基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_029722
当前版本: OH-1004
染色体: Chr06
坐标: 98478106-98480334
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1425 bp · LXL04_029722|LXL04_029722|OH1004|cDNA
ATGGCTCATTGGCCCAAGTGTTTGCTACTAGTAAGTTTGCTTGTGATGCACTTCTCTGACGCAAGCAGGCTTAGTACTTCATTTAATAAATTTGTGTCCGGTTCATCTGATGATCTGCCACAAGGGAATAGCACAAGGTGGGCAGTTCTTGTAGCTGGGTCAAGCACATACGATAATTATCGCCATCAGGCAAATGTTTGTCACGCCTATCAAATTCTAAAACGTGGTGGGTTGAAGGACgaaaacataattgtattcat...
CDS
下载 CDS FASTA1425 bp · LXL04_029722|LXL04_029722|OH1004|CDS
ATGGCTCATTGGCCCAAGTGTTTGCTACTAGTAAGTTTGCTTGTGATGCACTTCTCTGACGCAAGCAGGCTTAGTACTTCATTTAATAAATTTGTGTCCGGTTCATCTGATGATCTGCCACAAGGGAATAGCACAAGGTGGGCAGTTCTTGTAGCTGGGTCAAGCACATACGATAATTATCGCCATCAGGCAAATGTTTGTCACGCCTATCAAATTCTAAAACGTGGTGGGTTGAAGGACGAAAACATAATTGTATTCAT...
474 aa · LXL04_029722|LXL04_029722|OH1004|PROTEIN
MAHWPKCLLLVSLLVMHFSDASRLSTSFNKFVSGSSDDLPQGNSTRWAVLVAGSSTYDNYRHQANVCHAYQILKRGGLKDENIIVFMYDDIANDPNNPRPGTIINSPNGSDVYAGVPKDYTGDNVNAKNFYAVLLGNTSGVTGGSGKVLASKPNDKIFVYYTDHGGPGTLGMPNMPYIFANDFIQVLKTKHASGTYDEMVIYLEACDSGSIIQGLLPEDLNIYVTTSTDTDELGWATYCPGMNPPPPPEFHTCLGDLFSV...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_029722 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_029722 | ||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr06:98478106-98480334 (+) | ||||||||||||
| 描述 | Similar to Vacuolar-processing enzyme | ||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| ||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006624 vacuolar protein processing 生物过程 GO:0051603 proteolysis involved in protein catabolic process 生物过程 GO:0000326 protein storage vacuole 细胞组分 GO:0005773 vacuole 细胞组分 GO:0004175 endopeptidase activity 分子功能 GO:0004197 cysteine-type endopeptidase activity 分子功能 | ||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G62710 dosa:Os02g0644000 gmx:547964 osa:4330133 rcu:8272115 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
溶酶体／液泡0.583
细胞外0.229
细胞质0.171
内质网0.121
细胞膜0.102
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF01650.24Peptidase_C1346-317 aaPF20985.3Legum_prodom367-457 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_029722 | PF01650.24 | Peptidase_C13 | 46 | 317 | 1.5e-111 | 372.8 |
| LXL04_029722 | PF20985.3 | Legum_prodom | 367 | 457 | 1.5e-34 | 118.9 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。