基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_031421 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr07:5737414-5739157 (-) |
| 描述 | Similar to NRP2: NAP1-related protein 2 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_031421 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g18800 |
在核小体组装中充当组蛋白 H2A/H2B 伴侣,对于参与根增殖和模式形成的基因的正确表达发挥着关键作用。 | |
At1g74560 |
在核小体组装中充当组蛋白 H2A/H2B 伴侣,对于参与根增殖和模式形成的基因的正确表达发挥着关键作用。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os02g0576700 |
在核小体组装中充当组蛋白 H2A/H2B 的伴侣蛋白。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: B8AEC1 |
在核小体组装中充当组蛋白 H2A/H2B 的伴侣蛋白。 | 暂无已核实直接文献 |
Os04g0459700 |
在核小体组装中充当组蛋白 H2A/H2B 的伴侣蛋白。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0000724 | double-strand break repair via homologous recombination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.554; 覆盖度=85.496; E 值=2.71e-117; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006334 | nucleosome assembly | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.554; 覆盖度=85.496; E 值=2.71e-117; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016444 | somatic cell DNA recombination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.554; 覆盖度=85.496; E 值=2.71e-117; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000785 | chromatin | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.554; 覆盖度=85.496; E 值=2.71e-117; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.554; 覆盖度=85.496; E 值=2.71e-117; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.554; 覆盖度=85.496; E 值=2.71e-117; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.554; 覆盖度=85.496; E 值=2.71e-117; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003682 | chromatin binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.554; 覆盖度=85.496; E 值=2.71e-117; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042393 | histone binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.554; 覆盖度=85.496; E 值=2.71e-117; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G18800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.554; 覆盖度=85.496; E 值=2.71e-117 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G74560 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=75.771; 覆盖度=86.641; E 值=6.6e-113 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os02g0576700 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=68.018; 覆盖度=84.733; E 值=1.89e-103 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os04g0459700 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=61.991; 覆盖度=84.351; E 值=6.99e-96 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |