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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G024000
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 6185775-6187339 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1161 bp · TkA01G024000|TK1151|cDNA

TGGGTTTCTTGATAGATAAACGAACATTTTGAGAAACTGTTCTCTCAATGGCCTTCCTCACTCATTTTCCCGTTGCTCCGATTCACCATCAGTCCTCTTCCCTCTTCACCAGATTCTTCCTTTCTCCCAAACCCAAAACCCTCTTAATATTCTCCTCACTTTCCCCACCTAACTTCTCTTCAACATCCACAATAATACCCTCTTCTTCTCTCGCAACTGTCGAAGAAATCTCACTTCCAGAAGAAACTCCCTTACAAATT...

CDS

下载 CDS FASTA

939 bp · TkA01G024000|TK1151|CDS

ATGGCCTTCCTCACTCATTTTCCCGTTGCTCCGATTCACCATCAGTCCTCTTCCCTCTTCACCAGATTCTTCCTTTCTCCCAAACCCAAAACCCTCTTAATATTCTCCTCACTTTCCCCACCTAACTTCTCTTCAACATCCACAATAATACCCTCTTCTTCTCTCGCAACTGTCGAAGAAATCTCACTTCCAGAAGAAACTCCCTTACAAATTGCCCGAGAAAAGCTTTTTATTCCTCCAGACACAGAAATATCGTCAGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

312 aa · TkA01G024000|TK1151|PROTEIN

MAFLTHFPVAPIHHQSSSLFTRFFLSPKPKTLLIFSSLSPPNFSSTSTIIPSSSLATVEEISLPEETPLQIAREKLFIPPDTEISSEKPPRILKGSNILVSKYARDAQIVSAEFVKSSVETEACPSDGSPEFALVGRSNVGKSSLLNSIVKRKKLALTSKKPGKTQCINHFRINDSWYLVDLPGYGYASAPHELKQDWNKFTKDYFLNRSTLVSVFLLIDASIPAKKIDLEYASWLGQNQVPMTLIFTKCDKRKKKKNGG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G024000
TK1151 IDTkA01G024000
OH-1004 IDLXL04_005678
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G024000
位置Chr01:6185775-6187339 (-)
描述Similar to EMB2001: GTP-binding protein At2g22870
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g22870 GTP结合蛋白 At2g22870。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_005678 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0005525 GTP binding 分子功能
GO:0046872 metal ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G22870
bfr:BF2048
bfs:BF9343_2016
bth:BT_1083
bvu:BVU_2968
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.606
排名 1 · TkA01G024000 · TK1151
线粒体0.378
排名 2 · TkA01G024000 · TK1151
细胞核0.050
排名 3 · TkA01G024000 · TK1151
细胞质0.034
排名 4 · TkA01G024000 · TK1151
细胞膜0.009
排名 5 · TkA01G024000 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF09439SRPRB129-228 aa
PF00009GTP_EFTU131-154 aa
PF01926MMR_HSR1132-249 aa
PF02421FeoB_N132-257 aa
PF03193RsgA_GTPase133-184 aa
PF00350Dynamin_N133-170 aa
PF00071Ras133-152 aa
PF08477Roc133-154 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G024000PF09439SRPRB1292280.02414.7
TkA01G024000PF00009GTP_EFTU1311540.003217.8
TkA01G024000PF01926MMR_HSR11322494.8e-1969.3
TkA01G024000PF02421FeoB_N1322572.7e-0627.7
TkA01G024000PF03193RsgA_GTPase1331842.6e-0524.9
TkA01G024000PF00350Dynamin_N1331700.0001622.5
TkA01G024000PF00071Ras1331520.07213.4
TkA01G024000PF08477Roc1331540.08413.8
TkA01G024000PF04548AIG11341590.0214.9
TkA01G024000PF00350Dynamin_N1772230.0001622.5
TkA01G024000PF08477Roc2032510.08413.8
TkA01G024000PF00009GTP_EFTU2143020.003217.8
TkA01G024000PF03193RsgA_GTPase2372972.6e-0524.9
TkA01G024000PF00071Ras2382570.07213.4
TkA01G024000PF00350Dynamin_N2412740.0001622.5
TkA01G024000PF04548AIG12412730.0214.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O81004拟南芥sp|O81004|Y2287_ARATH GTP-binding protein At2g2287053.500%Swiss-Prot高置信

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