同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00025

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 26

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00025

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00025 Chr01 99646652-101237344 Chr01 64795346-66120904 mixed High 26 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00025`	Chr01:99646652-101237344	Chr01:64795346-66120904	mixed	26	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 26 · 当前范围 1–26 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA01G399330 → LXL04_003055

84.8%

TkA01G400230 → LXL04_003055

93.1%

TkA01G400290 → LXL04_003054

99.2%

TkA01G400570 → LXL04_003051

100.0%

TkA01G400580 → LXL04_003050

100.0%

TkA01G400990 → LXL04_003045

97.2%

TkA01G401000 → LXL04_003044

95.5%

TkA01G401760 → LXL04_003041

99.2%

TkA01G401900 → LXL04_003038

99.8%

TkA01G402270 → LXL04_003037

99.6%

TkA01G402300 → LXL04_003037

95.0%

TkA01G402800 → LXL04_003034

98.0%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA01G399330`	`LXL04_003055`	`JCVI_TKOH_00025`	84.8	100.0 / 54.152	Complex
`TkA01G400230`	`LXL04_003055`	`JCVI_TKOH_00025`	93.1	100.0 / 100.0	Complex
`TkA01G400290`	`LXL04_003054`	`JCVI_TKOH_00025`	99.2	99.578 / 91.829	Strict
`TkA01G400570`	`LXL04_003051`	`JCVI_TKOH_00025`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G400580`	`LXL04_003050`	`JCVI_TKOH_00025`	100.0	100.0 / 100.0	待复核
`TkA01G400990`	`LXL04_003045`	`JCVI_TKOH_00025`	97.2	84.118 / 100.0	Strict
`TkA01G401000`	`LXL04_003044`	`JCVI_TKOH_00025`	95.5	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G401760`	`LXL04_003041`	`JCVI_TKOH_00025`	99.2	93.893 / 83.673	Strict
`TkA01G401900`	`LXL04_003038`	`JCVI_TKOH_00025`	99.8	93.256 / 100.0	Complex
`TkA01G402270`	`LXL04_003037`	`JCVI_TKOH_00025`	99.6	98.28 / 33.236	待复核
`TkA01G402300`	`LXL04_003037`	`JCVI_TKOH_00025`	95.0	76.339 / 24.0	Complex
`TkA01G402800`	`LXL04_003034`	`JCVI_TKOH_00025`	98.0	98.579 / 69.987	待复核
`TkA01G402810`	`LXL04_003033`	`JCVI_TKOH_00025`	99.3	99.608 / 98.579	Strict
`TkA01G402820`	`LXL04_003031`	`JCVI_TKOH_00025`	97.9	100.0 / 100.0	Complex
`TkA01G402850`	`LXL04_003030`	`JCVI_TKOH_00025`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G402900`	`LXL04_003027`	`JCVI_TKOH_00025`	96.9	100.0 / 100.0	Complex
`TkA01G403130`	`LXL04_003025`	`JCVI_TKOH_00025`	99.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA01G403270`	`LXL04_003021`	`JCVI_TKOH_00025`	81.7	100.0 / 93.674	Complex
`TkA01G403380`	`LXL04_003020`	`JCVI_TKOH_00025`	99.3	99.82 / 99.82	Strict
`TkA01G403600`	`LXL04_003018`	`JCVI_TKOH_00025`	96.6	100.0 / 97.101	Complex
`TkA01G403630`	`LXL04_003017`	`JCVI_TKOH_00025`	98.7	100.0 / 100.0	待复核
`TkA01G404170`	`LXL04_003017`	`JCVI_TKOH_00025`	97.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA01G404570`	`LXL04_003013`	`JCVI_TKOH_00025`	99.1	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G404600`	`LXL04_003012`	`JCVI_TKOH_00025`	99.7	35.644 / 24.978	待复核
`TkA01G404920`	`LXL04_003009`	`JCVI_TKOH_00025`	99.4	100.0 / 100.0	待复核
`TkA01G405390`	`LXL04_003009`	`JCVI_TKOH_00025`	99.4	100.0 / 100.0	待复核