基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_023820
当前版本: OH-1004
染色体: Chr05
坐标: 69844636-69845960
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA390 bp · LXL04_023820|LXL04_023820|OH1004|cDNA
ATGGCCTTCTTTCAGGTTCGAATTCCGGAACAGTTGATGGCGGCTTTCCCGATTCGGTTTAAAGAGGATTCAGATCTGGTTATCGCGAACGCCTTCTTTCAGGAGCTCGTGGACATCGGAAGTTCATTGAAGTGTGCTAGAGCACCGGCGTGCTACTGGTCACCGATTCCACCGGCAGAGTTGAGAGGAGAATCTACTCGTCTCATTTGCTTTAATCAGTTAGATCTTCCTGAATACTCAACAAAAGAACAACTTCAAGA...
CDS
下载 CDS FASTA390 bp · LXL04_023820|LXL04_023820|OH1004|CDS
ATGGCCTTCTTTCAGGTTCGAATTCCGGAACAGTTGATGGCGGCTTTCCCGATTCGGTTTAAAGAGGATTCAGATCTGGTTATCGCGAACGCCTTCTTTCAGGAGCTCGTGGACATCGGAAGTTCATTGAAGTGTGCTAGAGCACCGGCGTGCTACTGGTCACCGATTCCACCGGCAGAGTTGAGAGGAGAATCTACTCGTCTCATTTGCTTTAATCAGTTAGATCTTCCTGAATACTCAACAAAAGAACAACTTCAAGA...
129 aa · LXL04_023820|LXL04_023820|OH1004|PROTEIN
MAFFQVRIPEQLMAAFPIRFKEDSDLVIANAFFQELVDIGSSLKCARAPACYWSPIPPAELRGESTRLICFNQLDLPEYSTKEQLQELIACNFFKTLISYVDVTASTNRADIFDPALMRRKIEFPHQQI
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_023820 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_023820 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr05:69844636-69845960 (+) | |||||||||
| 描述 | Similar to ARPC2B: Actin-related protein 2/3 complex subunit 2B | |||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | |||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0007015 actin filament organization 生物过程 GO:0010090 trichome morphogenesis 生物过程 GO:0030041 actin filament polymerization 生物过程 GO:0034314 Arp2/3 complex-mediated actin nucleation 生物过程 GO:0005737 cytoplasm 细胞组分 GO:0005885 Arp2/3 protein complex 细胞组分 GO:0042995 cell projection 细胞组分 GO:0005200 structural constituent of cytoskeleton 分子功能 GO:0051015 actin filament binding 分子功能 | |||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G30825 ath:AT2G33385 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞核0.349
细胞质0.319
线粒体0.156
质体0.120
细胞外0.061
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
没有找到该查询的结果。
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。