基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_029452
当前版本: OH-1004
染色体: Chr06
坐标: 90926799-90930812
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1464 bp · LXL04_029452|LXL04_029452|OH1004|cDNA
ATGTGGGTGGTGATAATGTCCGAGAGCTTTGCTTTCCTCTGTAATTTGGGTGTGATGGGGAAGACAAAGACGGGATCTGTTCTTGGATGCATAGGAAAGCTTGTTAATGGCGTTTTGAGCTTTTTTGTGTTTTCTGTACTCGATGTTCTTGATATTTTGTTGTGTTATGTGTACAAGATTATTGATTTTTTCATGGAAGATGAATGGAAGCCATGTTACTGTTCTTCACCGAAACAAACGATTATCAGTAGTGGTAACAT...
CDS
下载 CDS FASTA1464 bp · LXL04_029452|LXL04_029452|OH1004|CDS
ATGTGGGTGGTGATAATGTCCGAGAGCTTTGCTTTCCTCTGTAATTTGGGTGTGATGGGGAAGACAAAGACGGGATCTGTTCTTGGATGCATAGGAAAGCTTGTTAATGGCGTTTTGAGCTTTTTTGTGTTTTCTGTACTCGATGTTCTTGATATTTTGTTGTGTTATGTGTACAAGATTATTGATTTTTTCATGGAAGATGAATGGAAGCCATGTTACTGTTCTTCACCGAAACAAACGATTATCAGTAGTGGTAACAT...
487 aa · LXL04_029452|LXL04_029452|OH1004|PROTEIN
MWVVIMSESFAFLCNLGVMGKTKTGSVLGCIGKLVNGVLSFFVFSVLDVLDILLCYVYKIIDFFMEDEWKPCYCSSPKQTIISSGNILVSEKGEAEKILCLTSTKLHLEEISDTLYSRSSLAVEVSKTTVKRRNVVTSVNKAATVQSPFMVNTTIVEMLQEKIGGRHKPHRFPRWSDCDCDTCNSWSNSCKDTLFVHIGGRKDNVSENVLFIHGFISSSAFWTETLFPNFSKSIKSKYRLFAIDLLGFGKSPKPHDSLYT...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_029452 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_029452 |
|---|---|
| 位置 | Chr06:90926799-90930812 (+) |
| 描述 | Similar to BDG1: Probable lysophospholipase BODYGUARD 1 |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程 GO:0009688 abscisic acid biosynthetic process 生物过程 GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程 GO:0010115 regulation of abscisic acid biosynthetic process 生物过程 GO:0010143 cutin biosynthetic process 生物过程 GO:0010148 transpiration 生物过程 GO:0010224 response to UV-B 生物过程 GO:0010345 suberin biosynthetic process 生物过程 GO:0048527 lateral root development 生物过程 GO:0050832 defense response to fungus 生物过程 GO:0071555 cell wall organization 生物过程 GO:1901959 positive regulation of cutin biosynthetic process 生物过程 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G64670 ath:AT4G24140 ath:AT5G17720 ath:AT5G17780 ath:AT5G41900 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
内质网0.302
高尔基体0.174
细胞膜0.155
细胞核0.154
细胞质0.139
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF12146.16Hydrolase_4206-462 aaPF00561.27Abhydrolase_1209-465 aaPF12697.14Abhydrolase_6209-474 aaPF10230.16LIDHydrolase230-458 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_029452 | PF12146.16 | Hydrolase_4 | 206 | 462 | 1.7e-12 | 47.9 |
| LXL04_029452 | PF00561.27 | Abhydrolase_1 | 209 | 465 | 2.6e-29 | 103.3 |
| LXL04_029452 | PF12697.14 | Abhydrolase_6 | 209 | 474 | 6e-15 | 57.2 |
| LXL04_029452 | PF10230.16 | LIDHydrolase | 230 | 458 | 3e-06 | 27.9 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q8LFX7 | 拟南芥 | Probable lysophospholipase BODYGUARD 1 | 56.652% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
O22977 | 拟南芥 | Probable lysophospholipase BODYGUARD 3 | 53.924% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q9FJ24 | 拟南芥 | Probable lysophospholipase BODYGUARD 2 | 53.975% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q9FN79 | 拟南芥 | Probable lysophospholipase BODYGUARD 5 | 37.500% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q700D5 | 拟南芥 | Probable lysophospholipase BODYGUARD 4 | 37.744% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |