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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_036480
当前版本: OH-1004 染色体: Chr08 坐标: 43035508-43038379 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1749 bp · LXL04_036480|LXL04_036480|OH1004|cDNA

ATGGCCGACCATTTATGGCTTCTAATTGTTCTCTTATCTCTTTGTGCTATCTCTGTCTTGGGAGACGTGTTTGTAAGCATCGATTGCGGGGCTTCACGTTCTTTCACAGATGAAAACTCGATAGTTTGGAAAGGAGACGAAGATTTGATATCAAATGGTGTTTCCCATGAAGTACAATCAAACTACTCGATATCTCCTGTTATGGACACCTTGAGGGTTTTCACCACCCGTAAAAAGAACTGCTATTCTATAGAAGCAGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1749 bp · LXL04_036480|LXL04_036480|OH1004|CDS

ATGGCCGACCATTTATGGCTTCTAATTGTTCTCTTATCTCTTTGTGCTATCTCTGTCTTGGGAGACGTGTTTGTAAGCATCGATTGCGGGGCTTCACGTTCTTTCACAGATGAAAACTCGATAGTTTGGAAAGGAGACGAAGATTTGATATCAAATGGTGTTTCCCATGAAGTACAATCAAACTACTCGATATCTCCTGTTATGGACACCTTGAGGGTTTTCACCACCCGTAAAAAGAACTGCTATTCTATAGAAGCAGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

582 aa · LXL04_036480|LXL04_036480|OH1004|PROTEIN

MADHLWLLIVLLSLCAISVLGDVFVSIDCGASRSFTDENSIVWKGDEDLISNGVSHEVQSNYSISPVMDTLRVFTTRKKNCYSIEAEKGGKVLVRASFNYGNYDQKSTPPIFDLHFDGNFWITVNTSEAKIYEAIYFVKMKVISVCVAQTRPGNFPFISSLEVRSVDSQVNRNVDTNYALFMNARFAYGTSETIRFPADAYDRIWNPALGNGLLNMKSEASVIDVDIPNNPPQEVLKHAIMAPNTSQMITLGLPIIDYPF...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_036480
TK1151 IDTkA04G042660
OH-1004 IDLXL04_036480
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_036480
位置Chr08:43035508-43038379 (-)
描述Similar to IOS1: LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase IOS1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g51800 负向调控脱落酸 (ABA) 信号通路。
An Arabidopsis (malectin-like) leucine-rich repeat receptor-like kinase contributes to downy mildew disease.2011 · DOI: 10.1111/j.1365-3040.2011.02390.x
The receptor kinase IMPAIRED OOMYCETE SUSCEPTIBILITY1 attenuates abscisic acid responses in Arabidopsis.2014 · DOI: 10.1104/pp.114.248518
The Arabidopsis Malectin-Like/LRR-RLK IOS1 Is Critical for BAK1-Dependent and BAK1-Independent Pattern-Triggered Immunity.2016 · DOI: 10.1105/tpc.16.00313
At2g19210 推定富含亮氨酸重复序列的受体样蛋白激酶 At2g19210。 暂无已核实直接文献
At2g19230 推定的富含亮氨酸重复序列的受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At2g19230。 暂无已核实直接文献
At1g05700 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶At1g05700。 暂无已核实直接文献
At2g19190 参与植物的先天免疫反应。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036480 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002229 defense response to oomycetes 生物过程
GO:0002237 response to molecule of bacterial origin 生物过程
GO:0002238 response to molecule of fungal origin 生物过程
GO:0002239 response to oomycetes 生物过程
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0009620 response to fungus 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009788 negative regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010200 response to chitin 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:1900150 regulation of defense response to fungus 生物过程
GO:1900426 positive regulation of defense response to bacterium 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G05700
ath:AT1G51800
ath:AT2G19190
ath:AT2G19210
ath:AT2G19230
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.741
排名 1 · LXL04_036480 · OH-1004
细胞外0.103
排名 2 · LXL04_036480 · OH-1004
细胞质0.082
排名 3 · LXL04_036480 · OH-1004
内质网0.082
排名 4 · LXL04_036480 · OH-1004
溶酶体／液泡0.042
排名 5 · LXL04_036480 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12819.14Malectin_like27-342 aa
PF13855.13LRR_8395-453 aa
PF13855.13LRR_8419-476 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_036480PF12819.14Malectin_like273424.3e-71240.6
LXL04_036480PF13855.13LRR_83954533.7e-0833.7
LXL04_036480PF13855.13LRR_84194763.7e-0833.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9C8I6拟南芥LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase IOS130.108%Swiss-Prot中等数据库同源证据
O65924拟南芥Putative leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At2g1921031.629%Swiss-Prot中等数据库同源证据
O64556拟南芥Putative leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g1923031.216%Swiss-Prot中等数据库同源证据
C0LGD6拟南芥Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g0570033.467%Swiss-Prot中等数据库同源证据
O64483拟南芥Senescence-induced receptor-like serine/threonine-protein kinase32.540%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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