同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00278

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 23

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00278

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00278 Chr06 70066517-75471968 Chr05 54506959-61423499 mixed High 23 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00278`	Chr06:70066517-75471968	Chr05:54506959-61423499	mixed	23	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 23 · 当前范围 1–23 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA06G276650 → LXL04_023594

84.2%

TkA06G276870 → LXL04_023595

100.0%

TkA06G277270 → LXL04_023595

100.0%

TkA06G277370 → LXL04_023596

60.4%

TkA06G277850 → LXL04_023597

100.0%

TkA06G280300 → LXL04_023609

81.5%

TkA06G282430 → LXL04_023610

95.2%

TkA06G282500 → LXL04_023611

83.6%

TkA06G284510 → LXL04_023615

94.6%

TkA06G286320 → LXL04_023619

100.0%

TkA06G286460 → LXL04_023620

100.0%

TkA06G286750 → LXL04_023623

95.1%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA06G276650`	`LXL04_023594`	`JCVI_TKOH_00278`	84.2	98.958 / 66.946	待复核
`TkA06G276870`	`LXL04_023595`	`JCVI_TKOH_00278`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G277270`	`LXL04_023595`	`JCVI_TKOH_00278`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G277370`	`LXL04_023596`	`JCVI_TKOH_00278`	60.4	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G277850`	`LXL04_023597`	`JCVI_TKOH_00278`	100.0	87.037 / 87.578	Strict
`TkA06G280300`	`LXL04_023609`	`JCVI_TKOH_00278`	81.5	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G282430`	`LXL04_023610`	`JCVI_TKOH_00278`	95.2	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G282500`	`LXL04_023611`	`JCVI_TKOH_00278`	83.6	100.0 / 87.5	Complex
`TkA06G284510`	`LXL04_023615`	`JCVI_TKOH_00278`	94.6	100.0 / 100.0	Probable
`TkA06G286320`	`LXL04_023619`	`JCVI_TKOH_00278`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G286460`	`LXL04_023620`	`JCVI_TKOH_00278`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA06G286750`	`LXL04_023623`	`JCVI_TKOH_00278`	95.1	98.204 / 30.654	待复核
`TkA06G286760`	`LXL04_023623`	`JCVI_TKOH_00278`	79.1	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G288900`	`LXL04_023625`	`JCVI_TKOH_00278`	95.5	93.22 / 62.5	Complex
`TkA06G289610`	`LXL04_023627`	`JCVI_TKOH_00278`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA06G295120`	`LXL04_023654`	`JCVI_TKOH_00278`	100.0	93.458 / 86.957	待复核
`TkA06G295150`	`LXL04_023651`	`JCVI_TKOH_00278`	99.5	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G296620`	`LXL04_023649`	`JCVI_TKOH_00278`	100.0	100.0 / 41.221	待复核
`TkA06G296630`	`LXL04_023650`	`JCVI_TKOH_00278`	75.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G297010`	`LXL04_023651`	`JCVI_TKOH_00278`	99.5	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G297040`	`LXL04_023654`	`JCVI_TKOH_00278`	100.0	93.458 / 86.957	待复核
`TkA06G297640`	`LXL04_023655`	`JCVI_TKOH_00278`	100.0	100.0 / 100.0	待复核
`TkA06G299260`	`LXL04_023663`	`JCVI_TKOH_00278`	100.0	100.0 / 100.0	待复核