序列比对 BLAST
选择 OH-1004 或 TK1151 两套参考版本,并在 gDNA、CDS、蛋白库中运行 BLAST。15 bp 引物级短序列会自动启用 blastn-short 参数;输入原始基因 ID、TK1151 ID 或 OH-1004 ID 时,会按所选参考版本解析到对应代表序列。
数据库状态
| 数据库 | 程序 | 用途 | 索引 |
|---|---|---|---|
| OH-1004 全基因组 | blastn | 适合引物、启动子、基因组片段定位;结果链接到 OH-1004 基因或 JBrowse 区间。 | 已构建 |
| OH-1004 CDS | blastn | 适合把核酸序列或基因 ID 解析到 OH-1004 代表 CDS 后比对。 | 已构建 |
| OH-1004 蛋白 | blastp | 适合氨基酸序列或基因 ID 转为 OH-1004 代表蛋白后搜索。 | 已构建 |
| TK1151 全基因组 | blastn | 适合引物、启动子、基因组片段定位到 TK1151 参考基因组。 | 已构建 |
| TK1151 CDS | blastn | 适合把核酸序列或基因 ID 解析到 TK1151 代表 CDS 后比对。 | 已构建 |
| TK1151 蛋白 | blastp | 适合氨基酸序列或基因 ID 转为 TK1151 代表蛋白后搜索。 | 已构建 |