同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

证据边界:TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料,本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照,不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点,后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块
427
ID 对照记录
84884
高置信区块
302
中置信区块
125
参考材料组装基因数gap 数端粒扫描
TK1151 TK1151_GWHBCHF00000000 45224 1917 0/9
OH-1004 OH1004_GCA_047496595.1 40057 131 0/711

查询解析

输入 ID
JCVI_TKOH_00358
解析类型
区块 ID
ID 对照 + 共线性联合证据
解析到的基因
无
未能直接匹配到橡胶草基因目录
关联结果
0 / 1 / 7
对照 / 区块 / 锚点
最佳区块: JCVI_TKOH_00358

当前输入已解析为共线性区块 ID,下面优先展示区块范围和锚点基因。

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00358 Chr08 95731338-98812693 Chr07 91641781-92836268 mixed Medium 7 anchors
Chr08 95731338-98812693 Chr07 91641781-92836268 JCVI_TKOH_00358 · 7 gene pairs TkA08G382540 | LXL04_034220 | 98.1% | RBH_high_identity_coverage_synteny | Strict TkA08G382600 | LXL04_034223 | 91.5% | RBH_sequence_supported | Probable TkA08G384860 | LXL04_034226 | 94.6% | RBH_below_probable_coverage_or_synteny_threshold | Review TkA08G384910 | LXL04_034227 | 99.7% | sequence_supported_annotation_or_model_conflict | Review TkA08G384930 | LXL04_034229 | 89.0% | multi_source_to_OH1004 | Complex TkA08G385030 | LXL04_034232 | 98.3% | multi_source_to_OH1004 | Complex TkA08G386210 | LXL04_034236 | 99.4% | multi_source_to_OH1004 | Complex
High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点
锚点表按页展示,TSV 下载包含当前查询的全部锚点;上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块查询位置目标位置方向当前映射锚点数置信等级备注
JCVI_TKOH_00358 Chr08:95731338-98812693 Chr07:91641781-92836268 mixed 7 中等置信 Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 7 · 当前范围 1–7 · 页码 1/1

TkA08G382540 → LXL04_034220
98.1%
TkA08G382600 → LXL04_034223
91.5%
TkA08G384860 → LXL04_034226
94.6%
TkA08G384910 → LXL04_034227
99.7%
TkA08G384930 → LXL04_034229
89.0%
TkA08G385030 → LXL04_034232
98.3%
TkA08G386210 → LXL04_034236
99.4%
TK1151 基因OH-1004 基因区块一致性覆盖度置信等级
TkA08G382540LXL04_034220JCVI_TKOH_0035898.197.086 / 93.662Strict
TkA08G382600LXL04_034223JCVI_TKOH_0035891.5100.0 / 91.509Probable
TkA08G384860LXL04_034226JCVI_TKOH_0035894.6100.0 / 43.691待复核
TkA08G384910LXL04_034227JCVI_TKOH_0035899.7100.0 / 100.0待复核
TkA08G384930LXL04_034229JCVI_TKOH_0035889.0100.0 / 100.0Complex
TkA08G385030LXL04_034232JCVI_TKOH_0035898.3100.0 / 100.0Complex
TkA08G386210LXL04_034236JCVI_TKOH_0035899.4100.0 / 100.0Complex