基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_029248
当前版本: OH-1004
染色体: Chr06
坐标: 84810349-84815373
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1833 bp · LXL04_029248|LXL04_029248|OH1004|cDNA
ATGATGAAGAGTGCTTACCGGAAAATGGATGAAGGCTGCCGGAAAAATAAGCTGCAACTCGCCGGAAAGAAGAGGAAGCAACAGCCGGCTGTAAACCTTTGGCCGGTCGCCGGAATCACAGAAAACGGAAGAGAAGAGGGCTGCCGGAGTGAAGAAGCGGGAGTCGCCGGAAACAGGAGGAAGAAAGCCGGATGTCGCCTAGAGTTTGGCTGGAGTGCTCGATCGAATGAAGTGGGAGGAAAGGAGGTAGTAGGGTTTGT...
CDS
下载 CDS FASTA1833 bp · LXL04_029248|LXL04_029248|OH1004|CDS
ATGATGAAGAGTGCTTACCGGAAAATGGATGAAGGCTGCCGGAAAAATAAGCTGCAACTCGCCGGAAAGAAGAGGAAGCAACAGCCGGCTGTAAACCTTTGGCCGGTCGCCGGAATCACAGAAAACGGAAGAGAAGAGGGCTGCCGGAGTGAAGAAGCGGGAGTCGCCGGAAACAGGAGGAAGAAAGCCGGATGTCGCCTAGAGTTTGGCTGGAGTGCTCGATCGAATGAAGTGGGAGGAAAGGAGGTAGTAGGGTTTGT...
610 aa · LXL04_029248|LXL04_029248|OH1004|PROTEIN
MMKSAYRKMDEGCRKNKLQLAGKKRKQQPAVNLWPVAGITENGREEGCRSEEAGVAGNRRKKAGCRLEFGWSARSNEVGGKEVVGFVSFNSCRTEKSVKERKKNGIRECLTPIVTRACYHSLLPILQGEIMVRLPFLAGRRVVSEWKRTLKYRKKGVKFQHRKIQLGEIKSATDNFNNNNIIGQGGFGKVYKGALSTSKGQIRVAFKRLDHYYGQGDPEFLKEIIMLSGFTHKNLISLLGFCDEDGEKILVYDGTMALCY...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_029248 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_029248 | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr06:84810349-84815373 (-) | ||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to At5g39000: Putative receptor-like protein kinase At5g39000 | ||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | ||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0010038 response to metal ion 生物过程 GO:0005576 extracellular region 细胞组分 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 GO:0009536 plastid 细胞组分 GO:0016324 apical plasma membrane 细胞组分 GO:0090404 pollen tube tip 细胞组分 GO:0004672 protein kinase activity 分子功能 GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能 GO:0004714 transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity 分子功能 GO:0005524 ATP binding 分子功能 GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能 | ||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT5G28680 ath:AT5G38990 ath:AT5G39000 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞质0.473
细胞核0.296
细胞膜0.287
内质网0.070
线粒体0.064
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00069.32Pkinase177-252 aaPF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr179-252 aaPF00069.32Pkinase257-419 aaPF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr268-421 aaPF00069.32Pkinase516-598 aaPF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr518-599 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_029248 | PF00069.32 | Pkinase | 177 | 252 | 3.3e-45 | 155.3 |
| LXL04_029248 | PF07714.24 | PK_Tyr_Ser-Thr | 179 | 252 | 6.1e-48 | 164.1 |
| LXL04_029248 | PF00069.32 | Pkinase | 257 | 419 | 3.3e-45 | 155.3 |
| LXL04_029248 | PF07714.24 | PK_Tyr_Ser-Thr | 268 | 421 | 6.1e-48 | 164.1 |
| LXL04_029248 | PF00069.32 | Pkinase | 516 | 598 | 3.3e-45 | 155.3 |
| LXL04_029248 | PF07714.24 | PK_Tyr_Ser-Thr | 518 | 599 | 6.1e-48 | 164.1 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9FID8 | 拟南芥 | Putative receptor-like protein kinase At5g39000 | 42.574% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q3E8W4 | 拟南芥 | Receptor-like protein kinase ANXUR2 | 44.079% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q9FID9 | 拟南芥 | Probable receptor-like protein kinase At5g38990 | 42.244% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q9SR05 | 拟南芥 | Receptor-like protein kinase ANXUR1 | 42.951% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q9SCZ4 | 拟南芥 | Receptor-like protein kinase FERONIA | 42.000% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |