LXL04_036168 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_036168

当前版本: OH-1004 染色体: Chr08 坐标: 37472387-37473120 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

498 bp · LXL04_036168|LXL04_036168|OH1004|cDNA

ATGCATTATGACCCCATGATTGCCAAGCTTGTAGTATGGGGAGAAGAAGGGGACACTGTAAGCATGCATTATGACCCCATGATTGCCAAGCTTGTAGTATGGGGAGAAAATAGTGCTTGTgatttaatcaaattaaatgattCCTTATCAAAGTTTCAGAAAGTTGGTCATGGAAGCAATGAAAATGGAgGGTATATACGGTGTTTTGGAAGGATGCCAGCTGTAAAAGCTTCATCATCTTCTACTGATCCAATAACAGT...

CDS

下载 CDS FASTA

498 bp · LXL04_036168|LXL04_036168|OH1004|CDS

ATGCATTATGACCCCATGATTGCCAAGCTTGTAGTATGGGGAGAAGAAGGGGACACTGTAAGCATGCATTATGACCCCATGATTGCCAAGCTTGTAGTATGGGGAGAAAATAGTGCTTGTGATTTAATCAAATTAAATGATTCCTTATCAAAGTTTCAGAAAGTTGGTCATGGAAGCAATGAAAATGGAGGGTATATACGGTGTTTTGGAAGGATGCCAGCTGTAAAAGCTTCATCATCTTCTACTGATCCAATAACAGT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

165 aa · LXL04_036168|LXL04_036168|OH1004|PROTEIN

MHYDPMIAKLVVWGEEGDTVSMHYDPMIAKLVVWGENSACDLIKLNDSLSKFQKVGHGSNENGGYIRCFGRMPAVKASSSSTDPITVGQMKILLGFLRSIINNLTPNPKLSAVFKSMNIQMPKTSTGSTSTVNQSSSSKSDQMQGKMTILPFLMFHLSYICYDRL

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_036168`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_036168

位置 Chr08:37472387-37473120 (+)

描述 Similar to MCCA: Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g03090`	生物素结合亚基的3-甲基戊二酰辅酶A羧化酶，一种催化3-甲基戊二酰辅酶A转化为3-甲基戊二酰谷氨酰辅酶A的酶，这是亮氨酸和异戊酸分解代谢的关键步骤。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os12g0605800`	生物素结合亚基的3-甲基戊二酰辅酶A羧化酶，一种催化3-甲基戊二酰辅酶A转化为3-甲基戊二酰谷氨酰辅酶A的酶，这是亮氨酸和异戊酸分解代谢的关键步骤。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036168 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006552 L-leucine catabolic process 生物过程

GO:0006768 biotin metabolic process 生物过程

GO:0009083 branched-chain amino acid catabolic process 生物过程

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005759 mitochondrial matrix 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0022626 cytosolic ribosome 细胞组分

GO:1905202 methylcrotonoyl-CoA carboxylase complex 细胞组分

GO:0004075 biotin carboxylase activity 分子功能

GO:0004485 methylcrotonoyl-CoA carboxylase activity 分子功能

GO:0005524 ATP binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G03090

dosa:Os12g0605800

hsa:56922

rno:294972

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.302

排名 1 · LXL04_036168 · OH-1004

细胞核0.223

排名 2 · LXL04_036168 · OH-1004

细胞膜0.207

排名 3 · LXL04_036168 · OH-1004

细胞外0.184

排名 4 · LXL04_036168 · OH-1004

内质网0.131

排名 5 · LXL04_036168 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02785.26Biotin_carb_C15-57 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_036168	`PF02785.26`	Biotin_carb_C	15	57	4.4e-12	46.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q42523`	拟南芥	Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial	66.667%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`Q2QMG2`	水稻	Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial	57.143%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据

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