同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

证据边界:TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料,本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照,不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点,后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块
427
ID 对照记录
84884
高置信区块
302
中置信区块
125
参考材料组装基因数gap 数端粒扫描
TK1151 TK1151_GWHBCHF00000000 45224 1917 0/9
OH-1004 OH1004_GCA_047496595.1 40057 131 0/711

查询解析

输入 ID
JCVI_TKOH_00412
解析类型
区块 ID
ID 对照 + 共线性联合证据
解析到的基因
无
未能直接匹配到橡胶草基因目录
关联结果
0 / 1 / 7
对照 / 区块 / 锚点
最佳区块: JCVI_TKOH_00412

当前输入已解析为共线性区块 ID,下面优先展示区块范围和锚点基因。

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00412 ChrUn 15323458-15509332 Chr06 44473427-44547630 - Medium 7 anchors
ChrUn 15323458-15509332 Chr06 44473427-44547630 JCVI_TKOH_00412 · 7 gene pairs TkAUNG053620 | LXL04_028530 | 99.1% | RBH_high_identity_coverage_local_synteny_minor_chr_pair | Probable TkAUNG053630 | LXL04_028529 | 100.0% | RBH_high_identity_coverage_local_synteny_minor_chr_pair | Probable TkAUNG053660 | LXL04_028528 | 99.5% | RBH_below_probable_coverage_or_synteny_threshold | Review TkAUNG053680 | LXL04_028527 | 98.7% | RBH_high_identity_coverage_local_synteny_minor_chr_pair | Probable TkAUNG053700 | LXL04_028526 | 99.0% | multi_source_to_OH1004 | Complex TkAUNG053760 | LXL04_028525 | 98.5% | multi_source_to_OH1004 | Complex TkAUNG054410 | LXL04_028524 | 87.0% | RBH_below_probable_coverage_or_synteny_threshold | Review
High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点
锚点表按页展示,TSV 下载包含当前查询的全部锚点;上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块查询位置目标位置方向当前映射锚点数置信等级备注
JCVI_TKOH_00412 ChrUn:15323458-15509332 Chr06:44473427-44547630 - 7 中等置信 Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 7 · 当前范围 1–7 · 页码 1/1

TkAUNG053620 → LXL04_028530
99.1%
TkAUNG053630 → LXL04_028529
100.0%
TkAUNG053660 → LXL04_028528
99.5%
TkAUNG053680 → LXL04_028527
98.7%
TkAUNG053700 → LXL04_028526
99.0%
TkAUNG053760 → LXL04_028525
98.5%
TkAUNG054410 → LXL04_028524
87.0%
TK1151 基因OH-1004 基因区块一致性覆盖度置信等级
TkAUNG053620LXL04_028530JCVI_TKOH_0041299.1100.0 / 100.0Probable
TkAUNG053630LXL04_028529JCVI_TKOH_00412100.0100.0 / 100.0Probable
TkAUNG053660LXL04_028528JCVI_TKOH_0041299.596.955 / 67.372待复核
TkAUNG053680LXL04_028527JCVI_TKOH_0041298.7100.0 / 100.0Probable
TkAUNG053700LXL04_028526JCVI_TKOH_0041299.0100.0 / 100.0Complex
TkAUNG053760LXL04_028525JCVI_TKOH_0041298.580.247 / 87.248Complex
TkAUNG054410LXL04_028524JCVI_TKOH_0041287.098.592 / 61.783待复核