LXL04_026864 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_026864

当前版本: OH-1004 染色体: Chr06 坐标: 4112121-4115774 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1362 bp · LXL04_026864|LXL04_026864|OH1004|cDNA

ATGAATAGCAAGGAGAGTAGTAAAGACATTCAATTTCTACCTGCCCTCCTTCATTACCAAAAGAACAACAAGAAGTCAAGAACAGCCATCACTCATCACTCATCAGCCATGGCAACTTCCTTAAAGGTGGCGGTCATCGGCGCCGGTGTTTCCGGACTAGTCGCCGCCCGTGAGCTTCAACGAGAATCCCACCAAGTCATCGTATTTGAAAAATCCCACCAAATCGGCGGAACATGGGTCTACGATCCACGATTCGAGTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1362 bp · LXL04_026864|LXL04_026864|OH1004|CDS

ATGAATAGCAAGGAGAGTAGTAAAGACATTCAATTTCTACCTGCCCTCCTTCATTACCAAAAGAACAACAAGAAGTCAAGAACAGCCATCACTCATCACTCATCAGCCATGGCAACTTCCTTAAAGGTGGCGGTCATCGGCGCCGGTGTTTCCGGACTAGTCGCCGCCCGTGAGCTTCAACGAGAATCCCACCAAGTCATCGTATTTGAAAAATCCCACCAAATCGGCGGAACATGGGTCTACGATCCACGATTCGAGTC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

453 aa · LXL04_026864|LXL04_026864|OH1004|PROTEIN

MNSKESSKDIQFLPALLHYQKNNKKSRTAITHHSSAMATSLKVAVIGAGVSGLVAARELQRESHQVIVFEKSHQIGGTWVYDPRFESDLLGLDPNREIIHGSLYKSLRTNLPRQLMSFTDFDFSEKRYGDERLFPGHEEVLRFLEDFAGCFELTELIRFNTTVTRVEVVDSEVVEFEVESVANGRSTVEVFDAVVICTGHNSEPRPATDIPGIENWSKKQMHSHNYRVPGPFQDQIVVIIGNGPSALDLSRDIATVAKEV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_026864`
TK1151 ID	TkA07G012380
OH-1004 ID	LXL04_026864
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	98.800
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 92.053 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_026864

位置 Chr06:4112121-4115774 (-)

描述 Similar to FMOGS-OX5: Flavin-containing monooxygenase FMO GS-OX5

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g12140`	催化甲硫基烷基葡萄糖硫苷转化为甲磺酰烷基葡萄糖硫苷。	暂无已核实直接文献
`At1g62560`	催化任意链长的甲硫基烷基硫代葡萄糖苷转化为甲亚磺酰基烷基硫代葡萄糖苷。	暂无已核实直接文献
`At1g65860`	催化甲硫基烷基葡萄糖硫苷转化为甲磺酰烷基葡萄糖硫苷。	暂无已核实直接文献
`At1g62620`	催化任意链长的甲硫基烷基硫代葡萄糖苷转化为甲亚磺酰基烷基硫代葡萄糖苷。	暂无已核实直接文献
`At1g63370`	催化任意链长的甲硫基烷基硫代葡萄糖苷转化为甲亚磺酰基烷基硫代葡萄糖苷。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026864 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0019761 glucosinolate biosynthetic process 生物过程

GO:0033506 glucosinolate biosynthetic process from homomethionine 生物过程

GO:0046620 regulation of organ growth 生物过程

GO:0046885 regulation of hormone biosynthetic process 生物过程

GO:0048444 floral organ morphogenesis 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0016020 membrane 细胞组分

GO:0004497 monooxygenase activity 分子功能

GO:0004499 N,N-dimethylaniline monooxygenase activity 分子功能

GO:0050660 flavin adenine dinucleotide binding 分子功能

GO:0050661 NADP binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G12140

ath:AT1G62560

ath:AT1G62620

ath:AT1G63370

ath:AT1G65860

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.746

排名 1 · LXL04_026864 · OH-1004

细胞核0.363

排名 2 · LXL04_026864 · OH-1004

线粒体0.054

排名 3 · LXL04_026864 · OH-1004

内质网0.048

排名 4 · LXL04_026864 · OH-1004

过氧化物酶体0.045

排名 5 · LXL04_026864 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01946.24Thi441-79 aa

PF00743.26FMO-like42-268 aa

PF07992.21Pyr_redox_242-325 aa

PF01266.31DAO42-78 aa

PF03486.21HI0933_like42-206 aa

PF00890.31FAD_binding_243-80 aa

PF13454.13NAD_binding_944-200 aa

PF13450.13NAD_binding_845-79 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_026864	`PF01946.24`	Thi4	41	79	9.4e-07	29.0
LXL04_026864	`PF00743.26`	FMO-like	42	268	1.4e-54	186.2
LXL04_026864	`PF07992.21`	Pyr_redox_2	42	325	6.6e-19	69.1
LXL04_026864	`PF01266.31`	DAO	42	78	7.9e-11	42.8
LXL04_026864	`PF03486.21`	HI0933_like	42	206	1.1e-07	32.4
LXL04_026864	`PF00890.31`	FAD_binding_2	43	80	2e-06	28.0
LXL04_026864	`PF13454.13`	NAD_binding_9	44	200	4e-08	34.1
LXL04_026864	`PF13450.13`	NAD_binding_8	45	79	6.5e-10	39.9
LXL04_026864	`PF01593.31`	Amino_oxidase	50	78	2e-09	38.0
LXL04_026864	`PF13738.13`	Pyr_redox_3	133	331	8e-17	62.2
LXL04_026864	`PF13434.13`	Lys_Orn_oxgnase	152	279	2.4e-08	34.2
LXL04_026864	`PF00743.26`	FMO-like	292	411	1.4e-54	186.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`A8MRX0`	拟南芥	Flavin-containing monooxygenase FMO GS-OX5	52.020%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q9SXE1`	拟南芥	Flavin-containing monooxygenase FMO GS-OX3	48.522%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q9SS04`	拟南芥	Flavin-containing monooxygenase FMO GS-OX1	49.364%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q9SXD5`	拟南芥	Flavin-containing monooxygenase FMO GS-OX-like 3	48.092%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q9C8U0`	拟南芥	Flavin-containing monooxygenase FMO GS-OX-like 5	47.837%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据

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