同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00262

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 18

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00262

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00262 Chr06 3347441-3561369 Chr05 124691295-124872509 + High 18 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00262`	Chr06:3347441-3561369	Chr05:124691295-124872509	+	18	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 18 · 当前范围 1–18 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA06G012820 → LXL04_026303

79.6%

TkA06G013030 → LXL04_026304

100.0%

TkA06G013070 → LXL04_026307

99.8%

TkA06G013160 → LXL04_026309

100.0%

TkA06G013170 → LXL04_026310

99.2%

TkA06G013190 → LXL04_026311

73.7%

TkA06G013350 → LXL04_026313

68.4%

TkA06G013360 → LXL04_026314

100.0%

TkA06G013400 → LXL04_026315

100.0%

TkA06G013410 → LXL04_026316

100.0%

TkA06G013500 → LXL04_026319

100.0%

TkA06G013510 → LXL04_026320

100.0%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA06G012820`	`LXL04_026303`	`JCVI_TKOH_00262`	79.6	74.638 / 23.043	Complex
`TkA06G013030`	`LXL04_026304`	`JCVI_TKOH_00262`	100.0	97.902 / 69.652	Complex
`TkA06G013070`	`LXL04_026307`	`JCVI_TKOH_00262`	99.8	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G013160`	`LXL04_026309`	`JCVI_TKOH_00262`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G013170`	`LXL04_026310`	`JCVI_TKOH_00262`	99.2	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G013190`	`LXL04_026311`	`JCVI_TKOH_00262`	73.7	99.492 / 30.687	Complex
`TkA06G013350`	`LXL04_026313`	`JCVI_TKOH_00262`	68.4	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G013360`	`LXL04_026314`	`JCVI_TKOH_00262`	100.0	100.0 / 100.0	待复核
`TkA06G013400`	`LXL04_026315`	`JCVI_TKOH_00262`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G013410`	`LXL04_026316`	`JCVI_TKOH_00262`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G013500`	`LXL04_026319`	`JCVI_TKOH_00262`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G013510`	`LXL04_026320`	`JCVI_TKOH_00262`	100.0	97.068 / 71.981	Complex
`TkA06G013520`	`LXL04_026321`	`JCVI_TKOH_00262`	100.0	79.227 / 61.423	Complex
`TkA06G013530`	`LXL04_026321`	`JCVI_TKOH_00262`	98.3	88.889 / 32.959	待复核
`TkA06G013540`	`LXL04_026322`	`JCVI_TKOH_00262`	99.7	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G013570`	`LXL04_026324`	`JCVI_TKOH_00262`	100.0	92.822 / 100.0	待复核
`TkA06G013580`	`LXL04_026325`	`JCVI_TKOH_00262`	97.4	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G013590`	`LXL04_026326`	`JCVI_TKOH_00262`	100.0	100.0 / 100.0	待复核