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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_031421
当前版本: OH-1004 染色体: Chr07 坐标: 5737414-5739157 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

789 bp · LXL04_031421|LXL04_031421|OH1004|cDNA

ATGGTGGCTGACAAGGGTAAGAAACCCAAGGTAGCAGAGAAAATCGTAGAAGAAAACGCCGAGCAAATCGACGGCGAGCTTGTTCTGTCCATCGAAAAGTTGCAGGAGGTCCAAGACGAACTTGAAAAGATCAACGAGGAGGCAAGTGATAAAGTATTGGAAGTCGAACAGAAATACAATGAGGTTCGGAAGCCAGTATATGATAAACGAAGTGAAATCATcaaatcaattcctgatttctGGCTAACTGCTTTCTTGAG...

CDS

下载 CDS FASTA

789 bp · LXL04_031421|LXL04_031421|OH1004|CDS

ATGGTGGCTGACAAGGGTAAGAAACCCAAGGTAGCAGAGAAAATCGTAGAAGAAAACGCCGAGCAAATCGACGGCGAGCTTGTTCTGTCCATCGAAAAGTTGCAGGAGGTCCAAGACGAACTTGAAAAGATCAACGAGGAGGCAAGTGATAAAGTATTGGAAGTCGAACAGAAATACAATGAGGTTCGGAAGCCAGTATATGATAAACGAAGTGAAATCATCAAATCAATTCCTGATTTCTGGCTAACTGCTTTCTTGAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

262 aa · LXL04_031421|LXL04_031421|OH1004|PROTEIN

MVADKGKKPKVAEKIVEENAEQIDGELVLSIEKLQEVQDELEKINEEASDKVLEVEQKYNEVRKPVYDKRSEIIKSIPDFWLTAFLSHPVLSDLLSEEDQKIFKHLTSLEVEDCKDVKLGYSISFNFSPNPYFEDSKLTKTFTFLDEGTTKITATSIKWKEGMGIPNGVAHEKKGNKRAHEDDSFFSWFNGTQQKDDMEDIHDEVAEIIREDLWTNPLTYFNNDADEEELEGDEEENGSDESEEDGEEEEEEEEEEGDDE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_031421
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_031421
位置Chr07:5737414-5739157 (-)
描述Similar to NRP2: NAP1-related protein 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g18800 在核小体组装中充当组蛋白 H2A/H2B 伴侣，对于参与根增殖和模式形成的基因的正确表达发挥着关键作用。
Arabidopsis NRP1 and NRP2 encode histone chaperones and are required for maintaining postembryonic root growth.2006 · DOI: 10.1105/tpc.106.046490
Chromatin remodeling in Arabidopsis root growth.2007 · DOI: 10.4161/psb.2.3.3687
NAP1 family histone chaperones are required for somatic homologous recombination in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1105/tpc.112.096792
At1g74560 在核小体组装中充当组蛋白 H2A/H2B 伴侣，对于参与根增殖和模式形成的基因的正确表达发挥着关键作用。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0576700 在核小体组装中充当组蛋白 H2A/H2B 的伴侣蛋白。 暂无已核实直接文献
UniProt: B8AEC1 在核小体组装中充当组蛋白 H2A/H2B 的伴侣蛋白。 暂无已核实直接文献
Os04g0459700 在核小体组装中充当组蛋白 H2A/H2B 的伴侣蛋白。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031421 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000724 double-strand break repair via homologous recombination 生物过程
GO:0006334 nucleosome assembly 生物过程
GO:0016444 somatic cell DNA recombination 生物过程
GO:0000785 chromatin 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0003682 chromatin binding 分子功能
GO:0042393 histone binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G18800
ath:AT1G74560
dosa:Os02g0576700
dosa:Os04g0459700
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.614
排名 1 · LXL04_031421 · OH-1004
细胞核0.612
排名 2 · LXL04_031421 · OH-1004
线粒体0.049
排名 3 · LXL04_031421 · OH-1004
细胞膜0.041
排名 4 · LXL04_031421 · OH-1004
内质网0.040
排名 5 · LXL04_031421 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00956.24NAP31-75 aa
PF00956.24NAP75-221 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_031421PF00956.24NAP31751.5e-32113.6
LXL04_031421PF00956.24NAP752211.5e-32113.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8LC68拟南芥NAP1-related protein 274.554%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9CA59拟南芥NAP1-related protein 175.771%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q69JW2水稻NAP1-related protein 268.018%Swiss-Prot强数据库同源证据
B8AEC1水稻NAP1-related protein 268.018%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q7X7C9水稻NAP1-related protein 161.991%Swiss-Prot强数据库同源证据

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