基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_030037
当前版本: OH-1004
染色体: Chr06
坐标: 106235839-106239864
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA3336 bp · LXL04_030037|LXL04_030037|OH1004|cDNA
ATGGCTGCCACATCATCTGCAAGGTGGACCGATGGTCTCCGATTCTCATCGTTGTTTTGGCCTCCCCCTCTAGATACACATCAGCGCAAGGCACAAATTACCGCATATGTCGACTACTTTGGTAAATTTACATCAGAGCAATTTCCTGAAGATATAGCCGAGCTGGTTCGCCACCGCTACCCCTCACAGGAAAAACGCTTGTTCGATGATGTCTTAGCAACATTTGTCCTCCATCATCCAGAACACGGGCACAATGTCAT...
CDS
下载 CDS FASTA3336 bp · LXL04_030037|LXL04_030037|OH1004|CDS
ATGGCTGCCACATCATCTGCAAGGTGGACCGATGGTCTCCGATTCTCATCGTTGTTTTGGCCTCCCCCTCTAGATACACATCAGCGCAAGGCACAAATTACCGCATATGTCGACTACTTTGGTAAATTTACATCAGAGCAATTTCCTGAAGATATAGCCGAGCTGGTTCGCCACCGCTACCCCTCACAGGAAAAACGCTTGTTCGATGATGTCTTAGCAACATTTGTCCTCCATCATCCAGAACACGGGCACAATGTCAT...
1111 aa · LXL04_030037|LXL04_030037|OH1004|PROTEIN
MAATSSARWTDGLRFSSLFWPPPLDTHQRKAQITAYVDYFGKFTSEQFPEDIAELVRHRYPSQEKRLFDDVLATFVLHHPEHGHNVILPIISCIIDGTIEYNKSTPPFASFISLVCPTNDNEYSEQWALACGEILRILTHYNRPIFKAEHDRKRSGSQASTSNSDTGKTETGTGTERTTQNEVKPLRPLSPWITDILLAAPLGIRSDYFRWCGGVMGKYAGGELKPPSVMAATSRGSGKHPQLIPSTPRWAVANGAGVIL...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_030037 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_030037 | ||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr06:106235839-106239864 (+) | ||||||||||||
| 描述 | Similar to GI: Protein GIGANTEA | ||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| ||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程 GO:0006950 response to stress 生物过程 GO:0007623 circadian rhythm 生物过程 GO:0009409 response to cold 生物过程 GO:0009585 red, far-red light phototransduction 生物过程 GO:0009637 response to blue light 生物过程 GO:0009908 flower development 生物过程 GO:0010218 response to far red light 生物过程 GO:0010378 temperature compensation of the circadian clock 生物过程 GO:0030154 cell differentiation 生物过程 GO:0042542 response to hydrogen peroxide 生物过程 GO:0042752 regulation of circadian rhythm 生物过程 | ||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G22770 dosa:Os01g0182600 osa:4325329 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞核0.457
细胞质0.426
细胞膜0.084
高尔基体0.081
内质网0.072
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF30924.1GIGANTEA_N5-408 aaPF30921.1GIGANTEA_M465-774 aaPF28518.1GIGANTEA_C824-1108 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_030037 | PF30924.1 | GIGANTEA_N | 5 | 408 | 5.2e-237 | 787.0 |
| LXL04_030037 | PF30921.1 | GIGANTEA_M | 465 | 774 | 1.8e-159 | 531.3 |
| LXL04_030037 | PF28518.1 | GIGANTEA_C | 824 | 1108 | 2.9e-147 | 490.1 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。