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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_035902
当前版本: OH-1004 染色体: Chr08 坐标: 31692269-31693644 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

915 bp · LXL04_035902|LXL04_035902|OH1004|cDNA

ATGGCTTCCTCTAagttgatgatgaagatgtcTTCTCCCACTTCGAGAAATTCGGATCTCATCAGAAGAAAGTCCTCTAATTCCTCTTCGtcttccacctccaccaacCACCATCTTAATCACAATCACAAACACCTTGGATACAGAACCGACAACAATCCTGGCGTCCTTCAGATGACCGTTGACGGTCTTTTGCCAAGCGTGCACAATAACAACGAACGAAAACCTCCCGAAACGACTCTATTGGATGCAGAAATTTC...

CDS

下载 CDS FASTA

915 bp · LXL04_035902|LXL04_035902|OH1004|CDS

ATGGCTTCCTCTAAGTTGATGATGAAGATGTCTTCTCCCACTTCGAGAAATTCGGATCTCATCAGAAGAAAGTCCTCTAATTCCTCTTCGTCTTCCACCTCCACCAACCACCATCTTAATCACAATCACAAACACCTTGGATACAGAACCGACAACAATCCTGGCGTCCTTCAGATGACCGTTGACGGTCTTTTGCCAAGCGTGCACAATAACAACGAACGAAAACCTCCCGAAACGACTCTATTGGATGCAGAAATTTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

304 aa · LXL04_035902|LXL04_035902|OH1004|PROTEIN

MASSKLMMKMSSPTSRNSDLIRRKSSNSSSSSTSTNHHLNHNHKHLGYRTDNNPGVLQMTVDGLLPSVHNNNERKPPETTLLDAEISLLDAAGALTSIRDSETTGNVSREEIVRTSSNGSQKTVDDVWKEIVAGRSCKQEVPDEMMTLEDFLAKAGAVEEEDVKIAPSHLQTERLSGGIFSFENPIHPQNVDGVVGFGTGVDETGGRGKRRALLEPLDKAAQQRQRRMIKNRESAARSRERKQAYQAELESLAVKLEEEN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_035902
TK1151 IDTkA04G098040
OH-1004 IDLXL04_035902
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)84.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 52.632
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_035902
位置Chr08:31692269-31693644 (+)
描述Similar to GBF4: G-box-binding factor 4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g03970 结合rbcS-1A基因启动子的G盒基序（5′-CCACGTGG-3′）。
Isolation and characterization of a fourth Arabidopsis thaliana G-box-binding factor, which has similarities to Fos oncoprotein.1994 · DOI: 10.1073/pnas.91.7.2522
At2g36270 作为 ABA 生长抑制的主要介质，参与种子发育和随后的营养阶段 ABA 调节的基因表达。
A postgermination developmental arrest checkpoint is mediated by abscisic acid and requires the ABI5 transcription factor in Arabidopsis.2001 · DOI: 10.1073/pnas.081594298
Regulation of Arabidopsis thaliana Em genes: role of ABI5.2002 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2002.01295.x
The homologous ABI5 and EEL transcription factors function antagonistically to fine-tune gene expression during late embryogenesis.2002 · DOI: 10.1105/tpc.000869
Regulation and role of the Arabidopsis abscisic acid-insensitive 5 gene in abscisic acid, sugar, and stress response.2002 · DOI: 10.1104/pp.005793
ABI5 acts downstream of ABI3 to execute an ABA-dependent growth arrest during germination.2002 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2002.01430.x
Mitogen-activated protein kinase signaling in postgermination arrest of development by abscisic acid.2002 · DOI: 10.1073/pnas.242607499
Interactions of abscisic acid and sugar signalling in the regulation of leaf senescence.2004 · DOI: 10.1007/s00425-004-1279-5
Transcriptional regulation of ABI3- and ABA-responsive genes including RD29B and RD29A in seeds, germinating embryos, and seedlings of Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1007/s11103-005-2418-5
Monomerization of abscisic acid receptors through CARKs-mediated phosphorylation.2022 · DOI: 10.1111/nph.18149
At2g41070 结合胚胎特异元件和Dc3基因启动子的ABA响应元件（ABRE），以及Em1基因启动子的ABRE。 暂无已核实直接文献
At3g56850 结合到胚胎特异性元件和 Dc3 基因启动子的 ABA 响应元件 (ABRE)。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0867300 转录激活因子，在体外结合ABA响应元件（ABREs）。
The bZIP transcription factor OsABF1 is an ABA responsive element binding factor that enhances abiotic stress signaling in rice.2010 · DOI: 10.1007/s11103-009-9592-9
Phosphorylation of D-allose by hexokinase involved in regulation of OsABF1 expression for growth inhibition in Oryza sativa L.2013 · DOI: 10.1007/s00425-013-1853-9
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_035902 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009739 response to gibberellin 生物过程
GO:0009789 positive regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009845 seed germination 生物过程
GO:0010115 regulation of abscisic acid biosynthetic process 生物过程
GO:0010182 sugar mediated signaling pathway 生物过程
GO:0010187 negative regulation of seed germination 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G03970
ath:AT2G36270
ath:AT2G41070
ath:AT3G56850
dosa:Os01g0867300
osa:4325078
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.973
排名 1 · LXL04_035902 · OH-1004
细胞质0.093
排名 2 · LXL04_035902 · OH-1004
细胞膜0.026
排名 3 · LXL04_035902 · OH-1004
内质网0.014
排名 4 · LXL04_035902 · OH-1004
质体0.010
排名 5 · LXL04_035902 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00170.27bZIP_1221-276 aa
PF07716.21bZIP_2221-272 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_035902PF00170.27bZIP_12212763.4e-1143.8
LXL04_035902PF07716.21bZIP_22212729.2e-0935.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P42777拟南芥G-box-binding factor 454.315%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9SJN0拟南芥Protein ABSCISIC ACID-INSENSITIVE 543.103%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9C5Q2拟南芥ABSCISIC ACID-INSENSITIVE 5-like protein 336.181%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9LES3拟南芥ABSCISIC ACID-INSENSITIVE 5-like protein 230.909%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q0JHF1水稻bZIP transcription factor 1249.375%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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