journal.pgen.1003861

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os07g0193800 形成与RSS3和TIFY11A/JAZ9的三元复合物的转录因子，用于负向调控茉莉酸响应基因。 暂无已核实直接文献
Os03g0802900 可能调控茉莉酸调节基因的转录因子。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_014175 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000281 mitotic cytokinesis 生物过程
GO:0007009 plasma membrane organization 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0007528 neuromuscular junction development 生物过程
GO:0010628 positive regulation of gene expression 生物过程
GO:0010650 positive regulation of cell communication by electrical coupling 生物过程
GO:0010765 positive regulation of sodium ion transport 生物过程
GO:0010960 magnesium ion homeostasis 生物过程
GO:0030951 establishment or maintenance of microtubule cytoskeleton polarity 生物过程
GO:0032507 maintenance of protein location in cell 生物过程
GO:0034112 positive regulation of homotypic cell-cell adhesion 生物过程
GO:0043001 Golgi to plasma membrane protein transport 生物过程
KEGG 基因交叉引用
mmu:11735
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.848
排名 1 · TkA01G036490 · TK1151
细胞质0.213
排名 2 · TkA01G036490 · TK1151
线粒体0.037
排名 3 · TkA01G036490 · TK1151
细胞膜0.028
排名 4 · TkA01G036490 · TK1151
内质网0.014
排名 5 · TkA01G036490 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF30696RNF213_stalk19-143 aa
PF00010HLH46-74 aa
PF23173bHLH_SAC5153-85 aa
PF12796Ank_2181-223 aa
PF00023Ank182-210 aa
PF13606Ank_3182-208 aa
PF13857Ank_5182-221 aa
PF13637Ank_4187-230 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G036490PF30696RNF213_stalk191430.02113.6
TkA01G036490PF00010HLH46740.0002421.6
TkA01G036490PF23173bHLH_SAC5153850.002218.6
TkA01G036490PF12796Ank_21812234.2e-1556.8
TkA01G036490PF00023Ank1822104.4e-1349.4
TkA01G036490PF13606Ank_31822084.4e-1039.5
TkA01G036490PF13857Ank_51822215e-0937.1
TkA01G036490PF13637Ank_41872303.7e-1350.0
TkA01G036490PF00023Ank2152234.4e-1349.4
TkA01G036490PF13606Ank_32152244.4e-1039.5
TkA01G036490PF12796Ank_22543084.2e-1556.8
TkA01G036490PF13637Ank_42542753.7e-1350.0
TkA01G036490PF00023Ank2552854.4e-1349.4
TkA01G036490PF13606Ank_32552834.4e-1039.5
TkA01G036490PF13857Ank_52552955e-0937.1
TkA01G036490PF13637Ank_42693073.7e-1350.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8VZ02拟南芥sp|Q8VZ02|BH048_ARATH Transcription factor bHLH4863.600%Swiss-Prot低置信
Q0JXE7拟南芥sp|Q0JXE7|BPE_ARATH Transcription factor BPE76.300%Swiss-Prot低置信
Q6NKN9拟南芥sp|Q6NKN9|BH074_ARATH Transcription factor bHLH7476.300%Swiss-Prot低置信
Q69WS3水稻sp|Q69WS3|BH094_ORYSJ Transcription factor BHLH09476.300%Swiss-Prot低置信
Q84T08水稻sp|Q84T08|BH089_ORYSJ Transcription factor BHLH08976.300%Swiss-Prot低置信

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