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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G016460
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 4225783-4228554 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2007 bp · TkA01G016460|TK1151|cDNA

CCTACATCAACTCACCTGTCCTTTGTCTCACTCTTTACACCATTACACACCCAAGGGCAGTTTGGTAATTTTACAATCTACAACTTATTTCAGACACCATCCACATATCTCTCCCCACATGCTTTGACTCCAATCTTTGACACCGCGTAATGGGCAACTGCAACGGCGTCCCGGCTACCGCCAACGGCGGCGCCACCACCACCACCACCACCACCCACACCTCCAACTCAAACAACCCAACTACACCACAACCACAGCAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1590 bp · TkA01G016460|TK1151|CDS

ATGGGCAACTGCAACGGCGTCCCGGCTACCGCCAACGGCGGCGCCACCACCACCACCACCACCACCCACACCTCCAACTCAAACAACCCAACTACACCACAACCACAGCAACAATCTCCACCCAAGGGCCTCACGATCCTTCCCGCATCGGATCCAGCACCTCCTCGCCAACCGCCGCCGGCCAGCGTCGGCCGTGTCCTCGGCCGCCCACTGGAAGATGTTCGCGCAACCTACACAATGGGTCGAGAGCTAGGCCGCGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

529 aa · TkA01G016460|TK1151|PROTEIN

MGNCNGVPATANGGATTTTTTTHTSNSNNPTTPQPQQQSPPKGLTILPASDPAPPRQPPPASVGRVLGRPLEDVRATYTMGRELGRGQFGVTYLVTHKTTHQQFACKSIAMRKLVNKDDIEDVRREVQIMHHLTGHRNIVELKGAYEDRHSVNLIMELCAGGELFDRIIAKGHYSERAAAGLCRQMVTVVHNCHTMGVFHRDLKPENFLFLNTDEDSPLKATDFGLSVFFKPGDVFKDLVGSAYYVAPEVLRRRYGAEAD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G016460
TK1151 IDTkA01G016460
OH-1004 IDLXL04_005801
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G016460
位置Chr01:4225783-4228554 (+)
描述Similar to CPK1: Calcium-dependent protein kinase 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g23650 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。
CDPKs CPK6 and CPK3 function in ABA regulation of guard cell S-type anion- and Ca(2+)-permeable channels and stomatal closure.2006 · DOI: 10.1371/journal.pbio.0040327
At5g12180 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
At5g19360 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0622600 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
Os05g0585500 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_005801 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010119 regulation of stomatal movement 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0080092 regulation of pollen tube growth 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G23650
ath:AT5G12180
ath:AT5G19360
dosa:Os05g0585500
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.540
排名 1 · TkA01G016460 · TK1151
细胞质0.389
排名 2 · TkA01G016460 · TK1151
细胞核0.223
排名 3 · TkA01G016460 · TK1151
高尔基体0.063
排名 4 · TkA01G016460 · TK1151
内质网0.052
排名 5 · TkA01G016460 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase78-336 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr79-331 aa
PF14531Kinase-like79-138 aa
PF06293Kdo153-215 aa
PF14531Kinase-like174-321 aa
PF06293Kdo351-373 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr360-390 aa
PF14069SpoVIF361-380 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G016460PF00069Pkinase783362.6e-76257.2
TkA01G016460PF07714PK_Tyr_Ser-Thr793312.9e-2796.3
TkA01G016460PF14531Kinase-like791386.1e-0626.4
TkA01G016460PF06293Kdo1532150.007416.5
TkA01G016460PF14531Kinase-like1743216.1e-0626.4
TkA01G016460PF06293Kdo3513730.007416.5
TkA01G016460PF07714PK_Tyr_Ser-Thr3603902.9e-2796.3
TkA01G016460PF14069SpoVIF3613800.113.0
TkA01G016460PF17802SpaA3634070.1113.4
TkA01G016460PF13833EF-hand_83644051.3e-1970.4
TkA01G016460PF20742DUF5580_M3644420.02315.5
TkA01G016460PF21008AIF-13714431.9e-0628.9
TkA01G016460PF00069Pkinase3724242.6e-76257.2
TkA01G016460PF05823Gp-FAR-13744180.008917.2
TkA01G016460PF10591SPARC_Ca_bdg3754428.6e-0730.0
TkA01G016460PF12763EH3764472.3e-0834.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q42479拟南芥sp|Q42479|CDPK3_ARATH Calcium-dependent protein kinase 374.400%Swiss-Prot高置信
Q9FMP5拟南芥sp|Q9FMP5|CDPKH_ARATH Calcium-dependent protein kinase 1767.300%Swiss-Prot高置信
Q3E9C0拟南芥sp|Q3E9C0|CDPKY_ARATH Calcium-dependent protein kinase 3467.400%Swiss-Prot高置信
A2ZVI7水稻sp|A2ZVI7|CDPK1_ORYSJ Calcium-dependent protein kinase 183.400%Swiss-Prot高置信
Q6I587水稻sp|Q6I587|CDPKF_ORYSJ Calcium-dependent protein kinase 1577.300%Swiss-Prot高置信

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