基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_029722 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr06:98478106-98480334 (+) |
| 描述 | Similar to Vacuolar-processing enzyme (Ricinus communis OX%3D3988) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_029722 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 6 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g62710 |
天冬酰胺特异性内肽酶,参与将液泡种子蛋白前体加工为成熟形式(相似性预测)。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os02g0644000 |
天冬酰胺内肽酶,可能作为 REP1 的激活剂。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006624 | vacuolar protein processing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=59.06; 覆盖度=94.304; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051603 | proteolysis involved in protein catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.641; 覆盖度=92.194; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000326 | protein storage vacuole | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=59.641; 覆盖度=94.093; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005773 | vacuole | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=59.06; 覆盖度=94.304; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:GOC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004175 | endopeptidase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=59.06; 覆盖度=94.304; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004197 | cysteine-type endopeptidase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.641; 覆盖度=92.194; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G62710 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=59.641; 覆盖度=94.093; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os02g0644000 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=59.06; 覆盖度=94.304; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | gmx:547964 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=58.444; 覆盖度=94.937; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:4330133 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=59.06; 覆盖度=94.304; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | rcu:8272115 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.641; 覆盖度=92.194; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |