同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00386

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 12

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00386

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00386 ChrUn 15728126-15972009 Chr02 153182445-153477712 mixed High 12 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00386`	ChrUn:15728126-15972009	Chr02:153182445-153477712	mixed	12	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 12 · 当前范围 1–12 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkAUNG055180 → LXL04_010779

85.8%

TkAUNG055190 → LXL04_010781

100.0%

TkAUNG055470 → LXL04_010787

40.2%

TkAUNG055580 → LXL04_010787

40.2%

TkAUNG055590 → LXL04_010785

99.7%

TkAUNG055600 → LXL04_010786

98.9%

TkAUNG055810 → LXL04_010778

88.0%

TkAUNG055820 → LXL04_010778

94.0%

TkAUNG055940 → LXL04_010779

92.0%

TkAUNG056030 → LXL04_010779

85.8%

TkAUNG056040 → LXL04_010781

100.0%

TkAUNG056050 → LXL04_010781

54.4%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkAUNG055180`	`LXL04_010779`	`JCVI_TKOH_00386`	85.8	99.692 / 87.535	Complex
`TkAUNG055190`	`LXL04_010781`	`JCVI_TKOH_00386`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkAUNG055470`	`LXL04_010787`	`JCVI_TKOH_00386`	40.2	96.581 / 70.115	Complex
`TkAUNG055580`	`LXL04_010787`	`JCVI_TKOH_00386`	40.2	96.581 / 70.115	Complex
`TkAUNG055590`	`LXL04_010785`	`JCVI_TKOH_00386`	99.7	100.0 / 100.0	Probable
`TkAUNG055600`	`LXL04_010786`	`JCVI_TKOH_00386`	98.9	100.0 / 100.0	Probable
`TkAUNG055810`	`LXL04_010778`	`JCVI_TKOH_00386`	88.0	100.0 / 20.571	Complex
`TkAUNG055820`	`LXL04_010778`	`JCVI_TKOH_00386`	94.0	100.0 / 73.72	Probable
`TkAUNG055940`	`LXL04_010779`	`JCVI_TKOH_00386`	92.0	100.0 / 42.798	Complex
`TkAUNG056030`	`LXL04_010779`	`JCVI_TKOH_00386`	85.8	99.692 / 87.535	Complex
`TkAUNG056040`	`LXL04_010781`	`JCVI_TKOH_00386`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkAUNG056050`	`LXL04_010781`	`JCVI_TKOH_00386`	54.4	95.763 / 86.508	Complex