同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00420

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 15

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00420

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00420 ChrUn 7029240-7331559 Chr09 24535122-25011084 mixed High 15 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00420`	ChrUn:7029240-7331559	Chr09:24535122-25011084	mixed	15	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 15 · 当前范围 1–15 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkAUNG026230 → LXL04_037893

99.6%

TkAUNG026240 → LXL04_037894

95.9%

TkAUNG026470 → LXL04_037896

99.5%

TkAUNG026480 → LXL04_037897

97.9%

TkAUNG026490 → LXL04_037898

96.0%

TkAUNG026520 → LXL04_037899

100.0%

TkAUNG026770 → LXL04_037893

100.0%

TkAUNG026780 → LXL04_037894

99.9%

TkAUNG026930 → LXL04_037896

100.0%

TkAUNG026980 → LXL04_037897

100.0%

TkAUNG026990 → LXL04_037898

99.5%

TkAUNG027090 → LXL04_037899

100.0%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkAUNG026230`	`LXL04_037893`	`JCVI_TKOH_00420`	99.6	100.0 / 100.0	Complex
`TkAUNG026240`	`LXL04_037894`	`JCVI_TKOH_00420`	95.9	96.228 / 95.468	Complex
`TkAUNG026470`	`LXL04_037896`	`JCVI_TKOH_00420`	99.5	89.083 / 99.029	Complex
`TkAUNG026480`	`LXL04_037897`	`JCVI_TKOH_00420`	97.9	87.5 / 76.923	Complex
`TkAUNG026490`	`LXL04_037898`	`JCVI_TKOH_00420`	96.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkAUNG026520`	`LXL04_037899`	`JCVI_TKOH_00420`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkAUNG026770`	`LXL04_037893`	`JCVI_TKOH_00420`	100.0	100.0 / 58.495	待复核
`TkAUNG026780`	`LXL04_037894`	`JCVI_TKOH_00420`	99.9	96.131 / 95.468	Complex
`TkAUNG026930`	`LXL04_037896`	`JCVI_TKOH_00420`	100.0	90.351 / 100.0	Complex
`TkAUNG026980`	`LXL04_037897`	`JCVI_TKOH_00420`	100.0	87.5 / 76.923	Complex
`TkAUNG026990`	`LXL04_037898`	`JCVI_TKOH_00420`	99.5	100.0 / 100.0	Complex
`TkAUNG027090`	`LXL04_037899`	`JCVI_TKOH_00420`	100.0	91.667 / 52.574	待复核
`TkAUNG027400`	`LXL04_037904`	`JCVI_TKOH_00420`	98.6	100.0 / 100.0	待复核
`TkAUNG027410`	`LXL04_037905`	`JCVI_TKOH_00420`	55.1	100.0 / 100.0	待复核
`TkAUNG027420`	`LXL04_037908`	`JCVI_TKOH_00420`	68.2	85.088 / 24.103	Complex